蛋白质
碳水化合物的识别对于许多
生物学过程至关重要。在这种认识中,
碳水化合物-芳香族堆积是一种广泛的但了解很少的结构基序。我们第一次描述了
碳水化合物-芳香族相互作用对悬挂端DNA模型系统稳定性的贡献的测量。我们观察到几种
单糖与
苯部分相互作用的能量学上存在明显差异,具体取决于羟基数,立体
化学和
吡喃糖环中
甲基的存在。岩藻糖-
苯对是所研究系列中最稳定的(-0.4 Kcal mol(-1)),并且该相互作用与其他与蛋白质芳香族残基(例如Phe-Phe, Phe-Met,或Phe-His。涉及的非共价力似乎是分散力和非常规的
氢键,而疏
水作用似乎并不驱动相互作用。