6-benzyl-5-methyl-2-thioxo-2,3-dihydropyrimidin-4(1H)-one | 169772-16-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-benzyl-5-methyl-2-thioxo-2,3-dihydropyrimidin-4(1H)-one
• 英文别名: 6-benzyl-4-hydroxy-2-mercapto-5-methylpyrimidine；5-methyl-6-benzylthiouracil；6-benzyl-5-methyl-2-sulfanylidene-1H-pyrimidin-4-one
• CAS: 169772-16-1
• 化学式: C₁₂H₁₂N₂OS
• 分子量: 232.306
• InChiKey: LMYJDTWTSBWPEL-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.28±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  73.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-benzyl-5-methyl-2-thioxo-2,3-dihydropyrimidin-4(1H)-one 在 氯乙酸 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 6-benzyl-5-methyluracil
  参考文献：
  名称：

  Emivirine及其类似物的新型高效灵活合成途径

  摘要：

  开发了经过修订的合成路线，该路线是通过从麦芽糖酸中转化得到的适当取代的β-酮酯制得的艾米韦林（MKC-442）。该方法可用于多种MKC-442类似物的合成，并为它们进行系统的生物学评估开辟了道路。

  DOI：

  10.1002/jhet.987
• 作为产物：
  描述：

  苯乙酰氯 在 吡啶 、 四丁基溴化铵 、 sodium ethanolate 、 potassium carbonate 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 22.5h， 生成 6-benzyl-5-methyl-2-thioxo-2,3-dihydropyrimidin-4(1H)-one
  参考文献：
  名称：

  Emivirine及其类似物的新型高效灵活合成途径

  摘要：

  开发了经过修订的合成路线，该路线是通过从麦芽糖酸中转化得到的适当取代的β-酮酯制得的艾米韦林（MKC-442）。该方法可用于多种MKC-442类似物的合成，并为它们进行系统的生物学评估开辟了道路。

  DOI：

  10.1002/jhet.987

文献信息

• Preparation and anti-HIV-1 activity of Thio Analogues of Dichydroalkoxybenzyloxopyrimidines
  作者：Antonello Mai、Marino Artico、Gianluca Sbardella、Silvio Massa、Anna Giulia Loi、Enzo Tramontano、Patrizia Scano、Paolo La Colla

  DOI：10.1021/jm00017a010

  日期：1995.8

  double methyl-substituted series, a more pronounced cytotoxicity was observed and the further introduction of a methyl at the 3'-position in the benzylidene group resulted in total loss of antiviral activity. S-DABOs, namely 2-(alkylthio)-6-benzyl-3,4-dihydro-4-oxopyrimidines, were synthesized by reacting proper methyl (phenylacetyl)acetates or their 2-methyl compounds with thiourea to afford 6-benzyl-4-oxo-1

  二氢烷氧基苄基氧嘧啶（DABOs），一种新型的非核苷类逆转录酶抑制剂的各种硫代类似物，在体外选择性地抑制了HIV-1的繁殖。在C-5 H取代的6-苄基-3,4-二氢-4-氧嘧啶中，在嘧啶环的C-2处引入烷硫基或环烷硫基取代基导致衍生物（S-DABO）最多达到10个-强于烷氧基或环烷氧基的对应物。在2-（烷硫基）-6-苄基尿嘧啶的苄基部分的3'-位处进一步引入甲基，降低了细胞毒性，从而导致更具选择性的化合物。在C-5甲基取代的S-DABO中，许多衍生物显示的EC50值低至0.6 microM，并且在高至300 microM的剂量下没有细胞毒性。在C-5双甲基取代的系列中，观察到更明显的细胞毒性，并且在亚苄基的3'-位处进一步引入甲基导致抗病毒活性完全丧失。S-DABO，即2-（烷硫基）-6-苄基-3,4-二氢-4-氧嘧啶，是通过使适当的（苯基乙酰基）乙酸甲酯或它们的2-甲基化合物与硫脲反应生成6-苄基-4合成的-氧代-1
• Synthesis and biological evaluation of novel C5 halogen-functionalized S-DABO as potent HIV-1 non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors
  作者：Hua Qin、Chang Liu、Ying Guo、Ruiping Wang、Jianfang Zhang、Liying Ma、Zhili Zhang、Xiaowei Wang、Yuxin Cui、Junyi Liu

  DOI：10.1016/j.bmc.2010.03.025

  日期：2010.5

  A series of novel S-DABO analogues (4a1–5a12) have been synthesized by an efficient method and evaluated as inhibitors of human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1). The biological testing results clearly indicated that the substitution of halogen at the C5 position of pyrimidine ring could increase the anti-HIV-1 RT activity. The most active compounds showed activity in the low micromole range with

  已经通过一种有效的方法合成了一系列新颖的S -DABO类似物（4a1 – 5a12），并被评估为1型人类免疫缺陷病毒（HIV-1）的抑制剂。生物学测试结果清楚地表明，在嘧啶环的C5位取代卤素可以提高抗HIV-1 RT的活性。最具活性的化合物在低微摩尔范围内表现出活性，其IC 50值（IC 50 0.18–3.03μM）与奈韦拉平（IC 50 4.12μM）相当。对接表明，HIV-1 RT中TYR188的卤素和羰基之间形成了新的卤素键。
• Novel Synthesis and Anti-HIV-1 Activity of 2-Arylthio-6-benzyl-2,3-dihydro-1<i>H</i>-pyrimidin-4-ones (Aryl <i>S</i>-DABOs)
  作者：Erik Pedersen、Youssef Aly、Paolo La Colla、Roberta Loddo

  DOI：10.1055/s-2007-983732

  日期：2007.7

  The synthesis and the anti-HIV-1 activity of a series of 2-arylthio-6-benzyl-2,3-dihydro-1 H-pyrimidin-4-ones (aryl S-DABOs) are reported. These compounds were synthesized via a coupling reaction of the corresponding 6-benzyl-2-thiouracils with aryl iodides in the presence of neocuproine hydrate, copper(I) iodide, and sodium TERT-butoxide. Target compounds showed moderate activity against HIV-1.

  报道了一系列 2-arylthio-6-benzyl-2,3-dihydro-1 H-pyrimidin-4-ones (aryl S-DABOs) 的合成及其抗 HIV-1 活性。这些化合物是通过相应的 6-benzyl-2-thiouracils 与芳基碘在新铜碱水合物、碘化铜 (I) 和叔丁醇钠存在下的偶联反应合成的。目标化合物显示出对 HIV-1 的中等活性。
• 5-Alkyl-2-[(methylthiomethyl)thio]-6-(benzyl)-pyrimidin-4-(1H)-ones as potent non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors of S-DABO series
  作者：Rakesh Vig、Chen Mao、T.K. Venkatachalam、Lisa Tuel-Ahlgren、Elise A. Sudbeck、Fatih M. Uckun

  DOI：10.1016/s0960-894x(98)00250-9

  日期：1998.6

  Novel dihydroalkoxybenzyloxopyrimidine (S-DABO) derivatives targeting the non-nucleoside inhibitor (NNI) binding site of human immunodeficiency virus (HIV) reverse transcriptase (RT) have been synthesized using a novel computer model for the NNI binding pocket and tested for their RT inhibitory activity in cell-free assays using purified recombinant HIV RT as well as for their anti-HIV activity in

  使用新型计算机模型将NNI结合袋合成了靶向人免疫缺陷病毒（HIV）逆转录酶（RT）的非核苷抑制剂（NNI）结合位点的新型二氢烷氧基苄基氧嘧啶（S-DABO）衍生物，并测试了其对RT的抑制作用使用纯化的重组HIV RT进行的无细胞检测中的抗HIV活性以及在HTL VIIIB感染的外周血单核细胞中的抗HIV活性。我们的计算方法允许鉴定几个配体衍生位点，以产生更有效的S-DABO衍生物。我们的铅S-DABO衍生物5-异丙基-2-[[（甲硫基甲基）硫代] -6-（苄基）-嘧啶-4-（1H）-一（化合物3），
• Structure-Based Design of Novel Dihydroalkoxybenzyloxopyrimidine Derivatives as Potent Nonnucleoside Inhibitors of the Human Immunodeficiency Virus Reverse Transcriptase
  作者：Elise A. Sudbeck、Chen Mao、Rakesh Vig、T. K. Venkatachalam、Lisa Tuel-Ahlgren、Fatih M. Uckun

  DOI：10.1128/aac.42.12.3225

  日期：1998.12

  Two highly potent dihydroalkoxybenzyloxopyrimidine (DABO) derivatives targeting the nonnucleoside inhibitor (NNI) binding site of human immunodeficiency virus (HIV) reverse transcriptase (RT) have been designed based on the structure of the NNI binding pocket and tested for anti-HIV activity. Our lead DABO derivative, 5-isopropyl-2-[(methylthiomethyl)thio]-6-(benzyl)-pyrimidin-4-(1H)-on e, elicited

  基于NNI结合袋的结构设计了两种针对人免疫缺陷病毒（HIV）逆转录酶（RT）的非核苷抑制剂（NNI）结合位点的高效二氢烷氧基苄基氧嘧啶（DABO）衍生物，并测试了其抗HIV活性。我们的主要DABO衍生物5-异丙基-2-[（（甲硫基甲基）硫代] -6-（苄基）-嘧啶-4-（1H）-on e产生了对纯化的重组HIV RT的有效抑制活性，并废除了外围的HIV复制纳摩尔浓度（50％抑制浓度，<1 nM）的血液单核细胞，但在高达100 microM的浓度下未显示可检测的细胞毒性。