5-(氯甲基)尿嘧啶 | 3590-48-5

• 物质功能分类: 医药中间体 - 嘧啶类化合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 5-(氯甲基)尿嘧啶
• 中文别名: 5-氯甲基尿嘧啶
• 英文名称: 5-chloromethyluracil
• 英文别名: 5-Chlormethyluracil；5-(chloromethyl)-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 3590-48-5
• 化学式: C₅H₅ClN₂O₂
• mdl: MFCD00218445
• 分子量: 160.56
• InChiKey: UCDUBKRXOPMNGH-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  >350 °C(lit.)
• 密度：
  1.393±0.06 g/cm3(Predicted)
• 稳定性/保质期：

  在常温常压下保持稳定

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  58.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

安全信息

• 危险品标志：
  Xi
• 安全说明：
  S26,S36
• 危险类别码：
  R36/37/38
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2933599090
• 包装等级：
  II
• 危险类别：
  8
• 危险性防范说明：
  P501,P260,P270,P264,P280,P303+P361+P353,P301+P330+P331,P363,P301+P312+P330,P304+P340+P310,P305+P351+P338+P310,P405
• 危险品运输编号：
  3261
• 危险性描述：
  H302,H314

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(氯甲基)尿嘧啶 生成 胸腺嘧啶
  参考文献：
  名称：

  胸苷酸合成酶对脱氧尿苷单磷酸甲基化的化学模型的研究

  摘要：

  化合物（4A ; R 2 = H），长期被视为推定中间体在胸腺嘧啶生物合成的化学模型，已被改写为与双-adduct（图4b ; R 2 = H）; 建立了胸苷酸合成酶作用的化学模型并讨论了结果。

  DOI：

  10.1039/c39800000614
• 作为产物：
  描述：

  5-羟甲基脲嘧啶 在 盐酸 作用下， 生成 5-(氯甲基)尿嘧啶
  参考文献：
  名称：

  尿嘧啶和胸腺嘧啶的膦酸酯衍生物的合成和光谱。6-尿嘧啶甲基膦酸二乙酯的X射线晶体结构

  摘要：

  设计，制备和表征了衍生自尿嘧啶和胸腺嘧啶的新型膦酸酯配体。二甲基（4,7）和二（5，8）uracilmethylphosphonates已经制备由氯甲基尿嘧啶的反应异构体2和3分别与亚磷酸三甲酯和亚磷酸三乙酯。还分离了相应的游离酸5-尿嘧啶甲基膦酸6和6-尿嘧啶甲基膦酸9。化合物的结构已通过核磁共振光谱确定，在8的情况下，已通过X射线分析确认。

  DOI：

  10.1002/jhet.5570340414

文献信息

• Acyclopyrimidine<i>C</i>-nucleosides. Synthesis of acyclopseudoisocytidine and its derivatives
  作者：Chung K. Chu

  DOI：10.1002/jhet.5570210103

  日期：1984.1

  with dimethylformamide dimethyl acetal gave 1,3-dimethylacyclopseudouridine (VI) which was subsequently converted to acyclopseudoisocytidine (VII). 1-Methyl derivatives V and VIII were obtained from the selective methylation of IV and VII, respectively. 5-Hydroxymethyluracil also reacted with 2-mercaptoethanol to give the sulfide derivative (IX).

  由5-羟甲基尿嘧啶（I）合成无环伪古尿苷（IV），无环伪异胞苷（VII）及其1-甲基衍生物（V和VIII）。由5-羟甲基尿嘧啶（I）与乙二醇在酸性条件下的缩合反应可方便地制备无环假双胍（IV）。化合物Ⅳ也可以由5-氯甲基尿嘧啶制备，但是，发现该方法不如直接缩合法。IV用二甲基甲酰胺二甲基乙缩醛的甲基化得到1，3-二甲基acyclopseudouridine（VI），其随后转化为无环假异胞苷（VII）。1-甲基衍生物V和VIII分别由IV和VII的选择性甲基化获得。5-羟甲基尿嘧啶也与2-巯基乙醇反应，得到硫化物衍生物（IX）。
• Synthesis of various 5-substituted uracils
  作者：Dan Peters、Anna-Britta Hörnfeldt、Salo Gronowitz

  DOI：10.1002/jhet.5570270756

  日期：1990.11

  Several Pd-catalyzed coupling reactions have been evaluated for the synthesis of 5-substituted uracils. A convenient reaction, further developed by us, is the Suzuki Pd(0)-catalyzed coupling between arylboronic acids and aryl bromides or iodides in weakly alkaline medium. However, all attempts to use 5-bromo- or 5-iodouracil as the aryl halide failed. On the other hand, couplings between 2,4-di-t-

  已评估了几种Pd催化的偶联反应，用于合成5取代的尿嘧啶。由我们进一步开发的一种方便的反应是在弱碱性介质中芳基硼酸与芳基溴化物或碘化物之间的Suzuki Pd（0）催化偶联。但是，所有使用5-溴-或5-碘尿嘧啶作为卤代芳基的尝试均告失败。在另一方面，2,4-二-之间的耦合吨丁氧基-5-溴嘧啶和各种芳基硼酸是成功的。在当芳基硼酸是不可用的情况下，这是更好扭转耦合功能，并使用2,4-二-吨-丁氧基-5-嘧啶硼酸和芳基溴化物。以此方式制备了大量的5-芳基尿嘧啶。它们是通过5-芳基-2,4-二-的脱烷基作用以几乎定量的产率获得的叔丁氧基嘧啶。然而，这些方法的最大缺点是2,4-二氯-5-溴嘧啶，其为2,4-二-的合成中的中间体的高过敏性质吨丁氧基-5-溴嘧啶和2,4-二Ť-丁氧基-5-嘧啶硼酸。为了避免这种中间体，尝试了5-溴-2，4-二三甲基甲硅烷基氧基嘧啶和芳基硼酸之间的偶联，但是失败了。此外，由
• Quinazoline antifolates inhibiting thymidylate synthase: variation of the N10 substituent
  作者：Terence R. Jones、A. Hilary Calvert、Ann L. Jackman、M. Allan Eakin、Michael J. Smithers、Richard F. Betteridge、David R. Newell、Anthony J. Hayter、Andrew Stocker

  DOI：10.1021/jm00148a016

  日期：1985.10

  3-hydroxypropyl, and cyanomethyl substituents at N10 is described. In general, the synthetic route involved monoalkylation of diethyl N-(4-amino-benzoyl)-L-glutamate, coupling of the resulting secondary amine with 2-amino-6-(bromomethyl)-4-hydroxyquinazoline hydrobromide in N,N-dimethylacetamide with calcium carbonate as the base, and deprotection using mild alkali. The cyanomethyl derivatives was found

  在N10处合成具有异丙基，环丙基甲基，2-氟乙基，氨基甲酰基甲基，苯甲酰基，3-氟苄基，5-尿嘧啶甲基，羧甲基，2-羧乙基，3-氰丙基，3-羟丙基和氰甲基的取代基的12种新的5,8-二氮杂唑酸酯描述。通常，合成途径包括N-（4-氨基-苯甲酰基）-L-谷氨酸二乙酯的单烷基化，将所得仲胺与2-氨基-6-（溴甲基）-4-羟基喹唑啉氢溴酸盐在N，N-中偶联。以碳酸钙为碱的二甲基乙酰胺，并用弱碱脱保护。发现氰基甲基衍生物出乎意料地对碱不稳定，因此通过对二叔丁酯进行温和的酸脱保护来制备。测试了这些化合物作为纯化的L1210胸苷酸合酶（TS）的抑制剂。该系列的四个成员比N10-氢化合物更有效，但没有一个比先前描述的N10-炔丙基-5,8-二氮杂az酸更好。检查选定的化合物作为纯化的L1210二氢叶酸还原酶（DHFR）的抑制剂。根据需要，N10取代通常会降低DHFR抑制活性；讨论了这些结果。作为细胞毒性的
• Modified nucleosides for the treatment of viral infections and abnormal cellular proliferation
  申请人：——

  公开号：US20030087873A1

  公开（公告）日：2003-05-08

  The disclosed invention is a composition for and a method of treating a Flaviviridae (including BVDV and HCV), Orthomyxoviridae (including Influenza A and B) or Paramyxoviridae (including RSV) infection, or conditions related to abnormal cellular proliferation, in a host, including animals, and especially humans, using a nucleoside of general formula (I)-(XXIII) or its pharmaceutically acceptable salt or prodrug. This invention also provides an effective process to quantify the viral load, and in particular BVDV, HCV or West Nile Virus load, in a host, using real-time polymerase chain reaction (“RT-PCR”). Additionally, the invention discloses probe molecules that can fluoresce proportionally to the amount of virus present in a sample.

  该公开的发明涉及一种用于治疗Flaviviridae（包括BVDV和HCV）、Orthomyxoviridae（包括甲型和乙型流感）或Paramyxoviridae（包括RSV）感染或与异常细胞增殖有关的病况的组合物和方法，适用于宿主，包括动物，尤其是人类，使用通用式（I）-（XXIII）的核苷或其药学上可接受的盐或前药。该发明还提供了一种有效的过程，用于量化病毒载量，特别是BVDV、HCV或西尼罗河病毒载量，使用实时聚合酶链反应（RT-PCR）。此外，该发明揭示了可以与样本中存在的病毒数量成比例发光的探针分子。
• Probing riboswitch–ligand interactions using thiamine pyrophosphate analogues
  作者：Liuhong Chen、Elena Cressina、Neil Dixon、Karl Erixon、Kwasi Agyei-Owusu、Jason Micklefield、Alison G. Smith、Chris Abell、Finian J. Leeper

  DOI：10.1039/c2ob07116a

  日期：——

  The Escherichia coli thiM riboswitch forms specific contacts with its natural ligand, thiamine pyrophosphate (TPP or thiamine diphosphate), allowing it to generate not only nanomolar binding affinity, but also a high degree of discrimination against similar small molecules. A range of synthetic TPP analogues have been used to probe each of the riboswitch–ligand interactions. The results show that the pyrimidine-sensing helix of thiM is exquisitely tuned to select for TPP by recognising the H-bonding donor and acceptors around its aminopyrimidine ring and also by forming π-stacking interactions that may be sensitive to the electronics of the ring. The central thiazolium ring of TPP appears to be more important for ligand recognition than previously thought. It may contribute to binding via long-range electrostatic interactions and/or by exerting an electron withdrawing effect on the pyrimidine ring, allowing its presence to be sensed indirectly and thereby allowing discrimination between thiamine (and its phosphate esters) and other aminopyrimidines found in vivo. The pyrophosphate moiety is essential for submicromolar binding affinity, but unexpectedly, it does not appear to be strictly necessary for modulation of gene expression.

  大肠杆菌中的thiM核糖开关能够与其天然配体硫胺素焦磷酸（TPP或硫胺素二磷酸）形成特异性接触，不仅能够产生纳摩尔级的结合亲和力，还能对类似的小分子展现出高度选择性。一系列合成的TPP类似物被用来探究核糖开关与配体之间的相互作用。结果显示，thiM的嘧啶感知螺旋经过精妙调整，通过识别其氨基嘧啶环周围的氢键供体和受体，以及可能对环电子性质敏感的π堆积相互作用，来选择TPP。TPP的中心噻唑环在配体识别中的重要性似乎比之前认为的更高。它可能通过长程静电相互作用和/或通过对嘧啶环施加电子 withdrawing 效应来促进结合，使得其存在能够被间接感知，从而在体内区分硫胺素（及其磷酸酯）与其他氨基嘧啶。焦磷酸部分对于亚微摩尔级的结合亲和力至关重要，但出乎意料的是，它似乎并不严格需要调控基因表达。