methyl N-[(tert-butoxy)carbonyl]glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteinate | 1309665-78-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl N-[(tert-butoxy)carbonyl]glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteinate
• CAS: 1309665-78-8
• 化学式: C₁₆H₂₄N₄O₇S
• 分子量: 416.455
• InChiKey: YJYVOLFZHOSPFD-JTQLQIEISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.52
• 重原子数：
  28.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  159.45
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl N-[(tert-butoxy)carbonyl]glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteinate 在 N-甲基吗啉 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 8.67h， 生成 N-[(tert-butoxy)carbonyl]glycyl-S-[(1,2,3,4-tetrahydro-2,4-dioxopyrimidin-5-yl)-methyl]-N-(2-((2-ethoxy-2-oxoethyl)[(2-oxo-2H-chromen-3-yl)acetyl]amino)ethyl)-L-cysteinamide
  参考文献：
  名称：

  新型 PNA 结合 Cyclen 复合物的合成、DNA 结合和切割研究

  摘要：

  已经合成并表征了一种新型的附加香豆素的 PNA 结合循环衍生物配体 C1 及其铜 (II) 复合物 C2。这些化合物与 DNA 的相互作用通过吸收、荧光和粘度滴定以及 DNA 熔化和凝胶电泳实验进行了系统研究。DNA熔解和粘度滴定实验表明，C1的结合方式为沟结合，C2为多重结合方式，包括沟结合和静电结合。从吸收滴定数据，我们可以说 CT DNA 和两种化合物之间的主要相互作用可能是核碱基之间的 H 键。荧光研究表明，C1 与 d(A)9 的结合能力是其他寡脱氧核苷酸的两倍或三倍。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201000084
• 作为产物：
  描述：

  S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteine hydrochloride 在 N-甲基吗啉 、 氯化亚砜 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 methyl N-[(tert-butoxy)carbonyl]glycyl-S-[(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)methyl]-L-cysteinate
  参考文献：
  名称：

  新型 PNA 结合 Cyclen 复合物的合成、DNA 结合和切割研究

  摘要：

  已经合成并表征了一种新型的附加香豆素的 PNA 结合循环衍生物配体 C1 及其铜 (II) 复合物 C2。这些化合物与 DNA 的相互作用通过吸收、荧光和粘度滴定以及 DNA 熔化和凝胶电泳实验进行了系统研究。DNA熔解和粘度滴定实验表明，C1的结合方式为沟结合，C2为多重结合方式，包括沟结合和静电结合。从吸收滴定数据，我们可以说 CT DNA 和两种化合物之间的主要相互作用可能是核碱基之间的 H 键。荧光研究表明，C1 与 d(A)9 的结合能力是其他寡脱氧核苷酸的两倍或三倍。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201000084