2'-脱氧-5-(2-羟基乙基)-3',5'-二-O-(4-甲基苯甲酰)尿苷 | 97974-93-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 2'-脱氧-5-(2-羟基乙基)-3',5'-二-O-(4-甲基苯甲酰)尿苷
• 英文名称: 1-(2-deoxy-3,5-di-O-p-toluoyl-β-D-erythro-pentofuranosyl)-5-(2-hydroxyethyl)-1H,3H-pyrimidine-2,4-dione
• 英文别名: 1-(3,5-Di-O-p-toluoyl-2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-5-(2-hydroxyethyl)pyrimidin-2,4(3H)-dione；3',5'-di-O-p-toluoyl-5-(2-hydroxyethyl)-2'-deoxyuridine；3',5'-DI-O-(P-Toluoyl)-5-(2-hydroxyethyl)-2'-deoxyuridine；[(2R,3S,5R)-5-[5-(2-hydroxyethyl)-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]-3-(4-methylbenzoyl)oxyoxolan-2-yl]methyl 4-methylbenzoate
• CAS: 97974-93-1
• 化学式: C₂₇H₂₈N₂O₈
• 分子量: 508.528
• InChiKey: OOZVHNULOVTJKS-YTFSRNRJSA-N

物化性质

• 密度：
  1.38±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-脱氧-5-(2-羟基乙基)-3',5'-二-O-(4-甲基苯甲酰)尿苷 在 吡啶 、 2,4,6-三甲基吡啶 、 N-甲基哌啶 、 sodium azide 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 silver nitrate 、 对甲苯磺酰氯 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 34.5h， 生成 (2R,3S,5R)-5-(5-(2-aminoethyl)-4-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethyl)amino)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-(((4-methylbenzoyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-methylbenzoate
  参考文献：
  名称：

  [EN] INHIBITORS OF DNMT1 AS ANTICANCER THERAPEUTIC AGENTS
  [FR] INHIBITEURS DE DNMT1 UTILISÉS EN TANT QU'AGENTS THÉRAPEUTIQUES ANTICANCÉREUX

  摘要：

  DNA 甲基转移酶 1 的抑制剂（一种负责在人类细胞中维持 DNA CpG 甲基化标记的酶）及其作为治疗各种癌症的药物的使用。该发明涉及化合物、药物组合物、抑制 DNA 甲基转移酶 1 的方法以及治疗癌症的方法。这些抑制剂是一般公式的化合物。

  公开号：

  WO2020013712A1
• 作为产物：
  描述：

  2,4-dimethoxy-5-(2-hydroxyethyl)pyrimidine 在 吡啶 、 苯磺酰胺 、 三甲基氯硅烷 、 sodium methylate 、 乙酰氯 、 sodium iodide 作用下， 以 甲醇 、 氯仿 、 乙腈 为溶剂， 反应 23.19h， 生成 2'-脱氧-5-(2-羟基乙基)-3',5'-二-O-(4-甲基苯甲酰)尿苷
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 4-O-Methyl-Protected 5-(2-Hydroxyethyl)-2′-deoxyuridine Derivatives and their Nucleophilic Fluorination to 5-(2-Fluoroethyl)-2′-deoxyuridine

  摘要：

  DOI：

  10.1055/s-1999-3641

文献信息

• Hydroxyl-Functionalized DNA: An Efficient Orthogonal Protecting Strategy and Duplex Stability
  作者：Di Zhang、Liang Xu、Xia Wei、Yaming Li、Junlin He、Keliang Liu

  DOI：10.1080/15257770903307276

  日期：2009.10.28

  was found to be an effective orthogonal protecting strategy for the 5-substituted hydroxyl groups of de novo synthesized deoxyuridine analogues 1–3 and 7-(3-hydroxypropynyl)- of 8-aza-7-deazadeoxyadenosine 4 for their incorporation into oligodeoxynucleotides by phosphoramidite chemistry. It could be completely cleaved under normal and ultra-mild deprotection conditions applied to DNA synthesis, without

  发现叔丁基二苯基甲硅烷基（TBDPS）是一种有效的正交保护策略，用于从头合成8-氮杂-7-脱氮氧代腺苷4的从头合成的脱氧尿苷类似物1-3和7-（3-羟基丙炔基）-的5-取代羟基。通过亚磷酰胺化学将它们掺入寡脱氧核苷酸中。在应用于DNA合成的正常和超温和脱保护条件下，它可以完全裂解，而无需额外的裂解操作。新的亚磷酰胺与往常一样以高收率偶联。通过MALDI-TOF和酶切分析对新修饰的寡聚脱氧核苷酸进行了表征。评估了这些羟基官能化DNA双链体的热稳定性和构象。
• 5-(Haloalkyl)-2'-deoxyuridines: a novel type of potent antiviral nucleoside analog
  作者：Herfried Griengl、Michael Bodenteich、Walter Hayden、Erich Wanek、Wolfgang Streicher、Peter Stuetz、Helmut Bachmayer、Ismail Ghazzouli、Brigitte Rosenwirth

  DOI：10.1021/jm00149a024

  日期：1985.11

  Syntheses of 5-(2-haloethyl)-2'-deoxyuridines, 5-(3-chloropropyl)-2'-deoxyuridines, and 5-(2-chloroethyl)-2'-deoxycytidine are described. The antiviral activities of these compounds were determined in cell culture against herpes simplex virus types 1 and 2. All compounds were shown to possess significant and selective antiviral activity. The most potent derivative, 5-(2-chloroethyl)-2'-deoxyuridine

  描述了5-（2-卤乙基）-2'-脱氧尿苷，5-（3-氯丙基）-2'-脱氧尿苷和5-（2-氯乙基）-2'-脱氧胞苷的合成。在细胞培养物中确定了这些化合物对1型和2型单纯疱疹病毒的抗病毒活性。所有化合物均显示出显着的选择性抗病毒活性。最有效的衍生物5-（2-氯乙基）-2'-脱氧尿苷（CEDU）在浓度低于0.1微克/毫升时抑制HSV-1。仅在浓度高于100微克/ mL时，它对细胞增殖才产生可测量的抑制作用。体内CEDU腹膜内和口服给予的浓度低于每天5 mg / kg的小鼠，可降低HSV-1感染小鼠的死亡率。从而，
• Synthesis and Characterization of Transition-State Analogue Inhibitors against Human DNA Methyltransferase 1
  作者：Farah Lamiable-Oulaidi、Rajesh K. Harijan、Karl J. Shaffer、Douglas R. Crump、Yan Sun、Quan Du、Shivali A. Gulab、Ashna A. Khan、Andreas Luxenburger、Anthony D. Woolhouse、Simone Sidoli、Peter C. Tyler、Vern L. Schramm

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c01869

  日期：2022.4.14

  methyltransferase 1 (DNMT1) silences tumor-suppression genes, and inhibition of DNMT1 can reactivate silenced genes. The 5-azacytidines are approved inhibitors of DNMT1, but their mutagenic mechanism limits their utility. A synthon approach from the analogues of S-adenosylhomocysteine, methionine, and deoxycytidine recapitulated the chemical features of the DNMT1 transition state in the synthesis of 16 chemically

  人类 DNA 甲基转移酶 1 (DNMT1) 对 CpG 区域的高甲基化使肿瘤抑制基因沉默，而对 DNMT1 的抑制可以重新激活沉默的基因。5-氮杂胞苷是经批准的 DNMT1 抑制剂，但它们的诱变机制限制了它们的效用。来自S-腺苷高半胱氨酸、蛋氨酸和脱氧胞苷类似物的合成子方法在 16 种化学稳定的过渡态模拟物的合成中概括了 DNMT1 过渡态的化学特征。对引起纯化的DNMT1的完全和部分抑制的抑制剂进行了表征。抑制剂对 DNMT1 与 DNMT3b 显示出适度的选择性。活性位点对接预测抑制剂与S-腺苷-l的相互作用催化位点的甲硫氨酸和脱氧胞苷区域，通过直接结合分析进行验证。纯化的 DNMT1 的抑制剂作用未反映在培养的细胞中。部分抑制剂激活细胞 DNA 甲基化，而完全抑制剂对细胞 DNA 甲基化没有影响。这些化合物提供了对用于 DNA 甲基转移酶的新的非共价 DNMT 化学支架家族的化学访问。