(R)-8-Chloromethyl-4-hydroxy-6-(1H-indole-2-carbonyl)-3,6,7,8-tetrahydro-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylic acid methyl ester | 190060-37-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: (R)-8-Chloromethyl-4-hydroxy-6-(1H-indole-2-carbonyl)-3,6,7,8-tetrahydro-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylic acid methyl ester
• CAS: 190060-37-8
• 化学式: C₂₂H₁₈ClN₃O₄
• 分子量: 423.856
• InChiKey: AGUBRDLXGBAWNI-LBPRGKRZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.12
• 重原子数：
  30.0
• 可旋转键数：
  3.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  98.42
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-8-Chloromethyl-4-hydroxy-6-(1H-indole-2-carbonyl)-3,6,7,8-tetrahydro-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylic acid methyl ester 在 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.5h， 以88%的产率得到methyl (1S,12R)-10-(1H-indole-2-carbonyl)-7-oxo-5,10-diazatetracyclo[7.4.0.01,12.02,6]trideca-2(6),3,8-triene-4-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Duocarmycin SA 缩短、简化和扩展的药物：对 DNA 结合亚基作用的系统检查

  摘要：

  描述了对 duocarmycin SA 的缩短、简化和扩展类似物的检查，并构成了对连接的 DNA 结合亚基作用的详细研究。除了通过小沟非共价接触增强 DNA 结合亲和力和选择性外，这些研究与随附文章的研究一起表明，DNA 烷基化反应的催化需要扩展的刚性 N2 酰胺取代基。DNA 烷基化的这种激活与 pH 无关，我们认为它是由结合诱导的试剂构象变化引起的，这增加了它们的固有反应性。底物的基态不稳定是由连接酰胺中的扭曲引起的，该扭曲破坏了烷基化亚基的乙烯基酰胺稳定性并激活了亲核加成试剂。

  DOI：

  10.1021/ja9637208
• 作为产物：
  描述：

  methyl 3-[(indol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-benzyloxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 25.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 2.0h， 生成 (R)-8-Chloromethyl-4-hydroxy-6-(1H-indole-2-carbonyl)-3,6,7,8-tetrahydro-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Yatakemycin 影响 DNA 烷基化和生物活性的结构特征的系统探索

  摘要：

  对 yatakemycin 左右亚基及其取代基的影响进行了系统检查，并对其独特的三个亚基排列（夹心与扩展和反向类似物）进行了研究。约的检查。制备的 50 个类似物表明，在矢车霉素三亚基结构中，亚基取代基相对不重要，独特的夹心排列显着提高了其 DNA 烷基化反应的速率和效率。这增强了 yatakemycin 及其类似物的细胞毒活性，克服了该系列中更传统的化合物（CC-1065，duocarmycins）通常观察到的局限性。而且，

  DOI：

  10.1021/ja072777z

文献信息

• Examination of the role of the duocarmycin SA methoxy substituents: Identification of the minimum, fully potent DNA binding subunit
  作者：Dale L. Boger、Bernd Bollinger、Douglas S. Johnson

  DOI：10.1016/0960-894x(96)00401-5

  日期：1996.9

  The preparation and examination of 4-7 revealed that (+)-5 and (+)-duocarmycin SA were indistinguishable. In contrast, 6 and 7 exhibited properties more analogous to 4 illustrating that the C6 and C7 methoxy substituents of duocarmycin SA contribute little or nothing to its properties. Thus, the C5 methoxy substituent of the 5,6,7-trimethoxyindole subunit of duocarmycin SA is necessary and sufficient for observation of the full potency of the natural product. Copyright (C) 1996 Elsevier Science Ltd