3,3'-(1,1'-methylenebis(1H-indole-6,1-diyl))bis(methylene)dibenzoic acid | 1220528-17-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 3,3'-(1,1'-methylenebis(1H-indole-6,1-diyl))bis(methylene)dibenzoic acid
• 英文别名: 3-[[1-[[6-[(3-Carboxyphenyl)methyl]indol-1-yl]methyl]indol-6-yl]methyl]benzoic acid
• CAS: 1220528-17-5
• 化学式: C₃₃H₂₆N₂O₄
• 分子量: 514.58
• InChiKey: RGCLGVKWXBMOHJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.8
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.09
• 拓扑面积：
  84.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  吲哚-6-硼酸 在 四(三苯基膦)钯 、 水 、 potassium carbonate 、 potassium hydroxide 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 3,3'-(1,1'-methylenebis(1H-indole-6,1-diyl))bis(methylene)dibenzoic acid
  参考文献：
  名称：

  开发吲哚化合物作为靶向 HIV-1 糖蛋白 41 的小分子融合抑制剂

  摘要：

  融合的非肽抑制仍然是抗 HIV 研究的一个重要目标，因为它具有低成本预防或预防病毒细胞间传播的潜力。我们在此报告了一系列已通过基于结构的药物设计方法鉴定为 gp41 融合抑制剂的吲哚化合物。化合物对疏水袋的实验结合亲和力与融合抑制数据密切相关 ( R 2= 0.91），相应的病毒复制抑制证实了疏水袋是低分子量融合抑制剂的有效靶点。最活跃的化合物与疏水袋结合，并以亚微摩尔水平抑制细胞 - 细胞融合和病毒复制。通过使用蛋白质数据库中的 gp41 结构进行对接研究，建立了该系列抑制剂的常见结合模式。分子足够灵活以符合口袋的轮廓，最活跃的化合物能够采用模拟 D 肽 PIE7 疏水接触的结构。结果增强了我们对吲哚化合物作为 gp41 抑制剂的理解。

  DOI：

  10.1021/jm200791z

文献信息

• Design, synthesis, and evaluation of indole compounds as novel inhibitors targeting Gp41
  作者：Guangyan Zhou、Dong Wu、Evan Hermel、Edina Balogh、Miriam Gochin

  DOI：10.1016/j.bmcl.2010.01.111

  日期：2010.3

  A series of indole ring containing compounds were designed based on the structure of the gp41 complex in the region of the hydrophobic pocket. These compounds were synthesized using a Suzuki Coupling reaction, and evaluated using a fluorescence binding assay and cell-cell fusion assay. The observed inhibition constant of compound 7 was 2.1 mu M, and the IC(50) for cell-cell fusion inhibition was 1.1 mu M. Assay data indicated that 7 is a promising lead compound for optimization into an effective low molecular weight fusion inhibitor. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.