5-(4-hydroxybenzoylaminomethyl)-2'-deoxyuridine triphosphate | 1345822-30-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 5-(4-hydroxybenzoylaminomethyl)-2'-deoxyuridine triphosphate
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-[5-[[(4-hydroxybenzoyl)amino]methyl]-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methyl [hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl] hydrogen phosphate
• CAS: 1345822-30-1
• 化学式: C₁₇H₂₂N₃O₁₆P₃
• 分子量: 617.293
• InChiKey: HCVHLDFRYTWFNR-BFHYXJOUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.2
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  288
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(4-hydroxybenzoylaminomethyl)-2'-deoxyuridine triphosphate 、 乙酸–三乙胺 以 水 、 乙腈 为溶剂， 以0.571 μmol的产率得到5-(4-hydroxybenzoylaminomethyl)-2'-deoxyuridine triphosphate tetrakis(triethylammonium) salt
  参考文献：
  名称：

  A divalent metal-dependent self-cleaving DNAzyme with a tyrosine side chain

  摘要：

  酶促结合的苯酚修饰的2′-脱氧尿苷三磷酸产生了一个修饰过的DNA文库，该文库随后用于在二价锌和镁阳离子的存在下进行体外选择，以筛选能够裂解核糖磷酸二酯的DNA酶。在经过11轮选择后，克隆和测序得到14个不同的序列，其中活性最强的是Dz11-17PheO。Dz11-17PheO在室温下的10 mM Mg2+和1 mM Zn2+存在下，自我裂解一个嵌入式核糖胞苷的观察速率常数为0.20 ± 0.02 min−1。在低浓度的Hg2+阳离子和稍高浓度的Eu3+阳离子下，其活性受到抑制。

  DOI：

  10.1039/c1ob05359k
• 作为产物：
  描述：

  保护胸苷 在 吡啶 、 ammonium hydroxide 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 三正丁胺 、 偶氮二异丁腈 、 bis(tri-n-butylammonium) pyrophosphate 、 氨 、 水 、 碘 、 碳酸氢钠 、 溶剂黄146 、 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 苯 为溶剂， 反应 13.17h， 生成 5-(4-hydroxybenzoylaminomethyl)-2'-deoxyuridine triphosphate
  参考文献：
  名称：

  A divalent metal-dependent self-cleaving DNAzyme with a tyrosine side chain

  摘要：

  酶促结合的苯酚修饰的2′-脱氧尿苷三磷酸产生了一个修饰过的DNA文库，该文库随后用于在二价锌和镁阳离子的存在下进行体外选择，以筛选能够裂解核糖磷酸二酯的DNA酶。在经过11轮选择后，克隆和测序得到14个不同的序列，其中活性最强的是Dz11-17PheO。Dz11-17PheO在室温下的10 mM Mg2+和1 mM Zn2+存在下，自我裂解一个嵌入式核糖胞苷的观察速率常数为0.20 ± 0.02 min−1。在低浓度的Hg2+阳离子和稍高浓度的Eu3+阳离子下，其活性受到抑制。

  DOI：

  10.1039/c1ob05359k