PY-2H-四嗪-PY-NHBOC | 1360467-39-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: PY-2H-四嗪-PY-NHBOC
• 英文名称: 2-(Boc-amino)-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,4-dihydro-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide
• 英文别名: Py-2H-Tetrazine-Py-NHBoc；tert-butyl N-[2-oxo-2-[[6-(6-pyridin-2-yl-1,4-dihydro-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl]amino]ethyl]carbamate
• CAS: 1360467-39-5
• 化学式: C₁₉H₂₂N₈O₃
• 分子量: 410.435
• InChiKey: KNBKJTLCQAJECX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  142
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  PY-2H-四嗪-PY-NHBOC 在 溶剂黄146 、 sodium nitrite 作用下， 反应 0.17h， 以51%的产率得到2-(Boc-amino)-N-(6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  乙烯基硼酸笼罩的前药激活，使用点击释放四嗪连接。

  摘要：

  可以在任何生物官能团的存在下选择性地进行生物正交反应，并广泛用于实现生物分子的位点选择性化学修饰。点击释放反应是一种生物正交键断裂变体，在最近几年中引起了人们的极大兴趣。例如，四嗪与反式环辛烯或乙烯基醚之间的生物正交反应可在与四嗪环加成后立即引发小分子的释放。最近，我们的小组报告说，乙烯基硼酸（VBA）在与被硼配位配体取代的四嗪发生的生物正交逆电子需求的Diels-Alder反应中具有极高的反应速率。在目前的研究中，我们展示了VBA可以用于点击释放变体，并展示了其与VBA保护的阿霉素前药的生物正交性。我们表明，阿霉素通过VBA的连接沉默了细胞毒性，并且在与四嗪反应后可以很大程度上恢复活性，从而诱导细胞死亡。

  DOI：

  10.1039/c9ob01881f
• 作为产物：
  描述：

  2-氰基吡啶 在 肼 、 氯甲酸异丁酯 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 PY-2H-四嗪-PY-NHBOC
  参考文献：
  名称：

  遗传编码的降冰片烯通过快速生物正交反应指导位点特异性细胞蛋白标记

  摘要：

  通过遗传密码扩展对生物正交基团进行位点特异性结合，为使用任何探针对蛋白质进行位点特异性标记提供了强大的通用策略。然而，可以遗传编码的生物正交官能团的缓慢反应性限制了该策略的实用性。我们在大肠杆菌和哺乳动物细胞中使用吡咯赖氨酰 tRNA 合成酶/tRNA CUA对证明了降冰片烯氨基酸的遗传编码。我们开发了一系列基于四嗪的探针，它们在与降冰片烯的快速反应中表现出“开启”荧光。我们证明编码的降冰片烯的标记对于整个可溶性大肠杆菌是特异性的蛋白质组学，并且比已建立的可编码生物正交反应快数千倍。我们明确地展示了这种方法相对于最先进的生物正交反应在体外和哺乳动物细胞上进行蛋白质标记的优势，并证明了哺乳动物细胞表面蛋白质的快速生物正交位点特异性标记。

  DOI：

  10.1038/nchem.1250

文献信息

• Spirohexene-Tetrazine Ligation Enables Bioorthogonal Labeling of Class B G Protein-Coupled Receptors in Live Cells
  作者：Carlo P. Ramil、Maoqing Dong、Peng An、Tracey M. Lewandowski、Zhipeng Yu、Laurence J. Miller、Qing Lin

  DOI：10.1021/jacs.7b05674

  日期：2017.9.27

  regions (ECLs) of GCGR and GLP-1R, two members of class B G protein-coupled receptors (GPCRs) in mammalian cells with the incorporation efficiency dependent on the location. Subsequent bioorthogonal reactions with the fluorophore-conjugated DpTz reagents afforded the fluorescently labeled GCGR and GLP-1R ECL mutants with labeling yield as high as 68%. A multitude of functional assays were performed with

  一种新的生物正交反应物对，spiro[2.3]hex-1-ene (Sph) 和 3,6-di(2-pyridyl)-s-tetrazine (DpTz)，用于应变促进的逆电子需求 Diels-Alder 环加成，即四嗪连接，据报道。与先前报道的应变烯烃如反式环辛烯 (TCO) 和 1,3-二取代环丙烯相比，Sph 在四嗪与蛋白质底物的连接中表现出平衡的反应性和稳定性。Sph 的赖氨酸衍生物 SphK 被位点选择性地整合到 GCGR 和 GLP-1R 的细胞外环区 (ECL) 中，GCGR 和 GLP-1R 是哺乳动物细胞中 BG 类蛋白偶联受体 (GPCR) 的两个成员，其掺入效率取决于地点。随后与荧光团缀合的 DpTz 试剂进行生物正交反应，得到荧光标记的 GCGR 和 GLP-1R ECL 突变体，标记产率高达 68%。对这些 GPCR 突变体进行了多种功能分析，包括配体结合、配体诱导的受体内化和配体刺激的细胞内
• Vinylboronic Acids as Fast Reacting, Synthetically Accessible, and Stable Bioorthogonal Reactants in the Carboni-Lindsey Reaction
  作者：Selma Eising、Francis Lelivelt、Kimberly M. Bonger

  DOI：10.1002/anie.201605271

  日期：2016.9.26

  27 m(-1)  s(-1) in aqueous environments at room temperature, which is suitable for biological labeling applications. The VBAs are shown to be biocompatible, non-toxic, and highly stable in aqueous media and cell lysate. Furthermore, VBAs can be used orthogonally to the strain-promoted alkyne-azide cycloaddition for protein modification, making them attractive complements to the bioorthogonal molecular

  生物正交反应被广泛用于生物分子的化学修饰。描述了乙烯基硼酸（VBA）作为非应变，可合成合成的水溶性反应伙伴在3,6-dipyridyl-s-tetrazines的生物正交反电子需求Diels-Alder（iEDDA）反应中的应用。根据取代基的不同，VBA衍生物在室温下在水性环境中的二阶速率常数高达27 m（-1）s（-1），适用于生物标记应用。VBA在水介质和细胞裂解液中显示出生物相容性，无毒且高度稳定。此外，VBA可以与应变促进的炔-叠氮化物环加成反应正交用于蛋白质修饰，从而使其成为生物正交分子工具箱的诱人补充。
• A Tri<i>PPP</i>ro‐Nucleotide Reporter with Optimized Cell‐Permeable Dyes for Metabolic Labeling of Cellular and Viral DNA in Living Cells
  作者：Vincente T. Sterrenberg、Dörte Stalling、J. Iven H. Knaack、Timothy K. Soh、Jens B. Bosse、Chris Meier

  DOI：10.1002/anie.202308271

  日期：2023.9.18

  The metabolic labeling of nucleic acids in living cells is highly desirable to track the dynamics of nucleic acid metabolism in real‐time and has the potential to provide novel insights into cellular biology as well as pathogen‐host interactions. Catalyst‐free inverse electron demand Diels–Alder reactions (iEDDA) with nucleosides carrying highly reactive moieties such as axial 2‐trans‐cyclooctene (2TCOa) would be an ideal tool to allow intracellular labeling of DNA. However, cellular kinase phosphorylation of the modified nucleosides is needed after cellular uptake as triphosphates are not membrane permeable. Unfortunately, the narrow substrate window of most endogenous kinases limits the use of highly reactive moieties. Here, we apply our TriPPPro (triphosphate pronucleotide) approach to directly deliver a highly reactive 2TCOa‐modified 2′‐deoxycytidine triphosphate reporter into living cells. We show that this nucleoside triphosphate is metabolically incorporated into de novo synthesized cellular and viral DNA and can be labeled with highly reactive and cell‐permeable fluorescent dye‐tetrazine conjugates via iEDDA to visualize DNA in living cells directly. Thus, we present the first comprehensive method for live‐cell imaging of cellular and viral nucleic acids using a two‐step labeling approach.

  摘要 对活细胞中的核酸进行代谢标记非常有助于实时跟踪核酸代谢的动态，并有可能为细胞生物学以及病原体与宿主之间的相互作用提供新的见解。与携带高活性分子（如轴向 2-反式环辛烯（2TCOa））的核苷进行的无催化剂反电子需求 Diels-Alder 反应（iEDDA）是实现 DNA 细胞内标记的理想工具。然而，由于三磷酸盐不具有膜渗透性，因此细胞摄取后需要细胞激酶对修饰的核苷进行磷酸化。遗憾的是，大多数内源性激酶的底物窗口狭窄，限制了高活性分子的使用。在这里，我们采用 TriPPPro（三磷酸代核苷酸）方法将高活性的 2TCOa 修饰的 2′-脱氧胞苷三磷酸报告物直接输送到活细胞中。我们的研究表明，这种三磷酸核苷可通过新陈代谢结合到新合成的细胞和病毒 DNA 中，并可通过 iEDDA 用高活性和细胞渗透性荧光染料-四嗪共轭物进行标记，从而直接观察活细胞中的 DNA。因此，我们首次提出了利用两步标记法对细胞和病毒核酸进行活细胞成像的综合方法。
• Norbornene Modified Peptides and Their Labelling With Tetrazine Compounds
  申请人：MEDICAL RESEARCH COUNCIL

  公开号：US20150005481A1

  公开（公告）日：2015-01-01

  The invention relates to a polypeptide comprising an amino acid having a norbornene group. Suitably said norbornene group is present as an amino acid residue of a norbornene lysine. The invention also relates to a method of producing a polypeptide comprising a norbornene group, said method comprising genetically incorporating an amino acid comprising a norbornene group into a polypeptide. The polypeptide comprising the norbornene group can be specifically labelled by inverse electron demand Diels-Alder reaction with a tetrazine compound.
• US9968690B2
  申请人：——

  公开号：US9968690B2

  公开（公告）日：2018-05-15