1-(5-carboxypentyl)-3,3-dimethyl-2-(4-(phenylamino)buta-1,3-dien-1-yl)-3H-indol-1-ium-5-sulfonate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 1-(5-carboxypentyl)-3,3-dimethyl-2-(4-(phenylamino)buta-1,3-dien-1-yl)-3H-indol-1-ium-5-sulfonate
• 英文别名: 2-(4-anilinobutadienyl)-1-(5-carboxypentyl)-3,3-dimethylindoleninium-5-sulfonate potassium salt；2-(4-anilinobutadienyl)-1-(5-carboxypentyl)-3,3-dimethyl-5-sulfoindolinium inner salt；6-[2-[(1E,3E)-4-anilinobuta-1,3-dienyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-1-yl]hexanoate
• 化学式: C₂₆H₃₀N₂O₅S
• 分子量: 482.601
• InChiKey: LBQAHYCHFFWPCT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  7-(3-sulfopropyl)-2,3,3-trimethyl-3H-pyrrolo[2,3-b]pyridinium inner salt 、 1-(5-carboxypentyl)-3,3-dimethyl-2-(4-(phenylamino)buta-1,3-dien-1-yl)-3H-indol-1-ium-5-sulfonate 在 乙酸酐 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 potassium;(2Z)-1-(5-carboxypentyl)-2-[(2E,4E)-5-[3,3-dimethyl-7-(3-sulfonatopropyl)pyrrolo[2,3-b]pyridin-7-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  MODIFIED CARBOCYANINE DYES AND THEIR CONJUGATES

  摘要：

  化学反应性碳氰染料包含一个在3位被反应性基团或共轭物质取代的吲哚环部分，并描述了它们的用途。通过这个位置的共轭导致光谱特性均优于在不同位置附着的光谱相似染料的共轭物。该发明包括具有一个或多个苯并氮的衍生化合物。

  公开号：

  US20150218380A1
• 作为产物：
  描述：

  1-(5-carboxypentyl)-2,3,3-trimethylindoleninium-5-sulfonate potassium salt 、 丙二醛双苯亚胺单盐酸盐 在 溶剂黄146 、 三乙胺 作用下， 反应 3.0h， 以5 g的产率得到1-(5-carboxypentyl)-3,3-dimethyl-2-(4-(phenylamino)buta-1,3-dien-1-yl)-3H-indol-1-ium-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent compounds

  摘要：

  本发明涉及荧光染料。本发明提供了一系列广泛的荧光染料和包含这些染料的试剂盒，适用于标记各种生物分子、细胞和微生物。在一个方面，本发明提供了一种具有最大荧光激发波长的化合物，其中该化合物具有以下结构：F—Y=Ψ，其中Z—是一个反离子，Y是一个桥接单元，允许F和Ψ之间的电子共轭，F是具有以下结构的一个基团：本发明还提供了使用荧光染料进行研究和开发、法医鉴定、环境研究、诊断、预后和/或治疗疾病状况的各种方法。

  公开号：

  US09097667B2

文献信息

• Luminescent compounds
  申请人：Terpetschnig Ewald A.

  公开号：US08552027B2

  公开（公告）日：2013-10-08

  Dyes and photoluminescent compounds based on polymethine dyes that contain at least one alkyl-phosphonate or substituted alkyl-phosphonate group, including the synthetic precursors, methods of synthesis, and applications thereof. Certain embodiments include heterocyclic ring systems and polymethine linkage are selected such that the resulting polymethine dye is a cyanine dye, a merocyanine dye, or a styryl dye.

  基于聚甲烯染料的染料和光致发光化合物，其中至少含有一个烷基膦酸酯或取代烷基膦酸酯基团，包括合成前体、合成方法及其应用。某些实施例包括选择杂环环系统和聚甲烯链结构，以使得所得的聚甲烯染料为青菁染料、美洛青菁染料或偶氮染料。
• WATER-SOLUBLE FLUORO-SUBSTITUTED CYANINE DYES AS REACTIVE FLUORESCENCE LABELLING REAGENTS
  申请人：COOPER EDWARD MICHAEL

  公开号：US20060239922A1

  公开（公告）日：2006-10-26

  Disclosed are cyanine dyes that are useful for labelling and detecting biological and other materials. The dyes are of formula (I): in which at least one of groups R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , R 7 , R 8 , R 9 , R 10 R 11 , R 12 , R 13 and R 14 is -L-M or -L-P, where L is a linking group, M is a target bonding group and P is a conjugated component, and at least one of groups R 3 , R 4 , R 5 , R 6 , R 7 , R 8 , R 9 and R 10 comprises fluorine. The use of cyanine dyes substituted by fluorine and having additional substitution with three or more sulphonic acid groups for labelling biological target molecules results in a labelled product in which there is reduced dye-dye aggregation and improved photostability, compared with cyanine dyes having no such substitutions. The dyes of the present invention are particularly useful in assays involving fluorescence detection where continual or repeated excitation is a requirement, for example in kinetic studies, or in microarray analyses where microarray slides may need to be reanalysed over a period of days.

  揭示了一种对于标记和检测生物和其他材料有用的青霉素染料。该染料的化学式为（I）：其中R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13和R14中的至少一个是-L-M或-L-P，其中L是连接基团，M是目标键合基团，P是共轭组分，并且R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9和R10中的至少一个包含氟。通过用氟取代并具有三个或更多磺酸基团的青霉素染料标记生物靶分子，得到的标记产品中减少了染料-染料聚集并提高了光稳定性，与没有这种取代的青霉素染料相比。本发明的染料在涉及荧光检测的分析中特别有用，其中需要连续或重复激发，例如在动力学研究中，或在微阵列分析中，微阵列玻片可能需要在数天内重新分析。
• Neue Polymethinfarbstoffe auf Cumarin-Basis mit einstellbarem Stoke's-Shift
  申请人：Dyomics GmbH

  公开号：EP1535969B1

  公开（公告）日：2011-06-15
• MODIFIED CARBOCYANINE DYES AND THEIR CONJUGATES
  申请人：LIFE TECHNOLOGIES CORPORATION

  公开号：US20150218380A1

  公开（公告）日：2015-08-06

  Chemically reactive carbocyanine dyes incorporating an indolium ring moiety that is substituted at the 3-position by a reactive group or by a conjugated substance, and their uses, are described. Conjugation through this position results in spectral properties that are uniformly superior to those of conjugates of spectrally similar dyes wherein attachment is at a different position. The invention includes derivative compounds having one or more benzo nitrogens.

  化学反应性碳氰染料包含一个在3位被反应性基团或共轭物质取代的吲哚环部分，并描述了它们的用途。通过这个位置的共轭导致光谱特性均优于在不同位置附着的光谱相似染料的共轭物。该发明包括具有一个或多个苯并氮的衍生化合物。
• Fluorescent compounds
  申请人：Mao Fei

  公开号：US09097667B2

  公开（公告）日：2015-08-04

  The present invention relates to fluorescent dyes. The present invention provides a wide range of fluorescent dyes and kits containing the same, which are applicable for labeling a variety of biomolecules, cells and microorganisms. In one aspect, the invention provides a compound having a maximal fluorescence excitation wavelength, wherein the compound has a structure of Formula II: F—Y=Ψ  Formula II and wherein Z— is a counterion, Y is a bridge unit permitting electron delocalization between F and Ψ, and F is a moiety having the structure: The present invention also provides various methods of using the fluorescent dyes for research and development, forensic identification, environmental studies, diagnosis, prognosis, and/or treatment of disease conditions.

  本发明涉及荧光染料。本发明提供了一系列广泛的荧光染料和包含这些染料的试剂盒，适用于标记各种生物分子、细胞和微生物。在一个方面，本发明提供了一种具有最大荧光激发波长的化合物，其中该化合物具有以下结构：F—Y=Ψ，其中Z—是一个反离子，Y是一个桥接单元，允许F和Ψ之间的电子共轭，F是具有以下结构的一个基团：本发明还提供了使用荧光染料进行研究和开发、法医鉴定、环境研究、诊断、预后和/或治疗疾病状况的各种方法。