5-formyl-4-oxo-2-pivaloylamino-7-[(2,3,5-tri-O-benzoyl)-β-D-ribofuranosyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 吡咯并嘧啶核苷和核苷酸
• 英文名称: 5-formyl-4-oxo-2-pivaloylamino-7-[(2,3,5-tri-O-benzoyl)-β-D-ribofuranosyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine
• 英文别名: 2′,3′,5′-tri-O-benzoyl-2-N-pivaloyl-7-formyl-7-deazaguanosine；[(2R,3R,4R,5R)-3,4-dibenzoyloxy-5-[2-(2,2-dimethylpropanoylamino)-5-formyl-4-oxo-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]oxolan-2-yl]methyl benzoate
• 化学式: C₃₈H₃₄N₄O₁₀
• 分子量: 706.709
• InChiKey: ABNPJHTZDDINIB-DWCTZGTLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.8
• 重原子数：
  52
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  181
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-formyl-4-oxo-2-pivaloylamino-7-[(2,3,5-tri-O-benzoyl)-β-D-ribofuranosyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine 在 sodium tetrahydroborate 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 苯 为溶剂， 反应 52.0h， 生成 epoxyqueuosine
  参考文献：
  名称：

  超修饰 tRNA 核苷 Epoxyqueuosine 的全合成

  摘要：

  Queuosine 是几乎所有物种的转移 RNA (tRNA) 中发现的最强烈修饰的核苷之一。Queuosine 仅存在于几种 tRNA 的反密码子环的 wooble 位置，在那里它参与 tRNAAsp、tRNAAsn、tRNAHis 和 tRNATyr。queuosine 的生物合成是由原核生物进行的，而真核生物则完全依赖于这种外部来源。为了研究 Q 碱基的有趣生物合成，我们在此报告了直接生物合成前体 oQ 的首次全合成。通过将 LC-MS 与特殊的大肠杆菌生长条件（培养基中不含维生素 B12）结合使用，我们确认了 oQ 天然产物的结构。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201300586
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-4-氯吡咯并[2,3-d]嘧啶 在 吡啶 、 三乙烯二胺 、 tris-(dibenzylideneacetone)dipalladium(0) 、 N-碘代丁二酰亚胺 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三正丁基氢锡 、 cesium acetate 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 20.0~55.0 ℃ 、350.01 kPa 条件下， 反应 99.17h， 生成 5-formyl-4-oxo-2-pivaloylamino-7-[(2,3,5-tri-O-benzoyl)-β-D-ribofuranosyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine
  参考文献：
  名称：

  半乳糖基奎宁的合成和超修饰的Q-核苷在小鼠组织中的分布。

  摘要：

  Queuosine（Q）是一种高度修饰的RNA核苷，存在于tRNA His，tRNA Asn，tRNA Tyr和tRNA Asp中。它位于tRNA反密码子环的摆动位置，在这里它可以与位于相应mRNA密码子各自位置的U以及C碱基相互作用。在tRNA Tyr和tRNA Asp中在包括人类在内的高等真核生物中，由于未知的原因，分别通过添加半乳糖和甘露糖糖进一步修饰了Q碱基。尚不清楚这种额外修饰的原因，以及如何通过Q的形成和插入来协调糖的修饰。在这里，我们报告了高度修饰的核苷半乳糖基奎宁（galQ）的总合成。该化合物的可用性使我们能够研究新生和成年小鼠的六个不同器官以及人胞质tRNA中Q族核苷的绝对水平。现在，我们的合成为Q-核苷家族的生物学功能的更详细分析铺平了道路。

  DOI：

  10.1002/anie.202002295

文献信息

• Efficient Synthesis of Deazaguanosine-Derived tRNA Nucleosides PreQ0, PreQ1, and Archaeosine Using the Turbo-Grignard Method
  作者：Tobias Brückl、Ines Thoma、Andreas J. Wagner、Paul Knochel、Thomas Carell

  DOI：10.1002/ejoc.201000987

  日期：2010.12

  The natural products PreQ 1 , PreQ 0 , and archaeosine are deazaguanosine-derived natural products of immense biological importance. All three are critical components of tRNAs and, as such, are involved in decoding genetic information. We were able to consolidate and shorten the syntheses of all three compounds by using a novel Turbo-Grignard-based approach. The reported iodine/magnesium exchange followed

  天然产物 PreQ 1 、PreQ 0 和古菌素是具有巨大生物学重要性的脱氮鸟苷衍生的天然产物。这三个都是 tRNA 的关键组成部分，因此，都参与解码遗传信息。通过使用基于 Turbo-Grignard 的新型方法，我们能够巩固和缩短所有三种化合物的合成。报道的碘/镁交换以及与脱氮鸟苷骨架的格氏反应显示出对重要官能团（如酯和酰胺）的高度耐受性。
• Synthesis of the Transfer-RNA Nucleoside Queuosine by Using a Chiral Allyl Azide Intermediate
  作者：Florian Klepper、Eva-Maria Jahn、Volker Hickmann、Thomas Carell

  DOI：10.1002/anie.200604579

  日期：2007.3.19
• Synthesis of Galactosyl‐Queuosine and Distribution of Hypermodified Q‐Nucleosides in Mouse Tissues
  作者：Peter Thumbs、Timm T. Ensfelder、Markus Hillmeier、Mirko Wagner、Matthias Heiss、Constanze Scheel、Alexander Schön、Markus Müller、Stylianos Michalakis、Stefanie Kellner、Thomas Carell

  DOI：10.1002/anie.202002295

  日期：2020.7.20

  report a total synthesis of the hypermodified nucleoside galactosyl‐queuosine (galQ). The availability of the compound enabled us to study the absolute levels of the Q‐family nucleosides in six different organs of newborn and adult mice, and also in human cytosolic tRNA. Our synthesis now paves the way to a more detailed analysis of the biological function of the Q‐nucleoside family.

  Queuosine（Q）是一种高度修饰的RNA核苷，存在于tRNA His，tRNA Asn，tRNA Tyr和tRNA Asp中。它位于tRNA反密码子环的摆动位置，在这里它可以与位于相应mRNA密码子各自位置的U以及C碱基相互作用。在tRNA Tyr和tRNA Asp中在包括人类在内的高等真核生物中，由于未知的原因，分别通过添加半乳糖和甘露糖糖进一步修饰了Q碱基。尚不清楚这种额外修饰的原因，以及如何通过Q的形成和插入来协调糖的修饰。在这里，我们报告了高度修饰的核苷半乳糖基奎宁（galQ）的总合成。该化合物的可用性使我们能够研究新生和成年小鼠的六个不同器官以及人胞质tRNA中Q族核苷的绝对水平。现在，我们的合成为Q-核苷家族的生物学功能的更详细分析铺平了道路。
• Total Synthesis of the Hypermodified tRNA Nucleoside Epoxyqueuosine
  作者：Ines Thoma、Thomas Carell

  DOI：10.1002/ejoc.201300586

  日期：2013.7

  modified nucleosides found in transferRNA (tRNA) of almost all species. Queuosine is found exclusively in the wooble position of the anticodon loop of several tRNA, where it is involved in tRNAAsp, tRNAAsn tRNAHis, and tRNATyr. The biosynthesis of queuosine is performed by prokaryotes, and eukaryotes are fully dependent on this external source. To investigate the interesting biosynthesis of the Q base

  Queuosine 是几乎所有物种的转移 RNA (tRNA) 中发现的最强烈修饰的核苷之一。Queuosine 仅存在于几种 tRNA 的反密码子环的 wooble 位置，在那里它参与 tRNAAsp、tRNAAsn、tRNAHis 和 tRNATyr。queuosine 的生物合成是由原核生物进行的，而真核生物则完全依赖于这种外部来源。为了研究 Q 碱基的有趣生物合成，我们在此报告了直接生物合成前体 oQ 的首次全合成。通过将 LC-MS 与特殊的大肠杆菌生长条件（培养基中不含维生素 B12）结合使用，我们确认了 oQ 天然产物的结构。