benzyl (2S)-5-[[12-[[4-[(2-amino-7H-purin-6-yl)oxymethyl]phenyl]methylamino]-12-oxododecyl]amino]-2-[[4-[(2,4-diaminopteridin-6-yl)methyl-methylamino]benzoyl]amino]-5-oxopentanoate | 680622-97-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: benzyl (2S)-5-[[12-[[4-[(2-amino-7H-purin-6-yl)oxymethyl]phenyl]methylamino]-12-oxododecyl]amino]-2-[[4-[(2,4-diaminopteridin-6-yl)methyl-methylamino]benzoyl]amino]-5-oxopentanoate
• CAS: 680622-97-3
• 化学式: C₅₂H₆₃N₁₅O₆
• 分子量: 994.169
• InChiKey: NNOTZVJAIJQDDO-FAIXQHPJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  73
• 可旋转键数：
  29
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  310
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl (2S)-5-[[12-[[4-[(2-amino-7H-purin-6-yl)oxymethyl]phenyl]methylamino]-12-oxododecyl]amino]-2-[[4-[(2,4-diaminopteridin-6-yl)methyl-methylamino]benzoyl]amino]-5-oxopentanoate 在 sodium hydroxide 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 以14 mg的产率得到(2S)-5-[[12-[[4-[(2-amino-7H-purin-6-yl)oxymethyl]phenyl]methylamino]-12-oxododecyl]amino]-2-[[4-[(2,4-diaminopteridin-6-yl)methyl-methylamino]benzoyl]amino]-5-oxopentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  通过共价标记诱导体内蛋白质二聚化

  摘要：

  我们在此提出了一种通过融合蛋白与与其他蛋白质相互作用的配体的共价标记来诱导活细胞中蛋白质二聚化的新方法。共价标记基于 DNA 修复蛋白 O6-烷基鸟嘌呤-DNA 烷基转移酶与 O6-苄基鸟嘌呤与适当配体偶联的反应。使用甲氨蝶呤作为配体，表明该方法可用于控制酵母酿酒酵母中的转录。标记反应的特异性及其不可逆的性质应该使该方法成为研究和控制体内蛋白质二聚化的有价值的工具。

  DOI：

  10.1021/ja037883p
• 作为产物：
  描述：

  1-benzyl L-glutamate 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N-甲基吡咯烷酮 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 25.17h， 生成 benzyl (2S)-5-[[12-[[4-[(2-amino-7H-purin-6-yl)oxymethyl]phenyl]methylamino]-12-oxododecyl]amino]-2-[[4-[(2,4-diaminopteridin-6-yl)methyl-methylamino]benzoyl]amino]-5-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  通过共价标记诱导体内蛋白质二聚化

  摘要：

  我们在此提出了一种通过融合蛋白与与其他蛋白质相互作用的配体的共价标记来诱导活细胞中蛋白质二聚化的新方法。共价标记基于 DNA 修复蛋白 O6-烷基鸟嘌呤-DNA 烷基转移酶与 O6-苄基鸟嘌呤与适当配体偶联的反应。使用甲氨蝶呤作为配体，表明该方法可用于控制酵母酿酒酵母中的转录。标记反应的特异性及其不可逆的性质应该使该方法成为研究和控制体内蛋白质二聚化的有价值的工具。

  DOI：

  10.1021/ja037883p

文献信息

• US7799524B2
  申请人：——

  公开号：US7799524B2

  公开（公告）日：2010-09-21
• Induced Protein Dimerization in Vivo through Covalent Labeling
  作者：Susanne Gendreizig、Maik Kindermann、Kai Johnsson

  DOI：10.1021/ja037883p

  日期：2003.12.1

  We present here a novel approach to induce protein dimerization in living cells through covalent labeling of fusion proteins with ligands which are interacting with other proteins. The covalent labeling is based on the reaction of the DNA repair protein O6-alkylguanine-DNA alkyltransferase with O6-benzylguanine coupled to an appropriate ligand. Using methotrexate as a ligand, it is shown that the approach

  我们在此提出了一种通过融合蛋白与与其他蛋白质相互作用的配体的共价标记来诱导活细胞中蛋白质二聚化的新方法。共价标记基于 DNA 修复蛋白 O6-烷基鸟嘌呤-DNA 烷基转移酶与 O6-苄基鸟嘌呤与适当配体偶联的反应。使用甲氨蝶呤作为配体，表明该方法可用于控制酵母酿酒酵母中的转录。标记反应的特异性及其不可逆的性质应该使该方法成为研究和控制体内蛋白质二聚化的有价值的工具。