agelastatin A

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: agelastatin A
• 英文别名: (±)-agelastatin A；(1S,9R,10R,14R)-3-bromo-14-hydroxy-13-methyl-2,8,11,13-tetrazatetracyclo[7.6.0.02,6.010,14]pentadeca-3,5-diene-7,12-dione
• 化学式: C₁₂H₁₃BrN₄O₃
• 分子量: 341.164
• InChiKey: MPASKXAEPUAMBS-FNQQPIMXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  86.6
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  agelastatin A 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 异丙醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 debromoagelastatin A
  参考文献：
  名称：

  Potent Fluorinated Agelastatin Analogues for Chronic Lymphocytic Leukemia: Design, Synthesis, and Pharmacokinetic Studies

  摘要：

  Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is the most common lymphoid neoplasia in Western societies and is currently incurable. Multiple treatment options are practiced, but the available small molecule drugs suffer from dose-limiting toxicity and undesirable side effects. The need for new, less toxic treatments is a pressing concern. Here, we demonstrate that (-)-agelastatin A (1a), a pyrrole-imidazole alkaloid obtained from a marine sponge, exhibits potent in vitro activity against primary cell lines of CLL and disclose the synthesis of several analogues that are equipotent or exceed the potency of the natural product. The novel synthetic analogue, 13-debromo-13-trifluoromethyl agelastatin A (1j), showed higher activity than the natural product when tested against the same cell lines and is the most potent agelastatin derivative reported to date. A detailed in vitro structure-activity relationship of 1a in CLL compared to that of 22 synthetic analogues is described along with preliminary in vivo pharmacokinetic and metabolism studies on the most potent compounds.

  DOI：

  10.1021/jm4016922
• 作为产物：
  描述：

  N-[(2S,5R,6S)-12-bromo-7-methoxy-4,8-dioxo-1,7-diazatricyclo[7.3.0.02,6]dodeca-9,11-dien-5-yl]-4-methylbenzenesulfonamide 在 samarium diiodide 、 caesium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 苯 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 agelastatin A
  参考文献：
  名称：

  用于钯催化的不对称烯丙基烷基化的新型亲核试剂。Agelastatin A的全合成

  摘要：

  为 Pd 催化的 AAA 反应开发了新类别的亲核试剂、吡咯和 N-甲氧基酰胺。通过改变吡咯 2 位的官能团，可以得到哌嗪酮的任一区域异构体。使用一种区域异构体，在 10 个总步骤中完成 (+)-agelastatin A 的全合成。对于该合成，开发了新的铜催化氮丙啶化和铟催化氧化开环 N-甲苯磺酰氮丙啶。表明了从另一个区域异构哌嗪酮的手性催化剂的相同对映异构体获得 (-)-agelastatin A 的可行性。

  DOI：

  10.1021/ja061105q

文献信息

• Synthesis of agelastatin A and derivatives premised on a hidden symmetry element leading to analogs displaying anticancer activity
  作者：Haoran Xue、Haleigh Svatek、Ariane F. Bertonha、Keighley Reisenauer、Joshua Robinson、Minwoo Kim、Alec Ingros、Matthew Ho、Joseph Taube、Daniel Romo

  DOI：10.1016/j.tet.2021.132340

  日期：2021.8

  Concise total syntheses of (±)-7-hydroxy debromo agelastatin A (AglA), (±)-AglA, and 11-nitro AglA are presented based on an identified pseudo-symmetry element. This synthetic strategy was developed based on a desire to improve solubility of this potent anticancer agent while also developing a synthetic strategy that would enable latestage variation of the pyrrole moiety. A stability study of pyrrole-derived

  (±)-7-羟基 debromo agelastatin A (AglA)、(±)-AglA 和 11-硝基 AglA 的简明全合成基于已确定的伪对称元素。这种合成策略是基于提高这种强效抗癌剂溶解度的愿望而开发的，同时还开发了一种能够实现吡咯部分最新变化的合成策略。吡咯衍生的甲醇胺的稳定性研究揭示了影响环状甲醇胺和酮吡咯形式之间平衡的关键取代基效应。7-羟基AglA 主要以酮吡咯形式存在，但脱溴变体主要以环状甲醇胺形式存在。
• A Stereodivergent Strategy to Both Product Enantiomers from the Same Enantiomer of a Stereoinducing Catalyst: Agelastatin A
  作者：Barry M. Trost、Guangbin Dong

  DOI：10.1002/chem.200900794

  日期：2009.7.13

  we report a full account of our recent development of pyrroles and N‐alkoxyamides as new classes of nucleophiles for palladium‐catalyzed AAA reactions, along with application of these methodologies in the total synthesis of agelastatin A, a marine natural product with exceptional anticancer activity and other biological properties. Our method allows for access to either regioisomer of the pyrrolopiperazinones

  在本文中，我们全面介绍了我们最近开发的吡咯和N-烷氧基酰胺作为用于钯催化 AAA 反应的新型亲核试剂，以及这些方法在全合成中的应用，agelastatin A 是一种海洋天然产物特殊的抗癌活性和其他生物学特性。我们的方法允许以高效率和对映选择性获得吡咯并哌嗪酮的任一区域异构体（6和19）。请注意，异构体19是通过双烯丙基烷基化途径通过级联反应获得的。从区域异构体6 开始，(+)-agelastatin A 的全合成以非常短的方式完成（从6)，在此过程中，我们开发了一种用于氮丙啶化的新型铜催化剂和一种用于氧化打开N-甲苯磺酰基氮丙啶的 In(OTf) 3 /DMSO 系统。从其他吡咯并哌嗪酮19 开始，已经开发了一个五步序列来提供 (-)-agelastatin A 的正式全合成。我们合成的一个独特之处是使用两种截然不同的策略对两种对映异构体进行全合成使用相同的手性钯催化剂对映异构体制备agelastatin
• Total Synthesis of the Antitumor Marine Sponge Alkaloid Agelastatin A
  作者：Didier Stien、Glen T. Anderson、Charles E. Chase、Yung-hyo Koh、Steven M. Weinreb

  DOI：10.1021/ja992487l

  日期：1999.10.1

  The first total synthesis of the cytotoxic marine metabolite agelastatin A (1) has been achieved in about 14 steps performed in 12 operations in approximately 7% overall yield starting from cyclopentadiene. Hetero Diels−Alder cycloaddition of cyclopentadiene with N-sulfinyl methyl carbamate (7) afforded cycloadduct 8, which without purification was converted to allylic sulfoxide 9 and then by a [2

  从环戊二烯开始，细胞毒性海洋代谢物agelastatin A (1) 的首次全合成在12 次操作中以大约7% 的总产率进行了大约14 个步骤。环戊二烯与 N-亚磺酰基甲基氨基甲酸酯 (7) 的杂 Diels-Alder 环加成得到环加合物 8，其无需纯化即可转化为烯丙基亚砜 9，然后通过 [2,3]-σ 重排转化为双环恶唑烷酮 11。C-5a通过与 SES 磺基二亚胺 12c 的 Sharpless/Kresze 烯丙基胺化，将氮引入恶唑烷酮 Boc 衍生物 16。钯促进的 2-酰基吡咯 20 和 21 通过 π-烯丙基钯中间体 22 的环化分别导致 ABC-三环 23 和 24。通过硼氢化24构建羟基脲D环模型体系，
• Derivatization of agelastatin A leading to bioactive analogs and a trifunctional probe
  作者：Morgan Jouanneau、Brandon McClary、Jeremy Chris P. Reyes、Rong Chen、Yuling Chen、William Plunkett、Xin Cheng、Andrew Z. Milinichik、Earl F. Albone、Jun O. Liu、Daniel Romo

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.02.051

  日期：2016.4

  AglA (12), that retained activity toward various cancer cell lines with decreased toxicity toward B- and T-cells. The SAR data informed the synthesis of a trifunctional probe bearing an alkyne and a diazirine potentially useful for cellular target identification.

  （-）-Agelastatin A（AglA，1）是吡咯-氨基咪唑海洋生物碱（PAI）家族的成员，具有独特的四环结构，并且是迄今为止分离出的最有效的抗癌PAI之一。为了扩大这些药物的SAR值并勾勒出在保留活性的情况下可以耐受修饰的位点，我们合成了几种衍生物并测试了它们的抗癌活性。测量了这些衍生物对几种癌细胞系的细胞毒性作用，包括宫颈癌（HeLa），表皮样癌（A431），卵巢癌（Igrov和Ovcar3），骨肉瘤（SJSA1），急性T细胞白血病（A3），表皮样癌（A431） ）以及人类原发性慢性淋巴细胞白血病（CLL）细胞。探索了修饰AglA的新位置和新的取代基，从而产生了新的衍生物14-氯AglA（3）和14-甲基Ag1A（12），它们保留了对多种癌细胞系的活性，而对B细胞和T细胞的毒性却降低了。SAR数据告知了带有炔烃和二嗪的三功能探针的合成，这些探针可能对细胞靶标识别有用。
• A Short Total Synthesis of the Marine Sponge Pyrrole-2-aminoimidazole Alkaloid (±)-Agelastatin A
  作者：Petar A. Duspara、Robert A. Batey

  DOI：10.1002/anie.201304759

  日期：2013.10.4

  electrocyclization and elaborated using newly developed protocols for urea and amide formation. Oxidation of an unprotected pre‐agelastatin A and an intramolecular aza‐Michael reaction completed the synthesis in only six steps.

  逐环：（±）‐Agelastatin A是通过使用多米诺骨牌和一锅法反应合成的，同时最大程度地减少了保护基的使用。通过立体选择性多米诺缩合/开环/4π-旋转电环化反应来访问该核，并使用新开发的尿素和酰胺形成方案对其进行了详细说明。未保护的前抗弹性蛋白A的氧化和分子内的aza-Michael反应仅需六个步骤即可完成合成。