5-azido-2S-{[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]amino}pentanoic acid | 763139-35-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 5-azido-2S-{[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]amino}pentanoic acid
• 英文别名: Nα-tert-butoxycarbonyl Nε-azido-L-norvaline；Nα-tert-butoxycarbonyl δ-azido-L-norvaline；5-azido-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)pentanoic acid；Boc-L-Orn(N3)-OH；Nα-Boc-δ-azido-L-norvaline；Nα-Boc-L-Nva(δ-N3)-OH；5-Azido-N-Boc-L-Norvaline；(2S)-5-azido-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoic acid
• CAS: 763139-35-1
• 化学式: C₁₀H₁₈N₄O₄
• 分子量: 258.277
• InChiKey: SZKWPJYNWXEPRJ-ZETCQYMHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  90
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-azido-2S-{[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]amino}pentanoic acid 在 4-二甲氨基吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 ethylene dichloride hydrochloride 、 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 45.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  一种面向多样性的合成策略，能够实现大环肽模拟支架的组合类型变异†

  摘要：

  大环肽模拟物与广泛的生物活性有关。然而，尽管具有这些潜在有价值的特性，但大环肽模拟结构类别通常被认为在药物发现中探索不足。这归因于缺乏生产具有高水平结构和形状多样性的大环肽模拟物集合的通用方法。特别是，目前的大环肽模拟库缺乏支架多样性；事实上，多种分子支架的有效构建对合成化学家提出了巨大的普遍挑战。这里我们描述一个新的，大环肽模拟物的多样性导向合成（DOS）的先进策略，能够实现分子支架（核心大环结构）的组合变化。这种 DOS 策略的普遍性和稳健性通过逐步有效地合成结构多样的 200 多种大环肽模拟化合物库来证明，每种化合物都基于不同的分子支架，并从现成的构建块中分离出来，并以毫克的数量分离。据我们所知，这代表了合成衍生的大环肽模拟物文库中前所未有的支架多样性水平。化学信息学分析表明，库化合物进入的化学空间区域与最畅销的品牌药物和大环天然产品所涉及的区域不同，说明我们的 DOS 方法对当前药

  DOI：

  10.1039/c5ob00371g
• 作为产物：
  描述：

  N-叔丁氧羰基-N'-苄氧羰基-L-鸟氨酸 在 1H-咪唑-1-磺酰叠氮盐酸盐 、 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 5%-palladium/activated carbon 、 氢气 、 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 5-azido-2S-{[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]amino}pentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  一种面向多样性的合成策略，能够实现大环肽模拟支架的组合类型变异†

  摘要：

  大环肽模拟物与广泛的生物活性有关。然而，尽管具有这些潜在有价值的特性，但大环肽模拟结构类别通常被认为在药物发现中探索不足。这归因于缺乏生产具有高水平结构和形状多样性的大环肽模拟物集合的通用方法。特别是，目前的大环肽模拟库缺乏支架多样性；事实上，多种分子支架的有效构建对合成化学家提出了巨大的普遍挑战。这里我们描述一个新的，大环肽模拟物的多样性导向合成（DOS）的先进策略，能够实现分子支架（核心大环结构）的组合变化。这种 DOS 策略的普遍性和稳健性通过逐步有效地合成结构多样的 200 多种大环肽模拟化合物库来证明，每种化合物都基于不同的分子支架，并从现成的构建块中分离出来，并以毫克的数量分离。据我们所知，这代表了合成衍生的大环肽模拟物文库中前所未有的支架多样性水平。化学信息学分析表明，库化合物进入的化学空间区域与最畅销的品牌药物和大环天然产品所涉及的区域不同，说明我们的 DOS 方法对当前药

  DOI：

  10.1039/c5ob00371g

文献信息

• Stapling of a 3₁₀-Helix with Click Chemistry
  作者：Øyvind Jacobsen、Hiroaki Maekawa、Nien-Hui Ge、Carl Henrik Görbitz、Pål Rongved、Ole Petter Ottersen、Mahmood Amiry-Moghaddam、Jo Klaveness

  DOI：10.1021/jo101670a

  日期：2011.3.4

  short peptides that has shown promise when applied to 310- and α-helical peptides. However, atomic resolution structural information on the effect of side chain-to-side chain cyclization in 310-helical peptides is scarce, and reported data suggest that there is significant potential for improvement of existing methodologies. Here, we report a novel stapling methodology for 310-helical peptides using

  短肽在药物发现和化学生物学中作为先导化合物和分子探针很重要，但是它们众所周知的缺点（例如高构象柔韧性，蛋白酶不稳定性，生物利用度差和体内半衰期短）阻碍了它们的潜力被充分利用。实现。侧链对侧链的环化，例如通过闭合烯烃复分解（称为钉合），是增加短肽的生物活性的一种方法，当应用于3 10和α-螺旋肽时，该方法已显示出希望。然而，关于原子分辨率结构信息，有关侧链对侧链环化在3 10中的作用-螺旋肽是稀缺的，报道的数据表明，改进现有方法学的潜力很大。在这里，我们报告了一种新型的吻合方法，用于在模型氨基异丁酸（Aib）丰富的肽中使用铜（I）催化的叠氮化物-炔烃环加成（CuAAC）反应的3个10螺旋肽，并研究了侧链至NMR，X射线衍射，线性IR和飞秒2D IR光谱分析侧链环化。我们的数据表明，所得环肽比其无环前体和迄今报道的其他钉合3 10-螺旋肽代表更理想的3 10-螺旋。当应用于3 10时，由CuA
• Peptides
  申请人：Jacobsen Øyvind

  公开号：US09227995B2

  公开（公告）日：2016-01-05

  A peptide which can adopt a 310-helical conformation in which the side chains of two amino acid residues in the peptide backbone are linked by a group comprising an aromatic 5-membered ring.

  一种肽，可以在其中两个氨基酸残基的侧链由包含芳香5元环的基团连接的310螺旋构象。
• <i>N</i>^α-Fmoc-Protected ω-Azido- and ω-Alkynyl-L-amino Acids as Building Blocks for the Synthesis of “Clickable” Peptides
  作者：Alexandra Le Chevalier Isaad、Francesca Barbetti、Paolo Rovero、Anna Maria D'Ursi、Mario Chelli、Michael Chorev、Anna Maria Papini

  DOI：10.1002/ejoc.200800717

  日期：2008.11

  α-amino-acid-derived building blocks. Herein we report the synthesis of unnatural homologous series of Nα-Fmoc-protected ω-yne- and ω-azido-L-amino acids compatible with the Fmoc/tBu-based solid-phase peptide synthesis. These building blocks can be incorporated into pseudopeptides that can serve as precursors of inter- and intramolecular click reactions. The homologous Nα-Fmoc-ω-azido-L-amino acids were prepared

  人们对 1,4-二取代-1,2,3-三唑基部分作为酰胺键替代物及其通过非常温和、化学选择性和生物正交的 CuI 催化的 Huisgen 1,3-偶极 [3+2] 环加成形成的兴趣日益增长将炔基转化为叠氮基功能，提出了对专门设计的 α-氨基酸衍生结构单元的未满足需求。在此，我们报告了与基于 Fmoc/tBu 的固相肽合成兼容的非天然同源系列 Nα-Fmoc 保护的 ω-yne-和 ω-叠氮基-L-氨基酸的合成。这些构建块可以结合到假肽中，作为分子间和分子内点击反应的前体。同源 Nα-Fmoc-ω-叠氮基-L-氨基酸是由 ω-氨基或 ω-羟基前体通过各自的重氮转移反应和顺序亲核取代最初由卤化物然后是叠氮化物制备的。同源 Nα-Fmoc-ω-yne-L-氨基酸是通过手性助剂的烷基化制备的，该助剂是源自甘氨酸和 (S)-2-(N-苄基脯氨酰)氨基二苯甲酮的希夫碱的 NiIII 络合物，与 ω -溴
• Expedient Synthesis of Triazole-Linked Glycosyl Amino Acids and Peptides
  作者：Brian H. M. Kuijpers、Stan Groothuys、A. (Bram) R. Keereweer、Peter J. L. M. Quaedflieg、Richard H. Blaauw、Floris L. van Delft、Floris P. J. T. Rutjes

  DOI：10.1021/ol048841o

  日期：2004.9.1

  [structure: see text] An expedient, high-yielding synthesis of two types of triazole-linked glycopeptides is described. These novel and stable glycopeptide mimics were prepared via Cu(I)-catalyzed [3 + 2] cycloaddition of either azide-functionalized glycosides and acetylenic amino acids or acetylenic glycosides and azide-containing amino acids.

  [结构：见正文]描述了两种三唑连接的糖肽的方便，高产率的合成。这些新颖而稳定的糖肽模拟物是通过Cu（I）催化的叠氮化物官能化糖苷和炔基氨基酸或炔属糖苷和含叠氮化物氨基酸的[3 + 2]环加成反应制备的。
• Cu(I)- and Ru(II)-Mediated “Click” Cyclization of Tripeptides Toward Vancomycin-Inspired Mimics
  作者：Jinqiang Zhang、Johan Kemmink、Dirk T. S. Rijkers、Rob M. J. Liskamp

  DOI：10.1021/ol201184b

  日期：2011.7.1

  Structural mimics comprising 1,4- and 1,5-disubstituted triazole-containing cyclic tripeptides with excellent resemblance toward the DE-ring of vancomycin are conveniently accessible using Cu(I)- or Ru(II)-assisted “click” cyclization.

  使用Cu（I）或Ru（II）辅助的“点击”环化，可方便地获得包含与万古霉素DE环极为相似的包含1,4-和1,5-二取代的含三唑的环状三肽的结构模拟物。