2-(5-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetic acid | 1174888-90-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2-(5-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetic acid
• 英文别名: 5-hydroxymethyluracil 1-acetic acid；2-[5-(Hydroxymethyl)-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]acetic acid
• CAS: 1174888-90-4
• 化学式: C₇H₈N₂O₅
• 分子量: 200.151
• InChiKey: DCZALGCPFDEAPX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.5
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(5-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetic acid 、 N-((2R,3S)-3-amino-2-hydroxy-4-phenylbutyl)-N-isobutyl-4-nitrobenzenesulfonamide 在 palladium 10% on activated carbon 、 甲酸铵 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.33h， 生成 N-((2S,3R)-4-(4-amino-N-isobutylphenylsulfonamido)-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl)-2-(5-hydroxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  具有嘧啶碱基作为新型P2配体以增强抗DRV耐药HIV-1变体活性的有效HIV-1蛋白酶抑制剂的初步SAR和生物学评估。

  摘要：

  将嘧啶碱基（核酸的基本成分）引入P2配体可能会增强人类免疫缺陷病毒1（HIV-1）蛋白酶抑制剂的效力，因为羰基和氨基会促进广泛的氢键相互作用的形成。在这项工作中，我们提供的证据是抑制剂10e，以N-2-（2,4-二氧代-3,4-二氢嘧啶-1（2H）-基）乙酰胺为P2配体，以4-甲氧基苯基磺酰胺为P2'配体具有显着的酶抑制和抗病毒活性，体外IC50为2.53 nM，体内对野生型HIV-1的抑制率为68％，细胞毒性低。该抑制剂还对DRV耐药的HIV-1变体表现出明显的抗病毒活性，这对进一步研究具有重要的价值。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.111866
• 作为产物：
  描述：

  5-羟甲基脲嘧啶 在 potassium carbonate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 2-(5-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  具有嘧啶碱基作为新型P2配体以增强抗DRV耐药HIV-1变体活性的有效HIV-1蛋白酶抑制剂的初步SAR和生物学评估。

  摘要：

  将嘧啶碱基（核酸的基本成分）引入P2配体可能会增强人类免疫缺陷病毒1（HIV-1）蛋白酶抑制剂的效力，因为羰基和氨基会促进广泛的氢键相互作用的形成。在这项工作中，我们提供的证据是抑制剂10e，以N-2-（2,4-二氧代-3,4-二氢嘧啶-1（2H）-基）乙酰胺为P2配体，以4-甲氧基苯基磺酰胺为P2'配体具有显着的酶抑制和抗病毒活性，体外IC50为2.53 nM，体内对野生型HIV-1的抑制率为68％，细胞毒性低。该抑制剂还对DRV耐药的HIV-1变体表现出明显的抗病毒活性，这对进一步研究具有重要的价值。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.111866

文献信息

• PNA/DNA interstrand cross-links from a modified PNA base upon photolysis or oxidative conditions
  作者：Yongtae Kim、In Seok Hong

  DOI：10.1016/j.bmcl.2008.08.002

  日期：2008.9

  PNA/DNA interstrand cross-links (ICLs) were observed when peptide nucleic acids (PNAs) containing modified thymine derivatives were hybridized with the complementary or one-base mismatched DNA upon photolysis or treatments of oxidative agent. PNA/DNA ICL formation provides a useful method for biological applications such as antisense technologies or PNA chips. (C) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Preliminary SAR and biological evaluation of potent HIV-1 protease inhibitors with pyrimidine bases as novel P2 ligands to enhance activity against DRV-resistant HIV-1 variants
  作者：Mei Zhu、Ling Ma、Huiyu Zhou、Biao Dong、Yujia Wang、Zhen Wang、Jinming Zhou、Guoning Zhang、Juxian Wang、Chen Liang、Shan Cen、Yucheng Wang

  DOI：10.1016/j.ejmech.2019.111866

  日期：2020.1

  to P2 ligands might enhance the potency of Human Immunodeficiency Virus-1 (HIV-1) protease inhibitors because of the carbonyl and amino groups promoting the formation of extensive hydrogen bonding interactions. In this work, we provide evidence that inhibitor 10e, with N-2-(2,4-Dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl) acetamide as the P2 ligand and a 4-methoxylphenylsulfonamide as the P2' ligand, displayed

  将嘧啶碱基（核酸的基本成分）引入P2配体可能会增强人类免疫缺陷病毒1（HIV-1）蛋白酶抑制剂的效力，因为羰基和氨基会促进广泛的氢键相互作用的形成。在这项工作中，我们提供的证据是抑制剂10e，以N-2-（2,4-二氧代-3,4-二氢嘧啶-1（2H）-基）乙酰胺为P2配体，以4-甲氧基苯基磺酰胺为P2'配体具有显着的酶抑制和抗病毒活性，体外IC50为2.53 nM，体内对野生型HIV-1的抑制率为68％，细胞毒性低。该抑制剂还对DRV耐药的HIV-1变体表现出明显的抗病毒活性，这对进一步研究具有重要的价值。