2-(Boc-amino)-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide | 1360467-31-7

• 英文名称: 2-(Boc-amino)-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide
• 英文别名: tert-Butyl (2-oxo-2-((6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)amino)ethyl)carbamate；tert-butyl N-[2-oxo-2-[[6-(6-pyridin-2-yl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl]amino]ethyl]carbamate
• CAS: 1360467-31-7
• 化学式: C₁₉H₂₀N₈O₃
• 分子量: 408.42
• InChiKey: RLXPTOVWTCBSAM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  145
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(Boc-amino)-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide 在 盐酸 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  遗传密码扩展使位点特异性标记的细胞蛋白的活细胞和超分辨率成像成为可能

  摘要：

  在细胞超微结构中使用小的、明亮的和光稳定的荧光团对蛋白质进行位点特异性和密集标记的方法将大大推进超分辨率成像。遗传密码扩展和生物正交化学的最新进展使蛋白质的位点特异性标记成为可能。然而，尚未实现将非天然氨基酸有效纳入蛋白质中，以及它们为亚衍射成像形成的细胞内超微结构的特异性荧光标记。有两个挑战限制了该领域的进展：(i) 非天然氨基酸掺入效率低，限制了标记密度，因此限制了空间分辨率；(ii) 细胞内标记的无特征特异性将定义信噪比和最终分辨率，在成像方面。在这里，我们证明了在基因定义的位点有效生产含有双环 [6.1.0] 壬炔-赖氨酸的囊骨架蛋白（β-肌动蛋白和波形蛋白）。我们使用四嗪-荧光团缀合物证明了它们对活细胞蛋白质组的选择性荧光标记，从而创建了密集标记的细胞骨架超微结构。这些密集标记的超微结构的 STORM 成像揭示了亚衍射特征，包括核肌动蛋白丝。这项工作能够以高密度对细胞内蛋白质进行

  DOI：

  10.1021/ja512838z
• 作为产物：
  描述：

  PY-2H-四嗪-PY-NHBOC 在 溶剂黄146 、 sodium nitrite 作用下， 反应 0.17h， 以51%的产率得到2-(Boc-amino)-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  乙烯基硼酸笼罩的前药激活，使用点击释放四嗪连接。

  摘要：

  可以在任何生物官能团的存在下选择性地进行生物正交反应，并广泛用于实现生物分子的位点选择性化学修饰。点击释放反应是一种生物正交键断裂变体，在最近几年中引起了人们的极大兴趣。例如，四嗪与反式环辛烯或乙烯基醚之间的生物正交反应可在与四嗪环加成后立即引发小分子的释放。最近，我们的小组报告说，乙烯基硼酸（VBA）在与被硼配位配体取代的四嗪发生的生物正交逆电子需求的Diels-Alder反应中具有极高的反应速率。在目前的研究中，我们展示了VBA可以用于点击释放变体，并展示了其与VBA保护的阿霉素前药的生物正交性。我们表明，阿霉素通过VBA的连接沉默了细胞毒性，并且在与四嗪反应后可以很大程度上恢复活性，从而诱导细胞死亡。

  DOI：

  10.1039/c9ob01881f

文献信息

• Genetically encoded norbornene directs site-specific cellular protein labelling via a rapid bioorthogonal reaction
  作者：Kathrin Lang、Lloyd Davis、Jessica Torres-Kolbus、Chungjung Chou、Alexander Deiters、Jason W. Chin

  DOI：10.1038/nchem.1250

  日期：2012.4

  The site-specific incorporation of bioorthogonal groups via genetic code expansion provides a powerful general strategy for site-specifically labelling proteins with any probe. However, the slow reactivity of the bioorthogonal functional groups that can be encoded genetically limits the utility of this strategy. We demonstrate the genetic encoding of a norbornene amino acid using the pyrrolysyl tRNA

  通过遗传密码扩展对生物正交基团进行位点特异性结合，为使用任何探针对蛋白质进行位点特异性标记提供了强大的通用策略。然而，可以遗传编码的生物正交官能团的缓慢反应性限制了该策略的实用性。我们在大肠杆菌和哺乳动物细胞中使用吡咯赖氨酰 tRNA 合成酶/tRNA CUA对证明了降冰片烯氨基酸的遗传编码。我们开发了一系列基于四嗪的探针，它们在与降冰片烯的快速反应中表现出“开启”荧光。我们证明编码的降冰片烯的标记对于整个可溶性大肠杆菌是特异性的蛋白质组学，并且比已建立的可编码生物正交反应快数千倍。我们明确地展示了这种方法相对于最先进的生物正交反应在体外和哺乳动物细胞上进行蛋白质标记的优势，并证明了哺乳动物细胞表面蛋白质的快速生物正交位点特异性标记。
• Spirohexene-Tetrazine Ligation Enables Bioorthogonal Labeling of Class B G Protein-Coupled Receptors in Live Cells
  作者：Carlo P. Ramil、Maoqing Dong、Peng An、Tracey M. Lewandowski、Zhipeng Yu、Laurence J. Miller、Qing Lin

  DOI：10.1021/jacs.7b05674

  日期：2017.9.27

  regions (ECLs) of GCGR and GLP-1R, two members of class B G protein-coupled receptors (GPCRs) in mammalian cells with the incorporation efficiency dependent on the location. Subsequent bioorthogonal reactions with the fluorophore-conjugated DpTz reagents afforded the fluorescently labeled GCGR and GLP-1R ECL mutants with labeling yield as high as 68%. A multitude of functional assays were performed with

  一种新的生物正交反应物对，spiro[2.3]hex-1-ene (Sph) 和 3,6-di(2-pyridyl)-s-tetrazine (DpTz)，用于应变促进的逆电子需求 Diels-Alder 环加成，即四嗪连接，据报道。与先前报道的应变烯烃如反式环辛烯 (TCO) 和 1,3-二取代环丙烯相比，Sph 在四嗪与蛋白质底物的连接中表现出平衡的反应性和稳定性。Sph 的赖氨酸衍生物 SphK 被位点选择性地整合到 GCGR 和 GLP-1R 的细胞外环区 (ECL) 中，GCGR 和 GLP-1R 是哺乳动物细胞中 BG 类蛋白偶联受体 (GPCR) 的两个成员，其掺入效率取决于地点。随后与荧光团缀合的 DpTz 试剂进行生物正交反应，得到荧光标记的 GCGR 和 GLP-1R ECL 突变体，标记产率高达 68%。对这些 GPCR 突变体进行了多种功能分析，包括配体结合、配体诱导的受体内化和配体刺激的细胞内
• Genetic Encoding of Bicyclononynes and <i>trans</i>-Cyclooctenes for Site-Specific Protein Labeling in Vitro and in Live Mammalian Cells via Rapid Fluorogenic Diels–Alder Reactions
  作者：Kathrin Lang、Lloyd Davis、Stephen Wallace、Mohan Mahesh、Daniel J. Cox、Melissa L. Blackman、Joseph M. Fox、Jason W. Chin

  DOI：10.1021/ja302832g

  日期：2012.6.27

  site-specific labeling of proteins with diverse probes remains an outstanding challenge for chemical biologists. Enzyme-mediated labeling approaches may be rapid but use protein or peptide fusions that introduce perturbations into the protein under study and may limit the sites that can be labeled, while many “bioorthogonal” reactions for which a component can be genetically encoded are too slow to effect

  用多种探针对蛋白质进行快速、位点特异性标记仍然是化学生物学家面临的一项重大挑战。酶介导的标记方法可能很快，但使用的蛋白质或肽融合将扰动引入正在研究的蛋白质中，并可能限制可标记的位点，而许多可以通过基因编码的成分的“生物正交”反应太慢而无法进行在时间尺度上对蛋白质进行定量的位点特异性标记，这对研究许多生物过程很有用。我们报告了双环[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol (BCN) 和四嗪之间的荧光反应，比许多生物正交反应快 3-7 个数量级。与应变烯烃（包括反式环辛烯和降冰片烯）与四嗪的反应不同，BCN-四嗪反应产生了确定立体化学的单一产物。我们发现了氨酰-tRNA 合成酶/tRNA 对，可将含 BCN 的氨基酸 1 和含反式环辛烯的氨基酸 2（也与四嗪反应极快）有效位点特异性掺入表达于大肠杆菌和哺乳动物细胞。我们展示了在体外、大肠杆菌和活哺乳动物细胞中对含有 1 和 2
• Vinylboronic Acids as Fast Reacting, Synthetically Accessible, and Stable Bioorthogonal Reactants in the Carboni-Lindsey Reaction
  作者：Selma Eising、Francis Lelivelt、Kimberly M. Bonger

  DOI：10.1002/anie.201605271

  日期：2016.9.26

  27 m(-1)  s(-1) in aqueous environments at room temperature, which is suitable for biological labeling applications. The VBAs are shown to be biocompatible, non-toxic, and highly stable in aqueous media and cell lysate. Furthermore, VBAs can be used orthogonally to the strain-promoted alkyne-azide cycloaddition for protein modification, making them attractive complements to the bioorthogonal molecular

  生物正交反应被广泛用于生物分子的化学修饰。描述了乙烯基硼酸（VBA）作为非应变，可合成合成的水溶性反应伙伴在3,6-dipyridyl-s-tetrazines的生物正交反电子需求Diels-Alder（iEDDA）反应中的应用。根据取代基的不同，VBA衍生物在室温下在水性环境中的二阶速率常数高达27 m（-1）s（-1），适用于生物标记应用。VBA在水介质和细胞裂解液中显示出生物相容性，无毒且高度稳定。此外，VBA可以与应变促进的炔-叠氮化物环加成反应正交用于蛋白质修饰，从而使其成为生物正交分子工具箱的诱人补充。
• [EN] CYCLOPROPENE AMINO ACIDS AND METHODS<br/>[FR] ACIDES AMINÉS DE CYCLOPROPÈNE ET PROCÉDÉS
  申请人：MEDICAL RES COUNCIL

  公开号：WO2015136265A1

  公开（公告）日：2015-09-17

  The invention relates to a polypeptide comprising an amino acid having a cyclopropene group wherein said cyclopropene group is joined to the amino acid via a carbamate group. Suitably the cyclopropene group is a 1,3-disubstituted cyclopropene such as a 1,3-di methylcyclopropene. Suitably the cyclopropene group is present as a residue of a lysine amino acid. The invention also relates to methods of making the polypeptides. The invention also relates to an amino acid comprising cyclopropene wherein said cyclopropene group is joined to the amino acid moiety via a carbamate group.

  该发明涉及一种多肽，其中包含具有环丙烯基的氨基酸，其中所述环丙烯基通过碳酸酯基连接到氨基酸上。适当的环丙烯基是1,3-二取代环丙烯，例如1,3-二甲基环丙烯。适当的环丙烯基以赖氨酸氨基酸的残基形式存在。该发明还涉及制备多肽的方法。该发明还涉及一种包含环丙烯基的氨基酸，其中所述环丙烯基通过碳酸酯基连接到氨基酸基团上。