(1R,2S,4R,5S)-1-azido-2-hydroxymethyl-4-(thymin-1-yl)-3,6-dioxabicyclo[3.2.0]heptane | 352541-78-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二氧环庚烷
• 英文名称: (1R,2S,4R,5S)-1-azido-2-hydroxymethyl-4-(thymin-1-yl)-3,6-dioxabicyclo[3.2.0]heptane
• 英文别名: 1-[(1S,2R,4S,5R)-5-azido-4-(hydroxymethyl)-3,7-dioxabicyclo[3.2.0]heptan-2-yl]-5-methyl-pyrimidine-2,4-dione；1-[(1R,2S,4R,5S)-1-azido-2-(hydroxymethyl)-3,6-dioxabicyclo[3.2.0]heptan-4-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 352541-78-7
• 化学式: C₁₁H₁₃N₅O₅
• 分子量: 295.255
• InChiKey: ZINZQIRUFXGTLV-LUQPRHOASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.8
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,2S,4R,5S)-1-azido-2-hydroxymethyl-4-(thymin-1-yl)-3,6-dioxabicyclo[3.2.0]heptane 在 叔丁基过氧化氢 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.5h， 生成 1-[3-azido-3-deoxy-2-O,4-C-methylene-5-O-(2-oxo-4H-1,3,2-benzodioxaphosphorin-2-yl)-β-D-arabinofuranosyl]thymine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and antiviral evaluation of novel conformationally locked nucleosides and masked 5′-phosphate derivatives thereof

  摘要：

  作为评估构象锁定的3′-脱氧和3′-叠氮-3′-脱氧核苷衍生物作为潜在5′-O-三磷酸化抗HIV药物的前药的程序的一部分，采用汇聚合成策略制备了具有锁定的N型（北型，C3′-内环）呋喃糖构象的新型核苷衍生物。此外，为了可能绕过第一步磷酸化反应，还合成了这些衍生物的掩蔽5′-单磷酸衍生物，以及具有E型（东型，O4′-内环）呋喃糖构象的构象受限的3′-叠氮-3′-脱氧核苷的掩蔽5′-单磷酸衍生物。然而，无论是游离的5′-羟基衍生物还是掩蔽的5′-单磷酸化合物在MT-4细胞中均未显示出抗HIV活性。

  DOI：

  10.1039/b203484k
• 作为产物：
  描述：

  (3aS,5R,6R,6aS)-5-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[2,3-d][1,3]dioxol-6-ol 在 吡啶 、 chromium(VI) oxide 、 potassium fluoride 、 sodium tetrahydroborate 、 三甲基氯硅烷 、 sodium azide 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 ammonium cerium(IV) nitrate 、 18-冠醚-6 、 水 、 乙酸酐 、 sodium hydride 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 乙酰氯 、 三苯基膦 、 lithium hexamethyldisilazane 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 122.0h， 生成 (1R,2S,4R,5S)-1-azido-2-hydroxymethyl-4-(thymin-1-yl)-3,6-dioxabicyclo[3.2.0]heptane
  参考文献：
  名称：

  AZT的双环类似物的合成受异常O4'-内构象限制。

  摘要：

  [3.2.0]双环β-核苷类似物5已被设计为抗HIV药物AZT的构象受限类似物。因此描述了5及其α-端基异构体29的合成。由D-阿拉伯糖通过改良的Corey-Link程序完成立体合成，该程序立体选择性地合并了叠氮化物部分以及甲酯功能。当叔丁基二苯基甲硅烷基用作永久保护基时，氧杂环丁烷环的选择性形成失败。当使用对甲氧基苯基作为永久保护基时，通过酯的选择性还原，核碱基偶联，随后的端基异构体的分离和闭环程序有效地获得了5和29。核苷5在构型上受限于异常的O4'-内（东）构象，这是北方型和南方型构象之间的中间产物。然而，5和29均未显示出任何抗HIV活性。

  DOI：

  10.1021/jo010299j

文献信息

• Synthesis and antiviral evaluation of novel conformationally locked nucleosides and masked 5′-phosphate derivatives thereof
  作者：Torsten Bryld、Marianne H. Sørensen、Poul Nielsen、Troels Koch、Claus Nielsen、Jesper Wengel

  DOI：10.1039/b203484k

  日期：2002.7.11

  As part of a programme towards evaluating the potential of conformationally locked 3′-deoxy- and 3′-azido-3′-deoxy-nucleoside derivatives as prodrugs of potential 5′-O-triphosphorylated anti-HIV drugs, novel nucleoside derivatives with locked N-type (north-type, C3′-endo) furanose conformation were prepared using convergent synthetic strategies. In addition, masked 5′-monophosphate derivatives of these, and of a conformationally restricted 3′-azido-3′-deoxynucleoside with E-type (eastern-type, O4′-endo) furanose conformation, were prepared in order to potentially circumvent the first phosphorylation step. However, neither the free 5′-hydroxy derivatives nor the masked 5′-monophosphates showed anti-HIV activity in MT-4 cells.

  作为评估构象锁定的3′-脱氧和3′-叠氮-3′-脱氧核苷衍生物作为潜在5′-O-三磷酸化抗HIV药物的前药的程序的一部分，采用汇聚合成策略制备了具有锁定的N型（北型，C3′-内环）呋喃糖构象的新型核苷衍生物。此外，为了可能绕过第一步磷酸化反应，还合成了这些衍生物的掩蔽5′-单磷酸衍生物，以及具有E型（东型，O4′-内环）呋喃糖构象的构象受限的3′-叠氮-3′-脱氧核苷的掩蔽5′-单磷酸衍生物。然而，无论是游离的5′-羟基衍生物还是掩蔽的5′-单磷酸化合物在MT-4细胞中均未显示出抗HIV活性。
• Synthesis of a Bicyclic Analogue of AZT Restricted in an Unusual O4‘-<i>Endo</i> Conformation
  作者：Marianne H. Sørensen、Claus Nielsen、Poul Nielsen

  DOI：10.1021/jo010299j

  日期：2001.7.1

  beta-nucleoside analogue 5 has been designed as a conformationally restricted analogue of the anti-HIV drug AZT. The synthesis of 5 as well as its alpha-anomer 29 is hereby described. The synthesis was accomplished from D-arabinose via a modified Corey-Link procedure stereoselectively incorporating the azide moiety as well as a methyl ester function. When the tert-butyldiphenylsilyl group was used as a permanent

  [3.2.0]双环β-核苷类似物5已被设计为抗HIV药物AZT的构象受限类似物。因此描述了5及其α-端基异构体29的合成。由D-阿拉伯糖通过改良的Corey-Link程序完成立体合成，该程序立体选择性地合并了叠氮化物部分以及甲酯功能。当叔丁基二苯基甲硅烷基用作永久保护基时，氧杂环丁烷环的选择性形成失败。当使用对甲氧基苯基作为永久保护基时，通过酯的选择性还原，核碱基偶联，随后的端基异构体的分离和闭环程序有效地获得了5和29。核苷5在构型上受限于异常的O4'-内（东）构象，这是北方型和南方型构象之间的中间产物。然而，5和29均未显示出任何抗HIV活性。