Constrained NBMPR analogue synthesis, pharmacophore mapping and 3D-QSAR modeling of equilibrative nucleoside transporter 1 (ENT1) inhibitory activity
作者:Zhengxiang Zhu、John K. Buolamwini
DOI:10.1016/j.bmc.2008.01.044
日期:2008.4.1
NO(2) group, the benzyl phenyl and the imidazole and pyrimidine portions of the purine ring, respectively. A PHASE 3D-QSAR model derived with this pharmacophore yielded an r(2) of 0.916 for four (4) PLS components, and an excellent external test set predictive r(2) of 0.78 for 39 compounds. This pharmacophore was used for molecular alignment in a comparative molecular field analysis (CoMFA) 3D-QSAR study
进行构象约束类似物合成以帮助硝基苄基巯基嘌呤核苷 (NBMPR) 同源物作为平衡核苷转运蛋白 1 (ENT1) 抑制剂的药效团作图和 3D-QSAR 分析。在我们之前的研究中 [J. 医学。化学 2003, 46, 831-837],合成了 NBMPR 的新型区域异构硝基-1,2,3,4-四氢异喹啉构象限制类似物,并将其评估为 ENT1 配体。7-NO(2)-1,2,3,4-Tetrahydroisoquino-2-yl 嘌呤核苷被确定为在 ENT1 的 NBMPR 结合位点处具有最佳方向硝基的类似物。在本研究中,通过合成 5'-O,8-环衍生物引入了进一步的构象约束。流式细胞仪测定的结合亲和力表明额外的 5'-O,8-环约束不利于与 ENT1 转运蛋白的结合。使用 PHASE 程序将获得的构效关系 (SAR) 应用于药效团作图。获得的最佳药效团假设体现了具有三个氢键受体、一个疏水中心和两个涉及