1-[3,5-di-O-benzyl-4-C-(1-O-acetyl-but-3-enyl)-2-O-phenoxythiocarbonyl-β-D-ribofuranosyl]-thymine | 1095154-33-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-[3,5-di-O-benzyl-4-C-(1-O-acetyl-but-3-enyl)-2-O-phenoxythiocarbonyl-β-D-ribofuranosyl]-thymine
• 英文别名: [(1S)-1-[(2S,3S,4R,5R)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-phenoxycarbothioyloxy-3-phenylmethoxy-2-(phenylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]but-3-enyl] acetate
• CAS: 1095154-33-8
• 化学式: C₃₇H₃₈N₂O₉S
• 分子量: 686.783
• InChiKey: GELJZLIJXPRECN-OJTHSYLMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.6
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  154
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[3,5-di-O-benzyl-4-C-(1-O-acetyl-but-3-enyl)-2-O-phenoxythiocarbonyl-β-D-ribofuranosyl]-thymine 在 偶氮二异丁腈 、 三正丁基氢锡 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 反应 4.0h， 以76%的产率得到(1R,2R,4S,5S,7R,8S)-8-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-2-methyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxabicyclo[3.2.1]octan-4-yl acetate
  参考文献：
  名称：

  通过结合修饰的2'，4'-碳环LNA和-ENAs对核苷酸间磷酸周围的静电进行微调导致反义特性的显着调节

  摘要：

  在反义（AS）和RNA干扰（RNAi）技术中，对天然单链2'-脱氧寡核苷酸（用于AS）或双链RNA（用于RNAi）进行化学修饰，使其与目标RNA结合，从而获得更好的通过抑制RNA翻译来下调基因表达。此处显示了通过改变取代基的静电相互作用以及围绕反义寡核苷酸（AON）-RNA异源双链体的小树林边缘附近的核苷酸间磷酸二酯部分周围的立体化学环境的精细调节，如何导致调节反义性质。通过合成各种修饰的碳环锁核酸（LNA）和在碳环部分连接有羟基和/或甲基取代基的-亚乙基桥核酸（ENA）并通过固相DNA合成将其整合到AON中来证明这一点。 。这些修饰的AON对互补RNA和DNA的靶标亲和力，核酸酶抗性和RNase H诱导表明，修饰的性质（-OH与-CH3）及其相对于邻位磷酸盐的立体化学取向在调节AON特性方面起着非常重要的作用。尽管对靶RNA的亲和力和AONs的酶稳定性受小沟中心的疏水和空间大体积修饰的不

  DOI：

  10.1021/jo8016742
• 作为产物：
  描述：

  1-[3,5-di-O-benzyl-4-C-(1-O-acetyl-but-3-enyl)-β-D-ribofuranosyl]-thymine 、 硫代氯甲酸苯酯 在 吡啶 作用下， 以85%的产率得到1-[3,5-di-O-benzyl-4-C-(1-O-acetyl-but-3-enyl)-2-O-phenoxythiocarbonyl-β-D-ribofuranosyl]-thymine
  参考文献：
  名称：

  通过结合修饰的2'，4'-碳环LNA和-ENAs对核苷酸间磷酸周围的静电进行微调导致反义特性的显着调节

  摘要：

  在反义（AS）和RNA干扰（RNAi）技术中，对天然单链2'-脱氧寡核苷酸（用于AS）或双链RNA（用于RNAi）进行化学修饰，使其与目标RNA结合，从而获得更好的通过抑制RNA翻译来下调基因表达。此处显示了通过改变取代基的静电相互作用以及围绕反义寡核苷酸（AON）-RNA异源双链体的小树林边缘附近的核苷酸间磷酸二酯部分周围的立体化学环境的精细调节，如何导致调节反义性质。通过合成各种修饰的碳环锁核酸（LNA）和在碳环部分连接有羟基和/或甲基取代基的-亚乙基桥核酸（ENA）并通过固相DNA合成将其整合到AON中来证明这一点。 。这些修饰的AON对互补RNA和DNA的靶标亲和力，核酸酶抗性和RNase H诱导表明，修饰的性质（-OH与-CH3）及其相对于邻位磷酸盐的立体化学取向在调节AON特性方面起着非常重要的作用。尽管对靶RNA的亲和力和AONs的酶稳定性受小沟中心的疏水和空间大体积修饰的不

  DOI：

  10.1021/jo8016742