allyl 2-(allyloxy)-4-(2-(allyloxy)-4-amino-3-methoxybenzamido)-3-methoxybenzoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: allyl 2-(allyloxy)-4-(2-(allyloxy)-4-amino-3-methoxybenzamido)-3-methoxybenzoate
• 英文别名: Allyl 2-(allyloxy)-4-(2-(allyloxy)-4-amino-3-methoxybenzamido)-3-methoxybenzoate；prop-2-enyl 4-[(4-amino-3-methoxy-2-prop-2-enoxybenzoyl)amino]-3-methoxy-2-prop-2-enoxybenzoate
• 化学式: C₂₅H₂₈N₂O₇
• 分子量: 468.507
• InChiKey: QTPNPUVHGKHPOD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  allyl 2-(allyloxy)-4-(2-(allyloxy)-4-amino-3-methoxybenzamido)-3-methoxybenzoate 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 四(三苯基膦)钯 、 tin(II) chloride dihdyrate 、 三光气 、 苯硅烷 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 (S)-allyl 2-(allyloxy)-4-(2-(allyloxy)-4-(4-(2-(tert-butoxycarbonylamino)-3-cyanopropanamido)benzamido)-3-methoxybenzamido)-3-methoxybenzoate
  参考文献：
  名称：

  The Albicidin Resistance Factor AlbD Is a Serine Endopeptidase That Hydrolyzes Unusual Oligoaromatic-Type Peptides

  摘要：

  The para-aminobenzoic acid-containing peptide albicidin is a pathogenicity factor synthesized by Xanthomonas albilineans in infections of sugar cane. Albicidin is a nanomolar inhibitor of the bacterial DNA gyrase with a strong activity against various Gram-negative bacteria. The bacterium Pantoea dispersa expresses the hydrolase AlbD, conferring natural resistance against albicidin. We show that AlbD is a novel type of endopeptidase that catalyzes the cleavage of albicidin at a peptide backbone amide bond, thus abolishing its antimicrobial activity. Additionally, we determined the minimal cleavage motif of AlbD with substrates derived by Chemical synthesis. Our results clearly identify AlbD as a unique endopeptidase that is the first member of a new subfamily of peptidases. Our findings provide the molecular basis for a natural detoxification mechanism, potentially rendering a new tool in biological chemistry approaches.

  DOI：

  10.1021/jacs.5b04099
• 作为产物：
  描述：

  2-羟基-3-甲氧基-4-硝基苯甲醛 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 sodium chlorite 、 sodium dihydrogenphosphate 、 tin(II) chloride dihdyrate 、 三光气 、 potassium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 51.25h， 生成 allyl 2-(allyloxy)-4-(2-(allyloxy)-4-amino-3-methoxybenzamido)-3-methoxybenzoate
  参考文献：
  名称：

  阿比西丁的全合成：一种来自强酸黄单胞菌的有效抗菌陀螺酶抑制剂的前导结构。

  摘要：

  由植物病原细菌白蚁黄单胞菌（Xanthomonas albilineans）合成的肽抗生素短杆菌肽，对多种革兰氏阳性和革兰氏阴性微生物显示出显着的抗菌活性。从生产生物体或通过异源表达获得的少量白粉菌素是为生物活性图谱和结构-活性研究提供足够材料的限制因素。因此，我们开发了趋向白粉菌素的聚合全合成路线。通过三光气介导的偶联策略，实现了芳香族氨基酸之间酰胺键出乎意料的困难形成。本文提出的阿比西丁合成证实了先前确定的化学结构，并强调了该化合物的非凡抗菌活性。合成方案将提供数克量的杀菌素，以进一步分析其药物特性。

  DOI：

  10.1002/anie.201409584

文献信息

• [EN] ALBICIDIN DERIVATIVES, THEIR USE AND SYNTHESIS<br/>[FR] DÉRIVÉS D'ALBICIDINE, LEUR UTILISATION ET LEUR SYNTHÈSE
  申请人：TECH UNIVERSITÄT BERLIN

  公开号：WO2014125075A1

  公开（公告）日：2014-08-21

  The present invention relates to a antibiotically active compounds characterized by general formula (I), wherein X1, BB, BC, BD, BE and X2 are building blocks with D1, D2, D3, D4 or D5 being linkers which comprise carbon, sulphur, nitrogen, phosphor and/or oxygen atoms and which are covalently connecting the moities BA and BB, BB and BC, BC and BD, BD and BE and BE and BF, respectively, and wherein in particular the building block BC comprises an amino acid derivative. The invention relates further to said compounds for use in a method of treatment of diseases, in particular for use in a method of treatment of bacterial infections.

  本发明涉及一种抗生素活性化合物，其特征在于一般式（I），其中X1、BB、BC、BD、BE和X2是具有D1、D2、D3、D4或D5为连接物的构建块，该连接物包括碳、硫、氮、磷和/或氧原子，并以共价键连接BA和BB、BB和BC、BC和BD、BD和BE以及BE和BF的基团，特别是构建块BC包括氨基酸衍生物。该发明还涉及上述化合物用于治疗疾病的方法，特别是用于治疗细菌感染的方法。
• Synthesis and Antimicrobial Activity of Albicidin Derivatives with Variations of the Central Cyanoalanine Building Block
  作者：Stefan Grätz、Dennis Kerwat、Julian Kretz、Leonard von Eckardstein、Siamak Semsary、Maria Seidel、Maria Kunert、John B. Weston、R. D. Süssmuth

  DOI：10.1002/cmdc.201600163

  日期：2016.7.19

  primary target, DNA gyrase. It was then shown that derivatives with uncharged side chains retain antibacterial activity, whereas incorporation of charged amino acid residues decreases the antibacterial activity dramatically, possibly due to restricted cell penetration of these derivatives. From the newly synthesized derivatives, the threonine derivative shows the most promising results in both tests.

  为了研究抗生素短杆菌肽的药效基团区域，合成了在中心氨基酸上具有变化的衍生物。选择带电荷和不带电荷的残基，以研究电荷，手性和空间体积的影响。通过微稀释技术确定新合成衍生物的生物活性，以获得最小抑菌浓度（MIC）值。还对这些化合物在无细胞系统中进行了测试，以获得有关其抑制其主要靶标DNA促旋酶的能力的信息。然后表明具有不带电荷的侧链的衍生物保留了抗菌活性，而带电荷的氨基酸残基的掺入显着降低了抗菌活性，这可能是由于这些衍生物的细胞渗透受限所致。从新合成的衍生物中 苏氨酸衍生物在两种测试中均显示出最有希望的结果。这些信息将有助于将白菊抑菌素的特征向更像毒品的结构发展。
• Extensive Structure–Activity Relationship Study of Albicidin's C‐Terminal Dipeptidic <i>p</i> ‐Aminobenzoic Acid Moiety
  作者：Iraj Behroz、Patrick Durkin、Stefan Grätz、Maria Seidel、Lida Rostock、Marcello Spinczyk、John B. Weston、Roderich D. Süssmuth

  DOI：10.1002/chem.201904752

  日期：2019.12.20

  resistance. The 27 newly synthesized albicidins give profound insights into possibilities for variations of the C-terminus. Furthermore, in the present study, a novel derivative has been identified as overcoming resistance posed by the Klebsiella-protease AlbD. Structural modifications include, for example, azahistidine replacing the previous instable cyanoalanine as the central amino acid, as well as a triazole

  Albicidin 是最近描述的一种天然产物，可强烈抑制细菌 DNA 旋转酶。显着的活性，特别是针对革兰氏阴性细菌的活性，使其成为一种有前途的抗菌药物先导结构。因此，构效关系研究是深入了解影响旋转酶抑制、抗菌活性和克服耐药性的结构特征/部分的关键。 27 种新合成的 albicidins 为 C 末端变异的可能性提供了深刻的见解。此外，在本研究中，已鉴定出一种新的衍生物可以克服克雷伯氏菌蛋白酶 AlbD 造成的耐药性。结构修饰包括例如氮杂组氨酸取代先前不稳定的氰基丙氨酸作为中心氨基酸，以及结构单元D和E之间的三唑酰胺键等排体。
• Total Synthesis and Biological Assessment of Novel Albicidins Discovered by Mass Spectrometric Networking
  作者：Leonard von Eckardstein、Daniel Petras、Tam Dang、Stéphane Cociancich、Souhir Sabri、Stefan Grätz、Dennis Kerwat、Maria Seidel、Alexander Pesic、Pieter C. Dorrestein、Monique Royer、John B. Weston、Roderich D. Süssmuth

  DOI：10.1002/chem.201704074

  日期：2017.11.2

  tandem mass spectrometry and spectral (molecular) networking for the discovery of novel antimicrobial compounds. We report eight new natural albicidin derivatives, four of which bear a β‐methoxy cyanoalanine or β‐methoxy asparagine as the central α‐amino acid. We present the total synthesis of these albicidins, which facilitated the unambiguous determination of the (2 S,3 R)‐stereoconfiguration which is

  天然产物代表了潜在的新型抗菌药物线索的重要来源。细胞培养中微生物的低产量通常会延迟结构阐明，甚至阻止及时发现。从Xanthomonas albilineans生产的抗革兰氏阴性抗菌化合物albicidin开始，我们描述了一种结合非靶向串联质谱和光谱（分子）网络的生物活性指导方法，用于发现新型抗菌化合物。我们报告了八种新的天然白蜡菌素衍生物，其中四个以β-甲氧基氰丙氨酸或β-甲氧基天冬酰胺为中心α-氨基酸。我们介绍了这些阿比特霉素的总合成，这有助于（2  S，3 R）-立体构型，并通过对抗菌活性的立体化学评估进行补充。
• Improvement of the antimicrobial potency, pharmacokinetic and pharmacodynamic properties of albicidin by incorporation of nitrogen atoms
  作者：Lieby Zborovsky、Leonardo Kleebauer、Maria Seidel、Arseni Kostenko、Leonard von Eckardstein、Frank Otto Gombert、John Weston、Roderich D. Süssmuth

  DOI：10.1039/d1sc04019g

  日期：——

  A systematic pyridine-scan of the albicidin molecule provides a new lead structure with improved antimicrobial properties.

  一种对阿尔比西丁分子进行系统吡啶扫描的方法提供了一种具有改进抗微生物特性的新的引物结构。