[(2S,5S)-4-benzyl-5-hydroxymethyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetic acid ally ester | 1005760-99-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: [(2S,5S)-4-benzyl-5-hydroxymethyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetic acid ally ester
• 英文别名: prop-2-enyl 2-[(2S,5S)-4-benzyl-5-(hydroxymethyl)-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetate
• CAS: 1005760-99-5
• 化学式: C₁₇H₂₀N₂O₅
• 分子量: 332.356
• InChiKey: FKYRPPKUAKSDSI-KBPBESRZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  95.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2S,5S)-4-benzyl-5-hydroxymethyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetic acid ally ester 在 迭氮酸 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 三苯基膦 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 8.5h， 生成 [(2S,5S)-4-benzyl-5-(tert-butoxycarbonylaminomethyl)-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetic acid ally ester
  参考文献：
  名称：

  包含新型双功能整合素配体的双功能二酮哌嗪支架的环状RGD拟肽。

  摘要：

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8

  DOI：

  10.1002/chem.201200457
• 作为产物：
  描述：

  L-N-苄基丝氨酸甲酯 在 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 异丙醇 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 [(2S,5S)-4-benzyl-5-hydroxymethyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl]acetic acid ally ester
  参考文献：
  名称：

  包含新型双功能整合素配体的双功能二酮哌嗪支架的环状RGD拟肽。

  摘要：

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8

  DOI：

  10.1002/chem.201200457

文献信息

• Synthesis and Conformational Studies of Peptidomimetics Containing a New Bifunctional Diketopiperazine Scaffold Acting as a β-Hairpin Inducer
  作者：Ana Sofia M. Ressurreição、Andrea Bordessa、Monica Civera、Laura Belvisi、Cesare Gennari、Umberto Piarulli

  DOI：10.1021/jo702072z

  日期：2008.1.1

  A practical synthesis of a new bifunctional diketopiperazine (DKP) scaffold 1, formally derived from the cyclization of l-aspartic acid and (S)-2,3-diaminopropionic acid, is reported. DKP-1 bears a carboxylic acid and an amino functionalities in a cis relationship, which have been used to grow peptide sequences. Tetra-, penta-, and hexapeptidomimetic sequences were prepared by solution-phase peptide

  报道了一种新的双功能二酮哌嗪（DKP）支架1的实用合成，该支架正式衍生自1-天冬氨酸和（S）-2,3-二氨基丙酸的环化。DKP- 1具有顺式关系的羧酸和氨基官能团，已被用于生长肽序列。通过溶液相肽合成（Boc策略）来制备四肽，五肽和六肽模拟物序列。这些衍生物的构象分析是通过组合1H NMR光谱，IR光谱，CD光谱和计算机建模，揭示了涉及10元和18元H键环的β-发夹模拟物的形成，以及生长中的肽链的反向变化。
• Selective O-acylation of unprotected N-benzylserine methyl ester and O,N-acyl transfer in the formation of cyclo[Asp-Ser] diketopiperazines
  作者：Mattia Marchini、Michele Mingozzi、Raffaele Colombo、Cesare Gennari、Marco Durini、Umberto Piarulli

  DOI：10.1016/j.tet.2010.10.007

  日期：2010.12

  The synthesis of two diastereomeric cyclo[Asp-N-Bn-Ser] diketopiperazines (2a and 2b) was investigated Initial formation of the Boc-aspartyl-N-benzyl serine isopeptide methyl esters (4a and 4b) was observed which derive from the selective O-acylation of unprotected (S)- or (R)-N-benzylserine This unexpected O-acylation is preferred over the formation of the tertiary amide and the resulting ester bond is stable in solution to O N-acyl transfer The O N-acyl migration is then triggered by cleavage of the Boc protecting group and treatment with base which also promotes immediate cyclization to the diketopiperazines (C) 2010 Elsevier Ltd All rights reserved
• Cyclic RGD Peptidomimetics Containing Bifunctional Diketopiperazine Scaffolds as New Potent Integrin Ligands
  作者：Mattia Marchini、Michele Mingozzi、Raffaele Colombo、Ileana Guzzetti、Laura Belvisi、Francesca Vasile、Donatella Potenza、Umberto Piarulli、Daniela Arosio、Cesare Gennari

  DOI：10.1002/chem.201200457

  日期：2012.5.14

  introduced into eight cyclic peptidomimetics containing the Arg‐Gly‐Asp (RGD) sequence. The resulting RGD peptidomimetics were screened for their ability to inhibit biotinylated vitronectin binding to the purified integrins αvβ3 and αvβ5, which are involved in tumor angiogenesis. Nanomolar IC50 values were obtained for the RGD peptidomimetics derived from trans DKP scaffolds (DKP‐2–DKP‐8). Conformational

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8