6-(2,3,3-三甲基吲哚-1-鎓-1-基)己酸溴化物 | 171429-43-9

• 物质功能分类: 医药中间体 - 杂环化合物 - 吲哚类化合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: 6-(2,3,3-三甲基吲哚-1-鎓-1-基)己酸溴化物
• 英文名称: 1-(5-carboxypentyl)-2,3,3-trimethylindoleninium bromide
• 英文别名: 1-(5-carboxypentyl)-2,3,3-trimethyl[3H]indolium Bromide；1-(5-carboxypentyl)-2,3,3-trimethyl-3H-indol-1-ium bromide；6-(2,3,3-Trimethyl-3H-indol-1-ium-1-yl)hexanoate hydrobromide；6-(2,3,3-trimethylindol-1-ium-1-yl)hexanoate;hydrobromide
• CAS: 171429-43-9
• 化学式: Br*C₁₇H₂₄NO₂
• 分子量: 354.287
• InChiKey: YUUDHAOMIPLRQU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.73
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  40.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P280,P301+P312,P302+P352,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(2,3,3-三甲基吲哚-1-鎓-1-基)己酸溴化物 在 吡啶 作用下， 反应 1.5h， 生成 6-[(2Z)-3,3-dimethyl-2-[(E)-3-(1,3,3-trimethylindol-1-ium-2-yl)prop-2-enylidene]indol-1-yl]hexanoic acid;iodide
  参考文献：
  名称：

  具有极好分辨率荧光输出的封装能量传输盒

  摘要：

  本文涉及具有可调光子特性的水相容荧光成像探针的开发，这些探针可以在单一波长下激发。使用简单的合成路线制备了由 BODIPY 供体和花青受体组成的双色团盒 1a-1c，并研究了它们的光物理特性。在 488 nm 激发 BODIPY 部分后，激发能量通过乙炔桥转移到花青染料受体，后者发出大约 600、700 和 800 nm 的光，即具有显着的色散。有效的能量转移促进了这种效应，它在 86 和 290 nm 之间产生了“准斯托克斯”位移，为成像打开了一个巨大的光谱窗口。暗盒的发射特性取决于能量转移 (ET) 机制：转移速度越快，效率越高。ET 速率的测量表明，在盒 1a 和 1b 中发生的直通键 ET 比经典的直通空间 Förster ET 快 2 个数量级。然而，在盒式磁带 1c 的情况下，两种机制都是可能的，并且速率测量不允许我们区分它们。因此，盒式磁带 1a-1c 非常适合在涉及单个激光

  DOI：

  10.1021/ja107193j
• 作为产物：
  描述：

  3-甲基-2-丁酮苯基腙 在 溶剂黄146 作用下， 以 邻二氯苯 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 6-(2,3,3-三甲基吲哚-1-鎓-1-基)己酸溴化物
  参考文献：
  名称：

  基于 FRET 的 Mito 特异性荧光探针，用于内源性过氧亚硝酸盐的比率检测和成像：Cy3 和 Cy5 的二元组

  摘要：

  过氧亚硝酸盐 (OONO(-)) 与健康和疾病密切相关。OONO(-) 的生理和病理结果与其局部浓度有关，因此，非常需要可靠的 OONO(-) 检测。我们开发了一种基于 FRET 的小分子荧光探针 (PNCy3Cy5)，通过微调利用 Cy3 和 Cy5 对 OONO(-) 的差异反应性。它表现出高检测灵敏度并产生比率荧光信号。我们已经举例说明它可以应用于活细胞中 OONO(-) 的半定量测定。值得注意的是，它专门定位于线粒体，其中主要产生内源性 OONO(-)。因此，PNCy3Cy5 是一种用于过亚硝酸盐生物学的有前途的分子工具。

  DOI：

  10.1021/jacs.6b06398

文献信息

• Cyanine dyes
  申请人：Nycomed Amersham plc

  公开号：US06348599B1

  公开（公告）日：2002-02-19

  A cyanine dye having the structure has an overall positive charge greater than +1, by virtue of the presence of one to five positively charged N or P or S atoms, and also has a reactive or functional group by which it may be linked to a biomolecule or a solid surface.

  一种靛菁染料具有如下结构，由于存在一个到五个带正电荷的N、P或S原子，其总正电荷大于+1，并且还具有一个反应性或功能基团，可以将其连接到生物分子或固体表面。
• Novel near-infrared pH-sensitive cyanine-based fluorescent probes for intracellular pH monitoring
  作者：Di Jin、Bowei Wang、Yuqing Hou、Yuchao Du、Xue Li、Ligong Chen

  DOI：10.1016/j.dyepig.2019.107612

  日期：2019.11

  from pink to pale green. Moreover, the probes’ fluorescence responses toward pH fluctuations were reversible and stable, and the pseudo-linear relationship between the fluorescence intensity and pH value can be used to detect pH value in 2.76–6.45 range quantitatively. Finally, probe 6 and 7 were successfully applied to monitor the fluctuation of intracellular pH by a fluorescence turn-on mode, and the

  实时监测细胞内pH的波动对疾病的诊断以及研究相关的生理和病理过程具有重要意义。开发了新型的近红外（NIR）pH激活的母体探针4，并将其进一步功能化以提供探针6和7。随着pH从11降低到2，它们在NIR区域均表现出新的吸收峰和强烈的荧光发射，并伴随溶液的颜色从粉红色快速变为浅绿色。此外，探针对pH波动的荧光响应是可逆的且稳定的，并且荧光强度与pH值之间的拟线性关系可用于定量检测2.76-6.45范围内的pH值。最后，探查6分别用7和7成功地通过荧光开启模式监测细胞内pH的波动，并且成像结果证实了它们的低细胞毒性和令人满意的细胞膜通透性，以及它们在疾病诊断（例如肿瘤特异性成像）中的应用前景。 ）或协助研究在宽酸性环境中与pH有关的生物过程。
• [EN] THERANOSTIC CONJUGATES<br/>[FR] CONJUGUÉS THÉRANOSTIQUES
  申请人：ARIEL SCIENT INNOVATIONS LTD

  公开号：WO2021009759A1

  公开（公告）日：2021-01-21

  Provided herein is a drug delivery (DD) system for ratiometric luminescence determination of drug release degree in drug delivery monitoring, which includes a drug, a switchable reporter and non-switchable reporter providing two distinguishable signals for detection; or a single switchable reporter providing two distinguishable signals for detection, and a cleavable linker connecting a drug to a switchable reporter, as well as a method for ratiometric luminescence determination of drug release in a target in vivo or in vitro), which is effected by administering the DD system provided herein that is capable of releasing a drug from the DD system, measuring two luminescent signals provided by the switchable reporter and the non-switchable reporter, or the single switchable reporter, determining the ratio between these two luminescence signals, and determining the drug release degree through the ratio between the two luminescence signals.

  本文提供了一种药物递送（DD）系统，用于药物递送监测中药物释放程度的比例荧光测定，该系统包括一种药物、一种可切换的报告物和一种不可切换的报告物，用于提供两种可区分的信号以进行检测；或者一种单一可切换的报告物，用于提供两种可区分的信号以进行检测，以及一种可切割的连接剂，连接药物和可切换的报告物，以及一种比例荧光测定方法，用于在目标（体内或体外）中测定药物释放，通过给予本文提供的能够从DD系统中释放药物的DD系统，测量可切换的报告物和不可切换的报告物提供的两个发光信号，或者单一可切换的报告物，确定这两个发光信号之间的比例，并通过这两个发光信号之间的比例确定药物释放程度。
• Comparative Study of Novel Fluorescent Cyanine Nucleotides: Hybridization Analysis of Labeled PCR Products Using a Biochip
  作者：V. E. Shershov、S. A. Lapa、V. E. Kuznetsova、M. A. Spitsyn、T. O. Guseinov、S. A. Polyakov、A. A. Stomahin、A. S. Zasedatelev、A. V. Chudinov

  DOI：10.1007/s10895-017-2139-6

  日期：2017.11

  efficiency of nucleotide incorporation during PCR was assessed with a multi-parameter hybridization analysis using a diagnostic DNA microarray. The hybridization analysis indirectly estimates the incorporation efficiency of dye-labeled nucleotides in multiplex PCR. Our results demonstrated higher efficiencies of substrates with electrically neutral dyes than electropositive and electronegative Cy5 residues

  这项研究调查了Cy5标记的dUTP衍生物的合成和底物特性，这些衍生物具有不同的取代基，染料单元和嘧啶杂环之间的连接基以及荧光团电荷。使用Taq和Vent（exo-）DNA聚合酶（A和B聚合酶家族的典型代表）进行多重PCR，研究了荧光标记的三磷酸核苷作为底物。PCR期间核苷酸掺入的效率通过使用诊断DNA微阵列的多参数杂交分析进行评估。杂交分析间接估计了染料标记核苷酸在多重PCR中的掺入效率。我们的结果表明，与电正性和负电性Cy5残基相比，具有电中性染料的底物效率更高。
• MEANS AND METHODS FOR VISUALIZATION OF TISSUE STRUCTURES
  申请人：GRETZ Norbert

  公开号：US20190353565A1

  公开（公告）日：2019-11-21

  The present invention relates to a chemical compound comprising (i) a polycationic polymer, coupled to (ii) a dye. The present invention further relates to a method for visualizing a glycosamine-containing structure in a biological sample comprising a) contacting an inner lumen of said biological sample with a dye-conjugated polycationic polymer, preferably with the chemical compound according to the present invention; b) tissue-clearing said biological sample; and, thereby, c) visualizing an internal glycosamine-containing structure in said biological sample. The present invention also relates to a method for determining the number and/or size of glomeruli in a kidney or a sample thereof making use of the method for visualizing a glycosamine-containing structure; and also relates to kits and uses related to said chemical compounds and said methods.

  本发明涉及一种化合物，包括（i）与（ii）染料偶联的多阳离子聚合物。本发明还涉及一种用于在生物样本中可视化含有氨基葡萄糖胺结构的方法，包括a）用染料偶联的多阳离子聚合物接触所述生物样本的内腔，优选地使用根据本发明的化合物；b）对所述生物样本进行组织透明化；从而c）在所述生物样本中可视化内部含有氨基葡萄糖胺结构。本发明还涉及一种利用用于可视化含有氨基葡萄糖胺结构的方法确定肾脏或其样本中的肾小球数量和/或大小的方法；还涉及与所述化合物和方法相关的试剂盒和用途。