Nexavar® for the treatment of chronic myeloid leukemia and renal cell carcinoma has generated great interest in the development of other kinase inhibitors that target this secondary binding site. Here, we present a structural comparison of the important and similar interactions necessary for Gleevec®, Nexavar®, and BIRB-796 to bind to their respective DFG-out allosteric binding pockets and the selectivity
迄今为止开发的大多数激酶
抑制剂是针对
ATP 结合位点的竞争性
抑制剂。然而,格列卫®(
甲磺酸伊马替尼,STI571,PDB:1IEP)、Nexavar®(
甲苯磺酸索拉非尼,BAY 43-9006,PDB:1UWJ)和 BIRB-796(PDB:1KV2)的最新晶体结构揭示了一个二级结合位点与称为 DFG-out 变构结合位点的
ATP 结合位点相邻。Gleevec® 和 Nexavar® 最近在治疗慢性粒细胞白血病和肾细胞癌方面取得的成功引起了人们对开发其他靶向该二级结合位点的激酶
抑制剂的极大兴趣。在这里,我们对 Gleevec®、Nexavar®、和 BIRB-796 结合到它们各自的 DFG-out 变构结合袋以及每个对 c-Abl、B-Raf 和 p38α 的选择性。通过对 8 种额外的 DFG-out 变构
抑制剂的合成和评估,对其选择性特征进行了结构分析,这些
抑制剂是直接从这些成功支架的片段中开发出来的。