3'-deoxyuridine 5'-monophosphate | 28083-75-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 3'-deoxyuridine 5'-monophosphate
• 英文别名: ((2R,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate；3'-Deoxyuridin-5'-monophosphat；3'-deoxy-[5']uridylic acid；3'-Deoxyuridine-5'-monophosphate；[(2S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 28083-75-2
• 化学式: C₉H₁₃N₂O₈P
• 分子量: 308.185
• InChiKey: SEOHEWZQAGEAGZ-SHYZEUOFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  146
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-deoxyuridine 5'-monophosphate 在 三丁基焦磷酸铵 、 N,N'-羰基二咪唑 作用下， 生成 3'-dUTP
  参考文献：
  名称：

  合成核苷和核苷酸。XXXV。5-氟嘧啶核苷和3-脱氧-β-D-呋喃呋喃糖及相关化合物的核苷酸的合成和生物学评估。

  摘要：

  衍生自抗生素虫草素的1-O-乙酰基-2,5-二-Op-氯苯甲酰基-3-脱氧-D-呋喃核糖（1）与N4-丙酰胞嘧啶N4-p的三甲基甲硅烷基化衍生物（2a-c）偶联在三甲基甲硅烷基三氟甲磺酸酯（TMS-三氟甲磺酸酯）存在下，将甲苯基-5-氟胞嘧啶和5-氟尿嘧啶生成完全酰化的核苷（分别为3a-b和3d）。通过用水合肼处理选择性除去3a的N4-丙酰基，得到2′，5′-二-Op-氯苯甲酰基-3′-脱氧胞苷（4）。在三氟乙酸中用亚硝酸钠对4进行脱氨基反应，得到2'，5'-二-Op-氯苯甲酰尿苷（3c），收率很高。将化合物3a-d皂化，得到游离的3'-脱氧胞苷（5a），5-氟-3'-脱氧胞苷（5b），3'-脱氧尿苷（5c）和5-氟-3'-脱氧尿苷（5d），分别。这3' 然后将-脱氧核糖核苷（5a-d）转化为相应的5'-单磷酸酯，并通过磷杂咪唑酸酯方法将其进一步磷酸化为5'-三磷酸酯。检查了核苷（5a-d

  DOI：

  10.1248/cpb.43.2005
• 作为产物：
  描述：

  N6,N6,2',5'-tetra-p-chlorobenzoylcordycepin 在 硫酸 、 sodium methylate 、 四氯化锡 、 溶剂黄146 、 sodium nitrite 作用下， 以 甲醇 、 水 、 乙酸酐 、 溶剂黄146 、 乙腈 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 3'-deoxyuridine 5'-monophosphate
  参考文献：
  名称：

  Synthetic nucleosides and nucleotides. XIX. Synthesis of 3'-deoxycytidine 5'-triphosphate and related 3'-deoxyribonucleotides from cordycepin.

  摘要：

  嘧啶 3'-脱氧核苷 5'-三磷酸，即虫草素 5'-三磷酸的嘧啶对应物，(1) 是由虫草素方便地合成的，作为潜在的脱氧核糖核酸 (DNA) 依赖性核糖核酸 (RNA) 聚合酶抑制剂。为了合成 3'-脱氧胞苷，将 1 对氯苯甲酰化，然后进行乙酰解，得到 1-O-乙酰基-2, 5-二-O-对氯苯甲酰基-3-脱氧-D-呋喃核糖 (3) 的异头混合物。屈服。 2, 4-双-三甲基甲硅烷基-N4-酰基胞嘧啶 (4a, b) 与 3 在氯化锡存在下缩合，以优异的收率得到完全酰化的 3'-脱氧胞苷 (5)。除去保护基团得到 3'-脱氧胞苷 (6)，其磷酸化后得到 3'-脱氧胞苷 5'-单磷酸 (7)，这是本研究中的关键中间体。用亚硝酸将 7 脱氨，得到 3'-脱氧胞苷-5'-单磷酸 (8)。另外，2, 4-双-三甲基甲硅烷氧基-5-甲基-或乙基嘧啶(4c, d)以类似的方式与3偶联，得到完全酰化的5-甲基-(5c)或5-乙基-3'-脱氧尿苷( 5d）。通过咪唑磷酸酯法将5'-单磷酸转化为相应的5'-三磷酸。

  DOI：

  10.1248/cpb.30.2223

文献信息

• Structure−Activity Relationship of Uridine 5‘<b>-</b>Diphosphoglucose Analogues as Agonists of the Human P2Y₁₄ Receptor
  作者：Hyojin Ko、Ingrid Fricks、Andrei A. Ivanov、T. Kendall Harden、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm061222w

  日期：2007.5.1

  moieties abolished activity; this is among the least permissive P2Y receptors. However, a 2-thiouracil modification in 15 (EC50 49 +/- 2 nM) enhanced the potency of UDPG (but not UDP-glucuronic acid) by 7-fold. 4-Thio analogue 13 was equipotent to UDPG, but S-alkylation was detrimental. Compound 15 was docked in a rhodposin-based receptor homology model, which correctly predicted potent agonism of UDP-fructose

  UDP葡萄糖（UDPG）及其衍生物是Gi蛋白偶联的P2Y14受体的天然激动剂，它存在于免疫系统中。我们合成并表征了在碱基，核糖和葡萄糖部分修饰的UDPG的药理学新类似物，作为结合建模设计新配体的基础。通过工程化的Galpha-q / i蛋白将在COS-7细胞中表达的重组人P2Y14受体与磷脂酶C偶联。尿嘧啶或核糖部分的大多数修饰废除了活性。这是最不被允许的P2Y受体之一。然而，在15（EC50 49 +/- 2 nM）中的2-硫尿嘧啶修饰将UDPG（而不是UDP-葡萄糖醛酸）的效力提高了7倍。4-硫代类似物13与UDPG等价，但是S-烷基化是有害的。化合物15停靠在基于罗丹蛋白的受体同源性模型中，该模型正确预测了UDP-果糖，UDP-甘露糖和UDP-肌醇的有效激动作用。UDPG的己糖部分与多个H键和带电荷的残基相互作用，并为激动剂修饰提供了肥沃的区域。
• Synthetic Nucleosides and Nucleotides. XXXV. Synthesis and Biological Evaluations of 5-Fluoropyrimidine Nucleosides and Nucleotides of 3-Deoxy-.BETA.-D-ribofuranose and Related Compounds.
  作者：Mineo SANEYOSHI、Mizue KOHSAKA-ICHIKAWA、Akiko YAHATA、Shigeru KIMURA、Shunji IZUTA、Toyofumi YAMAGUCHI

  DOI：10.1248/cpb.43.2005

  日期：——

  further phosphorylated to the 5'-triphosphates by the phosphoroimidazolidate method. The nucleosides (5a-d) were examined for growth-inhibitory effects on mouse leukemic L5178Y cells, and their IC50 values (microgram/ml) were 1.8, 33, 6.5, and 18, respectively. On the other hand, the antiviral activities of these compounds on a rhabdovirus, infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV), were moderate (IC50

  衍生自抗生素虫草素的1-O-乙酰基-2,5-二-Op-氯苯甲酰基-3-脱氧-D-呋喃核糖（1）与N4-丙酰胞嘧啶N4-p的三甲基甲硅烷基化衍生物（2a-c）偶联在三甲基甲硅烷基三氟甲磺酸酯（TMS-三氟甲磺酸酯）存在下，将甲苯基-5-氟胞嘧啶和5-氟尿嘧啶生成完全酰化的核苷（分别为3a-b和3d）。通过用水合肼处理选择性除去3a的N4-丙酰基，得到2′，5′-二-Op-氯苯甲酰基-3′-脱氧胞苷（4）。在三氟乙酸中用亚硝酸钠对4进行脱氨基反应，得到2'，5'-二-Op-氯苯甲酰尿苷（3c），收率很高。将化合物3a-d皂化，得到游离的3'-脱氧胞苷（5a），5-氟-3'-脱氧胞苷（5b），3'-脱氧尿苷（5c）和5-氟-3'-脱氧尿苷（5d），分别。这3' 然后将-脱氧核糖核苷（5a-d）转化为相应的5'-单磷酸酯，并通过磷杂咪唑酸酯方法将其进一步磷酸化为5'-三磷酸酯。检查了核苷（5a-d
• Synthetic nucleosides and nucleotides. XIX. Synthesis of 3'-deoxycytidine 5'-triphosphate and related 3'-deoxyribonucleotides from cordycepin.
  作者：MINEO SANEYOSHI、JUNICHI TOHYAMA、CHIKAO NAKAYAMA

  DOI：10.1248/cpb.30.2223

  日期：——

  The pyrimidine 3'-deoxyriboside 5'-triphosphates, pyrimidine counterparts of cordycepin 5'-triphosphate, (1) were conveniently synthesized from cordycepin as potential deoxyribonucleic acid (DNA)-dependent ribonucleic acid (RNA) polymerase inhibitors. For the synthesis of 3'-deoxycytidine, p-chlororobenzoylation of 1 followed by acetolysis afforded an anomeric mixture of 1-O-acetyl-2, 5-di-O-p-chlorobenzoyl-3-deoxy-D-ribofuranose (3) in good yield. Condensation of 2, 4-bis-trimethylsilyl-N4-acylcytosine (4a, b) with 3 in the presence of stannic chloride gave fully acylated 3'-deoxycytidine (5) in excellent yield. The protecting group was removed to give 3'-deoxycytidine (6), which on phosphorylation gave 3'-deoxycytidine 5'-monophosphate (7), a key intermediate in the present study. Deamination of 7 with nitrous acid afforded 3'-deoxycytidine-5'-monophosphate (8). Additionally, 2, 4-bis-trimethylsilyloxy-5-methyl-or ethylpyrimidine (4c, d) was coupled with 3 in a similar manner to give fully acylated 5-methyl-(5c) or 5-ethyl-3'-deoxyuridine (5d). The 5'-monophosphates were converted to the corresponding 5'-triphosphates by the phosphoroimidazolidate method.

  嘧啶 3'-脱氧核苷 5'-三磷酸，即虫草素 5'-三磷酸的嘧啶对应物，(1) 是由虫草素方便地合成的，作为潜在的脱氧核糖核酸 (DNA) 依赖性核糖核酸 (RNA) 聚合酶抑制剂。为了合成 3'-脱氧胞苷，将 1 对氯苯甲酰化，然后进行乙酰解，得到 1-O-乙酰基-2, 5-二-O-对氯苯甲酰基-3-脱氧-D-呋喃核糖 (3) 的异头混合物。屈服。 2, 4-双-三甲基甲硅烷基-N4-酰基胞嘧啶 (4a, b) 与 3 在氯化锡存在下缩合，以优异的收率得到完全酰化的 3'-脱氧胞苷 (5)。除去保护基团得到 3'-脱氧胞苷 (6)，其磷酸化后得到 3'-脱氧胞苷 5'-单磷酸 (7)，这是本研究中的关键中间体。用亚硝酸将 7 脱氨，得到 3'-脱氧胞苷-5'-单磷酸 (8)。另外，2, 4-双-三甲基甲硅烷氧基-5-甲基-或乙基嘧啶(4c, d)以类似的方式与3偶联，得到完全酰化的5-甲基-(5c)或5-乙基-3'-脱氧尿苷( 5d）。通过咪唑磷酸酯法将5'-单磷酸转化为相应的5'-三磷酸。