5'-O-(N-(glycyl)sulfamoyl)adenosine | 112921-11-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 5'-O-(N-(glycyl)sulfamoyl)adenosine
• 英文别名: (1Z)-N-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxysulfonyl]-2-azaniumylethanimidate
• CAS: 112921-11-6
• 化学式: C₁₂H₁₇N₇O₇S
• 分子量: 403.376
• InChiKey: AMWPZASLDLLQFT-JJNLEZRASA-N

物化性质

• 密度：
  2.13±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  二甲基亚砜：100 mg/mL（247.91 mM）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.7
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  226
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  12

安全信息

• 储存条件：
  2-8℃

制备方法与用途

生物活性

GlyRS-IN-1 是一种甘氨酰 tRNA 合酶 (GlyRS) 抑制剂，相关详细信息可参考专利 WO 2017066459 A1。此外，GlyRS-IN-1 还能够抑制细菌生长。

靶点

• GlyRS
• 细菌

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  formyl-methionyl-arginyl(2,2,4,6,7-pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonyl)-threonyl(tBu)-glycyl-asparaginyl(trityl)-alanyl-OH 、 5'-O-(N-(glycyl)sulfamoyl)adenosine 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl N-[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-5-[[amino-[(2,2,4,6,7-pentamethyl-3H-1-benzofuran-5-yl)sulfonylamino]methylidene]amino]-2-[[(2S)-2-formamido-4-methylsulfanylbutanoyl]amino]pentanoyl]amino]-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]butanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxo-4-(tritylamino)butanoyl]amino]propanoyl]amino]acetyl]sulfamate
  参考文献：
  名称：

  Extended targeting potential and improved synthesis of Microcin C analogs as antibacterials

  摘要：

  Microcin C (McC) (1) is a potent antibacterial compound produced by some Escherichia coli strains. McC functions through a Trojan-Horse mechanism: it is actively taken up inside a sensitive cell through the function of the YejABEF-transporter and then processed by cellular aminopeptidases. Processed McC (2) is a non-hydrolysable aspartyl-adenylate analog that inhibits aspartyl-tRNA synthetase (AspRS). A new synthesis is described that allows for the production of a wide variety of McC analogs in acceptable amounts. Using this synthesis a number of diverse compounds was synthesized with altered target specificity. Further characteristics of the YejABEF transporters were determined using these compounds. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2011.07.052
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 氨基磺酰氯 、 水 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三氟乙酸 、 三丁基氧化锡 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 苯 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 5'-O-(N-(glycyl)sulfamoyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  A facile synthesis of ascamycin and related analogues

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)89967-1

文献信息

• Exploiting Ligand Conformation in Selective Inhibition of Non-Ribosomal Peptide Synthetase Amino Acid Adenylation with Designed Macrocyclic Small Molecules
  作者：Justin S. Cisar、Julian A. Ferreras、Rajesh K. Soni、Luis E. N. Quadri、Derek S. Tan

  DOI：10.1021/ja0721521

  日期：2007.6.1

  or three-carbon linker between Cβ of the amino acid moiety and C8 of the adenine ring and a sulfamate in place of the phosphate group. These compounds are potent inhibitors of the cysteine adenylation domain activity of the yersiniabactin siderophore synthetase HMWP2 and, unlike the corresponding linear aminoacyl-AMP analogs, do not inhibit protein translation in vitro. Selective small molecule inhibitors

  已开发出大环氨酰基-AMP 类似物，通过模拟晶体结构中观察到的 cisoid 配体结合构象，选择性地抑制非核糖体肽合成酶氨基酸腺苷酸化结构域。相比之下，这些大环化合物不抑制氨酰-tRNA 合成酶，它们在机制上密切相关，但以不同的转体构象结合它们的配体。大环在氨基酸部分的 Cβ 和腺嘌呤环的 C8 之间包含一个两碳或三碳连接器，以及一个氨基磺酸盐代替磷酸基团。这些化合物是耶尔森菌素铁载体合成酶 HMWP2 的半胱氨酸腺苷酸化结构域活性的有效抑制剂，并且与相应的线性氨酰基-AMP 类似物不同，它们不抑制体外蛋白质翻译。
• Antibacterial methods and compositions
  申请人：——

  公开号：US20040224981A1

  公开（公告）日：2004-11-11

  Disclosed is a pharmaceutical composition comprising an aminoacyl tRNA synthetase inhibitor and another antibacterial agent, including another aminoacyl tRNA synthetase inhibitor.

  本发明揭示了一种药物组合物，包括一种氨酰tRNA合成酶抑制剂和另一种抗菌剂，其中包括另一种氨酰tRNA合成酶抑制剂。
• EP1619947A4
  申请人：——

  公开号：EP1619947A4

  公开（公告）日：2006-05-31
• ANTIBACTERIAL METHODS AND COMPOSITIONS
  申请人：Replidyne, Inc.

  公开号：EP1619947A2

  公开（公告）日：2006-02-01
• INHIBITION OF NEDDYLATION USING GLYCYL-tRNA SYNTHETASE INHIBITORS
  申请人：The Scripps Research Institute

  公开号：EP3362086A1

  公开（公告）日：2018-08-22