N-[5-(3-carbomethoxyphenyl)-1(S)-cyanopentyl]-3-methyl-Nα-(tert-butoxycarbonyl)-L-phenylalaninamide | 389600-29-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[5-(3-carbomethoxyphenyl)-1(S)-cyanopentyl]-3-methyl-Nα-(tert-butoxycarbonyl)-L-phenylalaninamide
• 英文别名: methyl 3-[(4S)-4-cyano-4-[[(2S)-3-(3-methylphenyl)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]propanoyl]amino]butyl]benzoate
• CAS: 389600-29-7
• 化学式: C₂₈H₃₅N₃O₅
• 分子量: 493.603
• InChiKey: YOTWKEBQHCAZRI-ZEQRLZLVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[5-(3-carbomethoxyphenyl)-1(S)-cyanopentyl]-3-methyl-Nα-(tert-butoxycarbonyl)-L-phenylalaninamide 在 N-甲基吗啉 、 甲酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 N-[4-(3-methoxycarbonyl-phenyl)-1(S)-cyanobutyl]-3-methyl-Nα-(2,2-diphenylacetyl)-L-phenylalaninamide
  参考文献：
  名称：

  通过基于结构的药物设计，确定二肽腈为组织蛋白酶B的有效抑制剂和选择性抑制剂。

  摘要：

  组织蛋白酶B是半胱氨酸蛋白酶的木瓜蛋白酶超家族的成员，并且已与包括关节炎和癌症在内的多种疾病的病理学有关。为了确定这种蛋白酶的有效可逆抑制剂，我们从先前报道的Cbz-Phe-NH-CH（2）CN（19，IC（50）= 62 microM）开始检查了一系列二肽腈。 。高分辨率X射线晶体学数据和分子模型被用来优化此模板的P（1），P（2）和P（3）取代基。组织蛋白酶B在其类别中是独特的，因为它在活性位点的S（2）'口袋中包含一个羧酸盐识别位点。通过束缚从碳α到腈的羧酸盐官能团来与酶的该区域相互作用，可以提高抑制剂的效力和选择性。

  DOI：

  10.1021/jm010206q
• 作为产物：
  描述：

  3-甲基苄溴 在 N-甲基吗啉 、 吡啶 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 草酰氯 、 sodium hydride 、 溶剂黄146 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 正己烷 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 N-[5-(3-carbomethoxyphenyl)-1(S)-cyanopentyl]-3-methyl-Nα-(tert-butoxycarbonyl)-L-phenylalaninamide
  参考文献：
  名称：

  通过基于结构的药物设计，确定二肽腈为组织蛋白酶B的有效抑制剂和选择性抑制剂。

  摘要：

  组织蛋白酶B是半胱氨酸蛋白酶的木瓜蛋白酶超家族的成员，并且已与包括关节炎和癌症在内的多种疾病的病理学有关。为了确定这种蛋白酶的有效可逆抑制剂，我们从先前报道的Cbz-Phe-NH-CH（2）CN（19，IC（50）= 62 microM）开始检查了一系列二肽腈。 。高分辨率X射线晶体学数据和分子模型被用来优化此模板的P（1），P（2）和P（3）取代基。组织蛋白酶B在其类别中是独特的，因为它在活性位点的S（2）'口袋中包含一个羧酸盐识别位点。通过束缚从碳α到腈的羧酸盐官能团来与酶的该区域相互作用，可以提高抑制剂的效力和选择性。

  DOI：

  10.1021/jm010206q