N⁶-benzoyl-8-iodo-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(triethylsilyl)adenosine | 292642-46-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N⁶-benzoyl-8-iodo-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(triethylsilyl)adenosine
• 英文别名: N-[9-[(3aR,4R,6R,6aR)-2,2-dimethyl-6-(triethylsilyloxymethyl)-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-8-iodopurin-6-yl]benzamide
• CAS: 292642-46-7
• 化学式: C₂₆H₃₄IN₅O₅Si
• 分子量: 651.576
• InChiKey: FZCIGTXKQMFEKC-AGFSROSKSA-N

物化性质

• 密度：
  1.55±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.12
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁶-benzoyl-8-iodo-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(triethylsilyl)adenosine 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 10.0h， 以94%的产率得到N⁶-benzoyl-8-iodo-2',3'-O-isopropylideneadenosine
  参考文献：
  名称：

  含核碱基主链的寡核苷，第 2 部分，腺苷衍生单体的合成和结构测定

  摘要：

  描述了新寡核苷的腺苷衍生单体结构单元的合成和结构测定。将 Me3Si-乙炔化物添加到由已知的部分保护的腺苷 1 衍生的醛中会产生差向异构的炔丙醇 2 和 3，它们被氧化成相同的酮 4，而甲硅烷基化和去保护会产生 7 和 9（方案 1）。在炔丙基甲硅烷基醚 10 和 11 的 C(8) 处引入 I 取代基并不令人满意。因此，被保护的腺苷 12 通过去质子化和用 PhSO2Cl 处理以高产率转化为 8-氯衍生物 13；以类似的方式获得碘化物15（方案2）。8-Cl 和 8-I 衍生物 13 和 15 分别转化为炔丙醇 17、18、25 和 26（方案 3）。炔丙基衍生物 2、10、17, 19, 23, 25, 27是相关的，它们的(5'R)构型是根据脱水核苷19的NOE确定的；类似地，3、11、18、20、24、26 和 28 的相关性以及 20 的 NOE 证明了它们的 (5'S) 构型。

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000705)83:7<1331::aid-hlca1331>3.0.co;2-z
• 作为产物：
  描述：

  N⁶-benzoyl-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(triethylsilyl)adenosine 在 正丁基锂 、 碘 、 二异丙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 为溶剂， 以91%的产率得到N⁶-benzoyl-8-iodo-2',3'-O-isopropylidene-5'-O-(triethylsilyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  含核碱基主链的寡核苷，第 2 部分，腺苷衍生单体的合成和结构测定

  摘要：

  描述了新寡核苷的腺苷衍生单体结构单元的合成和结构测定。将 Me3Si-乙炔化物添加到由已知的部分保护的腺苷 1 衍生的醛中会产生差向异构的炔丙醇 2 和 3，它们被氧化成相同的酮 4，而甲硅烷基化和去保护会产生 7 和 9（方案 1）。在炔丙基甲硅烷基醚 10 和 11 的 C(8) 处引入 I 取代基并不令人满意。因此，被保护的腺苷 12 通过去质子化和用 PhSO2Cl 处理以高产率转化为 8-氯衍生物 13；以类似的方式获得碘化物15（方案2）。8-Cl 和 8-I 衍生物 13 和 15 分别转化为炔丙醇 17、18、25 和 26（方案 3）。炔丙基衍生物 2、10、17, 19, 23, 25, 27是相关的，它们的(5'R)构型是根据脱水核苷19的NOE确定的；类似地，3、11、18、20、24、26 和 28 的相关性以及 20 的 NOE 证明了它们的 (5'S) 构型。

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000705)83:7<1331::aid-hlca1331>3.0.co;2-z

文献信息

• Oligonucleosides with a Nucleobase-Including Backbone, Part 3, Synthesis of Acetyleno-Linked Adenosine Dimers
  作者：Hiroki Gunji、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/1522-2675(20001108)83:11<2975::aid-hlca2975>3.0.co;2-2

  日期：2000.11.8

  C(5′)-ethynylated adenosine derivatives 5, 6, 11, and 12 (Scheme 4). Similarly, the 5′-epimeric dimer 16 was prepared by coupling 3 with the alkyne 8 (Scheme 5). The propargylic alcohol 4 was transformed into the N-benzoylated alkyne 5 and into the amine 6, while the epimeric alcohol 7 was converted to the epimeric amine 8 and the 5′-deoxy analogues 11 and 12 (Scheme 3). Cross-coupling of the iodoadenosine

  腺苷衍生的二聚体 14a-d 和 15b-d 是通过将受保护的 8-碘腺苷 3 和 13 与 C(5')-乙炔化腺苷衍生物 5、6、11 和 12 偶联制备的（方案 4）。类似地，5'-差向异构体二聚体 16 通过将 3 与炔烃 8 偶联来制备（方案 5）。炔丙醇 4 转化为 N-苯甲酰化炔烃 5 和胺 6，而差向异构醇 7 转化为差向异构胺 8 和 5'-脱氧类似物 11 和 12（方案 3）。碘腺苷 13 与炔烃 5 至 14a 的交叉偶联得到优化；它受炔烃的 N-苯甲酰基和 Et3SiO 基团的影响，但几乎不受 8-碘腺苷的 N-苯甲酰基影响。炔烃在 O-甲硅烷基化而不是 N-苯甲酰化时最具反应性。5'-脱氧炔烃的交叉偶联进行得更慢。二聚体 14a – d、15b – d 和 16 的收率良好（表 2）。14d 和 16 的去保护分别导致 18 和 20（方案 5）。二醇 17 和 19
• Oligonucleosides with a Nucleobase-Including Backbone. Part 12
  作者：Simon Eppacher、Punit Kumar Bhardwaj、Bruno Bernet、José Luis Bravo Gala、Thomas Knöpfel、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.200490269

  日期：2004.12

  In contradistinction to the corresponding Grignard reagent, bis[(trimethylsilyl)ethynyl]zinc reacted with the 5′-oxoadenosine 3 diastereoselectively to the β-D-allo-hept-6-ynofuranosyladenine 5. Lithiation/iodination of the monomeric propargyl alcohol 5 and of the dimeric propargyl alcohol 22 provided the 8-iodoadenosines 7 and 18, respectively, considerably shortening the synthesis of the dimeric

  在对比相应的格氏试剂，双[（三甲基甲硅烷基）乙炔基]锌与5'-oxoadenosine反应3非对映选择性的β -D-同种异体-庚-6- ynofuranosyladenine 5。单体炔丙醇5和二聚炔丙醇22的锂化/碘化分别提供了8-碘腺苷7和18，大大缩短了二聚O-甲硅烷基化的8-碘腺苷25的合成。尿苷和腺苷混合的四聚体21和32被合成了。通过线性序列制备四聚体21。Sonogashira的9和13偶联产生了三聚体16，它被C-去甲硅烷基化为17。17和19的第二次Sonogashira偶联产生了四聚体21。通过汇聚路线，将乙炔29和碘化物30偶联，以更高的产率制备四聚体32。尿苷衍生的碘化物被证明比腺苷衍生的类似物和N 6具有更高的反应活性。-未保护的腺苷衍生的炔烃比其N 6-苯甲酰化的类似物更具反应性。
• Oligonucleosides with a Nucleobase-Including Backbone, Part 4, A Convergent Synthesis of Ethynediyl-Linked Adenosine Tetramers
  作者：Hiroki Gunji、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/1522-2675(20001220)83:12<3229::aid-hlca3229>3.0.co;2-s

  日期：2000.12.20

  Deprotection of the tetramer 24, obtained by coupling the iodinated dimer 18 with the alkyne 23 gave the 8',5-ethynediyl-linked adenosine-derived tetramer 27 (Scheme 3). As direct iodination of C(5')-ethynylated adenosine derivatives failed, we prepared 18 via the 8-amino derivative 17 that was available by coupling the imine 15 with the iodide 7; 15, in its turn, was obtained from the 8-chloro derivative 12 via the 4-methoxybenzylamine 14 (Scheme 2). This method for the introduction of the S-iodo substituent was worked out with the N-benzoyladenosine 1 that was transformed into the azide 2 by lithiation and treatment with tosyl azide (Scheme I). Reduction of 2 led to the amine 3 that was transformed into 7 I,3-Dipolar cycloaddition of 3 and (trimethylsilyl)acetylene gave 6. The 8-substituted derivatives 4a-d were prepared similarly to 2, but could not be transformed into 7 The known chloride 8 was transformed into the iodide 11 via the amines 9 and 10. The amines 3, 10, and 16 form more or less completely persistent intramolecular C(8)N-H . . . O(5') H-bonds, while the dimeric amine 17 forms a ca. 50% persistent H-bond. There is no UV evidence for a base-base interaction in the protected and deprotected dimers and tetramers.