2-amino-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide | 1360535-79-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2-amino-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide
• 英文别名: 2-amino-N-[6-(6-pyridin-2-yl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl]acetamide
• CAS: 1360535-79-0
• 化学式: C₁₄H₁₂N₈O
• 分子量: 308.302
• InChiKey: QHEBBCUSOOBLQV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.9
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.07
• 拓扑面积：
  133
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-amino-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide 、 5-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 以3 mg的产率得到2-(6-(dimethylamino)-3-(dimethyliminio)-3H-xanthen-9-yl)-5-((2-oxo-2-((6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)amino)ethyl)carbamoyl)benzoate
  参考文献：
  名称：

  螺己烯-四嗪连接使活细胞中 BG 类蛋白偶联受体的生物正交标记成为可能

  摘要：

  一种新的生物正交反应物对，spiro[2.3]hex-1-ene (Sph) 和 3,6-di(2-pyridyl)-s-tetrazine (DpTz)，用于应变促进的逆电子需求 Diels-Alder 环加成，即四嗪连接，据报道。与先前报道的应变烯烃如反式环辛烯 (TCO) 和 1,3-二取代环丙烯相比，Sph 在四嗪与蛋白质底物的连接中表现出平衡的反应性和稳定性。Sph 的赖氨酸衍生物 SphK 被位点选择性地整合到 GCGR 和 GLP-1R 的细胞外环区 (ECL) 中，GCGR 和 GLP-1R 是哺乳动物细胞中 BG 类蛋白偶联受体 (GPCR) 的两个成员，其掺入效率取决于地点。随后与荧光团缀合的 DpTz 试剂进行生物正交反应，得到荧光标记的 GCGR 和 GLP-1R ECL 突变体，标记产率高达 68%。对这些 GPCR 突变体进行了多种功能分析，包括配体结合、配体诱导的受体内化和配体刺激的细胞内

  DOI：

  10.1021/jacs.7b05674
• 作为产物：
  描述：

  PY-2H-四嗪-PY-NHBOC 在 盐酸 、 溶剂黄146 、 sodium nitrite 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 2-amino-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  螺己烯-四嗪连接使活细胞中 BG 类蛋白偶联受体的生物正交标记成为可能

  摘要：

  一种新的生物正交反应物对，spiro[2.3]hex-1-ene (Sph) 和 3,6-di(2-pyridyl)-s-tetrazine (DpTz)，用于应变促进的逆电子需求 Diels-Alder 环加成，即四嗪连接，据报道。与先前报道的应变烯烃如反式环辛烯 (TCO) 和 1,3-二取代环丙烯相比，Sph 在四嗪与蛋白质底物的连接中表现出平衡的反应性和稳定性。Sph 的赖氨酸衍生物 SphK 被位点选择性地整合到 GCGR 和 GLP-1R 的细胞外环区 (ECL) 中，GCGR 和 GLP-1R 是哺乳动物细胞中 BG 类蛋白偶联受体 (GPCR) 的两个成员，其掺入效率取决于地点。随后与荧光团缀合的 DpTz 试剂进行生物正交反应，得到荧光标记的 GCGR 和 GLP-1R ECL 突变体，标记产率高达 68%。对这些 GPCR 突变体进行了多种功能分析，包括配体结合、配体诱导的受体内化和配体刺激的细胞内

  DOI：

  10.1021/jacs.7b05674

文献信息

• Genetically encoded norbornene directs site-specific cellular protein labelling via a rapid bioorthogonal reaction
  作者：Kathrin Lang、Lloyd Davis、Jessica Torres-Kolbus、Chungjung Chou、Alexander Deiters、Jason W. Chin

  DOI：10.1038/nchem.1250

  日期：2012.4

  The site-specific incorporation of bioorthogonal groups via genetic code expansion provides a powerful general strategy for site-specifically labelling proteins with any probe. However, the slow reactivity of the bioorthogonal functional groups that can be encoded genetically limits the utility of this strategy. We demonstrate the genetic encoding of a norbornene amino acid using the pyrrolysyl tRNA

  通过遗传密码扩展对生物正交基团进行位点特异性结合，为使用任何探针对蛋白质进行位点特异性标记提供了强大的通用策略。然而，可以遗传编码的生物正交官能团的缓慢反应性限制了该策略的实用性。我们在大肠杆菌和哺乳动物细胞中使用吡咯赖氨酰 tRNA 合成酶/tRNA CUA对证明了降冰片烯氨基酸的遗传编码。我们开发了一系列基于四嗪的探针，它们在与降冰片烯的快速反应中表现出“开启”荧光。我们证明编码的降冰片烯的标记对于整个可溶性大肠杆菌是特异性的蛋白质组学，并且比已建立的可编码生物正交反应快数千倍。我们明确地展示了这种方法相对于最先进的生物正交反应在体外和哺乳动物细胞上进行蛋白质标记的优势，并证明了哺乳动物细胞表面蛋白质的快速生物正交位点特异性标记。
• [EN] CYCLOPROPENE AMINO ACIDS AND METHODS<br/>[FR] ACIDES AMINÉS DE CYCLOPROPÈNE ET PROCÉDÉS
  申请人：MEDICAL RES COUNCIL

  公开号：WO2015136265A1

  公开（公告）日：2015-09-17

  The invention relates to a polypeptide comprising an amino acid having a cyclopropene group wherein said cyclopropene group is joined to the amino acid via a carbamate group. Suitably the cyclopropene group is a 1,3-disubstituted cyclopropene such as a 1,3-di methylcyclopropene. Suitably the cyclopropene group is present as a residue of a lysine amino acid. The invention also relates to methods of making the polypeptides. The invention also relates to an amino acid comprising cyclopropene wherein said cyclopropene group is joined to the amino acid moiety via a carbamate group.

  该发明涉及一种多肽，其中包含具有环丙烯基的氨基酸，其中所述环丙烯基通过碳酸酯基连接到氨基酸上。适当的环丙烯基是1,3-二取代环丙烯，例如1,3-二甲基环丙烯。适当的环丙烯基以赖氨酸氨基酸的残基形式存在。该发明还涉及制备多肽的方法。该发明还涉及一种包含环丙烯基的氨基酸，其中所述环丙烯基通过碳酸酯基连接到氨基酸基团上。
• Intracellular bioorthogonal labeling of glucagon receptor via tetrazine ligation
  作者：Yulin Tian、Ming Fang、Qing Lin

  DOI：10.1016/j.bmc.2021.116256

  日期：2021.8

  microscopic study of intracellular fluorescent labeling of ICL3 using a bioorthogonal chemistry strategy. Our approach involves the site-specific introduction of a strained alkene amino acid into the ICL3 through genetic code expansion, followed by a highly specific inverse electron-demand Diels-Alder reaction with the fluorescent tetrazine probes. Among the three strained alkene amino acids examined, both

  胰高血糖素受体 (GCGR) 胞质表面的第三个细胞内环 (ICL3) 在受体激活期间经历显着的构象转变。因此，它为在我们构建基于荧光的 GPCR 生物传感器的努力中引入有机荧光团提供了一个有吸引力的场所。在这里，我们报告了我们使用生物正交化学策略对 ICL3 的细胞内荧光标记的共聚焦显微镜研究。我们的方法包括通过遗传密码扩展将应变烯烃氨基酸位点特异性引入 ICL3，然后与荧光四嗪探针进行高度特异性的逆电子需求 Diels-Alder 反应。在所检查的三种应变烯烃氨基酸中，SphK 和 2'-aTCOK 都使用适当的四嗪探针成功地对 GCGR ICL3 进行了荧光标记。同时，4'-TCOK 由于其细胞内保留而产生高背景荧光。荧光四嗪探针是按照无背景细胞内荧光标记的计算模型设计的；然而，由于强的非特异性信号会干扰特定信号，它们在活细胞成像中的表现差异很大。在所有带有应变烯烃的 GCGR ICL3
• Rapid probing of sialylated glycoproteins in vitro and in vivo via metabolic oligosaccharide engineering of a minimal cyclopropene reporter
  作者：De-Cai Xiong、Jingjing Zhu、Ming-Jie Han、Hui-Xin Luo、Cong Wang、Yang Yu、Yuqian Ye、Guihua Tai、Xin-Shan Ye

  DOI：10.1039/c5ob00069f

  日期：——

  A minimal and efficient cyclopropene chemical handle was identified bothin vitroandin vivo.

  一种最小且高效的环丙烯化学手柄在体外和体内均被发现。
• Modular, Bioorthogonal Strategy for the Controlled Loading of Cargo into a Protein Nanocage
  作者：Lise Schoonen、Selma Eising、Mark B. van Eldijk、Jaleesa Bresseleers、Margo van der Pijl、Roeland J. M. Nolte、Kimberly M. Bonger、Jan C. M. van Hest

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.7b00815

  日期：2018.4.18

  site-specific N-terminal protein modification was employed. This method allowed the successful modification of the proteins, and was applied for the introduction of a bioorthogonal vinylboronic acid moiety. In a subsequent reaction, the proteins could be modified further with a fluorophore using the tetrazine ligation. The application of capsid assembly conditions on the functionalized proteins led to successful

  病毒衣壳，即没有遗传物质的病毒，是适用于生物医学应用（如药物输送和诊断成像）的纳米载体。为此目的，将货物可靠地封装在这种蛋白质纳米笼中至关重要，这可以通过将目标化合物与笼子内部的蛋白质结构域共价结合来实现。这种方法对the豆绿叶斑驳病毒（CCMV）的衣壳蛋白特别有效，这些蛋白的N末端位于衣壳结构内部。在这里，我们检查了几种在CCMV蛋白N端共价连接和包裹货物的位点选择性修饰方法。最初，我们探索了引入N末端叠氮化物功能的方法，这将允许随后使用应变炔烃进行生物正交修饰，以连接所需的货物。由于这些方法显示出与CCMV衣壳蛋白的相容性问题，因此采用了基于2-吡啶甲醛进行位点特异性N末端蛋白修饰的策略。该方法成功修饰了蛋白质，并被用于引入生物正交的乙烯基硼酸部分。在随后的反应中，可以使用四嗪连接，用荧光团进一步修饰蛋白质。衣壳装配条件在功能化蛋白质上的应用导致成功的颗粒形成，显示了这种共价包封策略的