methyl 3-[(indol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate | 182957-23-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: methyl 3-[(indol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate
• 英文别名: methyl (8S)-8-(chloromethyl)-4-hydroxy-6-(1H-indole-2-carbonyl)-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate
• CAS: 182957-23-9
• 化学式: C₂₂H₁₈ClN₃O₄
• 分子量: 423.856
• InChiKey: AGUBRDLXGBAWNI-GFCCVEGCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  98.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 3-[(indol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate 在 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.5h， 以88%的产率得到methyl 2-[(indol-2-yl)carbonyl]-1,2,8,8a-tetrahydrocyclopropa[c]pyrrolo[3,2-e]indol-4-one-6-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Duocarmycin SA 缩短、简化和扩展的药物：对 DNA 结合亚基作用的系统检查

  摘要：

  描述了对 duocarmycin SA 的缩短、简化和扩展类似物的检查，并构成了对连接的 DNA 结合亚基作用的详细研究。除了通过小沟非共价接触增强 DNA 结合亲和力和选择性外，这些研究与随附文章的研究一起表明，DNA 烷基化反应的催化需要扩展的刚性 N2 酰胺取代基。DNA 烷基化的这种激活与 pH 无关，我们认为它是由结合诱导的试剂构象变化引起的，这增加了它们的固有反应性。底物的基态不稳定是由连接酰胺中的扭曲引起的，该扭曲破坏了烷基化亚基的乙烯基酰胺稳定性并激活了亲核加成试剂。

  DOI：

  10.1021/ja9637208
• 作为产物：
  描述：

  (+)-(7bR,8aS)-methyl 2-[(tert-butyloxy)carbonyl]-4-oxo-1,2,4,5,8,8a-hexahydrocyclopropa[c]pyrrolo[3,2-e]indole-6-carboxylate 在 盐酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 methyl 3-[(indol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Duocarmycin SA 缩短、简化和扩展的药物：对 DNA 结合亚基作用的系统检查

  摘要：

  描述了对 duocarmycin SA 的缩短、简化和扩展类似物的检查，并构成了对连接的 DNA 结合亚基作用的详细研究。除了通过小沟非共价接触增强 DNA 结合亲和力和选择性外，这些研究与随附文章的研究一起表明，DNA 烷基化反应的催化需要扩展的刚性 N2 酰胺取代基。DNA 烷基化的这种激活与 pH 无关，我们认为它是由结合诱导的试剂构象变化引起的，这增加了它们的固有反应性。底物的基态不稳定是由连接酰胺中的扭曲引起的，该扭曲破坏了烷基化亚基的乙烯基酰胺稳定性并激活了亲核加成试剂。

  DOI：

  10.1021/ja9637208

文献信息

• Systematic Exploration of the Structural Features of Yatakemycin Impacting DNA Alkylation and Biological Activity
  作者：Mark S. Tichenor、Karen S. MacMillan、John D. Trzupek、Thomas J. Rayl、Inkyu Hwang、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/ja072777z

  日期：2007.9.1

  of the alkylation subunit within the three subunit arrangement (sandwiched vs extended and reversed analogues) indicates that it not only has a profound impact on the rate and efficiency of DNA alkylation but also controls and establishes the DNA alkylation selectivity as well, where both enantiomers of such sandwiched agents alkylate the same adenine sites exhibiting the same DNA alkylation selectivity

  对 yatakemycin 左右亚基及其取代基的影响进行了系统检查，并对其独特的三个亚基排列（夹心与扩展和反向类似物）进行了研究。约的检查。制备的 50 个类似物表明，在矢车霉素三亚基结构中，亚基取代基相对不重要，独特的夹心排列显着提高了其 DNA 烷基化反应的速率和效率。这增强了 yatakemycin 及其类似物的细胞毒活性，克服了该系列中更传统的化合物（CC-1065，duocarmycins）通常观察到的局限性。而且，
• Examination of the role of the duocarmycin SA methoxy substituents: Identification of the minimum, fully potent DNA binding subunit
  作者：Dale L. Boger、Bernd Bollinger、Douglas S. Johnson

  DOI：10.1016/0960-894x(96)00401-5

  日期：1996.9

  The preparation and examination of 4-7 revealed that (+)-5 and (+)-duocarmycin SA were indistinguishable. In contrast, 6 and 7 exhibited properties more analogous to 4 illustrating that the C6 and C7 methoxy substituents of duocarmycin SA contribute little or nothing to its properties. Thus, the C5 methoxy substituent of the 5,6,7-trimethoxyindole subunit of duocarmycin SA is necessary and sufficient for observation of the full potency of the natural product. Copyright (C) 1996 Elsevier Science Ltd
• Synthesis and evaluation of a series of C5′-substituted duocarmycin SA analogs
  作者：William M. Robertson、David B. Kastrinsky、Inkyu Hwang、Dale L. Boger

  DOI：10.1016/j.bmcl.2010.03.078

  日期：2010.5

  The synthesis and evaluation of a key series of analogs of duocarmycin SA, bearing a single substituent at the C5' position of the DNA binding subunit, are described. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Duocarmycin SA Shortened, Simplified, and Extended Agents:  A Systematic Examination of the Role of the DNA Binding Subunit
  作者：Dale L. Boger、Donald L. Hertzog、Bernd Bollinger、Douglas S. Johnson、Hui Cai、Joel Goldberg、Philip Turnbull

  DOI：10.1021/ja9637208

  日期：1997.5.1

  analogs of duocarmycin SA is described and constitutes a detailed study of the role of linked DNA binding subunit. In addition to enhancing the DNA binding affinity and selectivity through minor groove noncovalent contacts, the studies in conjunction with those of the accompanying article illustrate that an extended rigid N2 amide substituent is required for catalysis of the DNA alkylation reaction. This

  描述了对 duocarmycin SA 的缩短、简化和扩展类似物的检查，并构成了对连接的 DNA 结合亚基作用的详细研究。除了通过小沟非共价接触增强 DNA 结合亲和力和选择性外，这些研究与随附文章的研究一起表明，DNA 烷基化反应的催化需要扩展的刚性 N2 酰胺取代基。DNA 烷基化的这种激活与 pH 无关，我们认为它是由结合诱导的试剂构象变化引起的，这增加了它们的固有反应性。底物的基态不稳定是由连接酰胺中的扭曲引起的，该扭曲破坏了烷基化亚基的乙烯基酰胺稳定性并激活了亲核加成试剂。