苯甲基(3S)-5-溴-3-(叔-丁氧基羰基氨基)-4-羰基-戊酸酯 | 189580-34-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 中文名称: 苯甲基(3S)-5-溴-3-(叔-丁氧基羰基氨基)-4-羰基-戊酸酯
• 英文名称: Boc-L-ASP(Bzl)-BMK
• 英文别名: Boc-L-Asp(Bzl)-CH₂Br；Phenylmethyl (3S)-5-bromo-3-[[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]amino]-4-oxopentanoate；benzyl (3S)-5-bromo-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-4-oxopentanoate
• CAS: 189580-34-5
• 化学式: C₁₇H₂₂BrNO₅
• 分子量: 400.269
• InChiKey: GDPBPNHVSAFRNB-ZDUSSCGKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  81.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  苯甲基(3S)-5-溴-3-(叔-丁氧基羰基氨基)-4-羰基-戊酸酯 在 copper(l) iodide 、 sodium azide 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 二氯甲烷 、 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 生成 methyl 1-((S)-3-((S)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)propanamido)-5-(benzyloxy)-2,5-dioxopentyl)-1H-1,2,3-triazole-4-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  CuI-Promoted One-Pot Synthesis of N-Boc Protected β-Ketotriazole Amino Acids: Application in the Synthesis of New Class of Dipeptidomimetics

  摘要：

  Nα-Boc-溴甲基酮、NaN3和丙炔酸的一锅点击化学反应以良好至优异的产率提供了N-Boc保护的1,4-二取代1,2,3-β-酮三唑酸。使用CuI作为催化剂和DMSO作为溶剂使得点击反应变得高效、实用且无需柱层析即可制备标题化合物。还阐述了所得非天然氨基酸作为构建模块制备含三唑的类肽的实用性。

  DOI：

  10.2174/092986612799363172
• 作为产物：
  描述：

  Boc-L-天冬氨酸 4-苄酯 在 氢溴酸 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 水 为溶剂， 反应 0.33h， 生成 苯甲基(3S)-5-溴-3-(叔-丁氧基羰基氨基)-4-羰基-戊酸酯
  参考文献：
  名称：

  CuI-Promoted One-Pot Synthesis of N-Boc Protected β-Ketotriazole Amino Acids: Application in the Synthesis of New Class of Dipeptidomimetics

  摘要：

  Nα-Boc-溴甲基酮、NaN3和丙炔酸的一锅点击化学反应以良好至优异的产率提供了N-Boc保护的1,4-二取代1,2,3-β-酮三唑酸。使用CuI作为催化剂和DMSO作为溶剂使得点击反应变得高效、实用且无需柱层析即可制备标题化合物。还阐述了所得非天然氨基酸作为构建模块制备含三唑的类肽的实用性。

  DOI：

  10.2174/092986612799363172

文献信息

• A CRYSTAL OF A CASPASE INHIBITOR
  申请人：Chia Tai Tianqing Pharmaceutical Group Co., Ltd.

  公开号：US20210002235A1

  公开（公告）日：2021-01-07

  Disclosed herein a crystal structure of a caspase inhibitor, and more specifically a crystal structure of an (S)-3-((S)-2-(5-(2-chlorophenyl)isoxazole-3-formylamide)proponamide)-4-oxo-5-(2,3,5,6-tetrafluorophenoxy)valeric acid, a preparation method therefor, a crystal polymer, a pharmaceutical composition and uses thereof. The compound A of formula (I) disclosed herein exhibits high crystal structure stability, low hygroscopicity, and advantageously shows physical properties, safety and metabolic stability while having relatively high pharmaceutical value.

  本文披露了一种caspase抑制剂的晶体结构，更具体地是一种(S)-3-((S)-2-(5-(2-氯苯基)异噁唑-3-甲酰胺)丙酰胺)-4-氧代-5-(2,3,5,6-四氟苯氧基)戊酸的晶体结构，以及其制备方法，晶体聚合物，药物组合物及其用途。本文披露的式(I)的化合物A表现出高晶体结构稳定性，低吸湿性，并且在具有相对较高的药用价值的同时，具有有利的物理性质，安全性和代谢稳定性。
• Functionalized erythro N-protected α-amino epoxides. Stereocontrolled synthesis and biological activity
  作者：Amnon Albeck、Gary I. Estreicher

  DOI：10.1016/s0040-4020(97)00195-6

  日期：1997.4

  ErythroN-protected α-amino epoxides, derived from α-amino acids bearing functionalized side chains, were synthesized. The key synthetic step is a stereoselective reduction of the corresponding haloketone either to the halohydrin or directly to the epoxide. The side chains include ester, ether and alcohol, nitro guanidine, carbamate and amine functional groups, derived from aspartate and glutamate, serine

  合成了由带有官能化侧链的α-氨基酸衍生的Eththro N-保护的α-氨基环氧化物。关键的合成步骤是将相应的卤代化合物立体选择性地还原为卤代醇或直接还原为环氧化物。侧链包括分别衍生自天冬氨酸和谷氨酸，丝氨酸，精氨酸和赖氨酸的酯，醚和醇，硝基胍，氨基甲酸酯和胺官能团。从赖氨酸和衍生环氧化物Ñ π硝基精氨酸表现出半胱氨酸蛋白酶木瓜蛋白酶和组织蛋白酶B的选择性失活，而他们没有失活的丝氨酸蛋白酶胰蛋白酶。
• Selective chemical reagents to investigate the role of caspase 6 in apoptosis in acute leukemia T cells
  作者：Katarzyna M. Groborz、Małgorzata Kalinka、Justyna Grzymska、Sonia Kołt、Scott J. Snipas、Marcin Poręba

  DOI：10.1039/d2sc05827h

  日期：——

  studied caspases 3 and 7. Therefore, the development of new small-molecule reagents for the selective detection and visualization of caspase 6 activity can improve our understanding of molecular circuits of apoptosis and shed new light on how they intertwine with other types of programmed cell death. In this study, we profiled caspase 6 substrate specificity at the P5 position and discovered that, similar

  激活的效应器半胱天冬酶 3、6 和 7 负责裂解许多靶底物，通过细胞凋亡导致细胞最终被破坏。多年来，针对这两种酶的多种化学探针已广泛研究了 caspase 3 和 7 在细胞凋亡执行中的功能。相比之下，与大量研究的caspase 3和7相比，caspase 6似乎在很大程度上被忽视了。因此，开发用于选择性检测和可视化caspase 6活性的新型小分子试剂可以提高我们对细胞凋亡分子回路的理解并为它们如何与其他类型的程序性细胞死亡交织在一起提供了新的线索。在这项研究中，我们分析了 caspase 6 在 P5 位点的底物特异性，并发现与 caspase 2 类似，Caspase 6 更喜欢五肽底物而不是四肽。基于这些数据，我们开发了一套用于 caspase 6 研究的化学试剂，包括基于香豆素的荧光底物、不可逆抑制剂和选择性聚集诱导发射发光体 (AIEgens)。我们证明 AIEgens 能够在体外区分
• Synthesis and structure–activity relationships of oxamyl dipeptide caspase inhibitors developed for the treatment of liver disease
  作者：Hirokazu Ueno、Makoto Kawai、Hirohisa Shimokawa、Masako Hirota、Masashi Ohmi、Rie Sudo、Atsuko Ohta、Yoshimasa Arano、Kazunari Hattori、Takashi Ohmi、Naoto Kato、Midori Kojima、Yoshinobu Ueno、Mitsuko Yamamoto、Yukiko Moriguchi、Hiroyuki Eda、Kazunao Masubuchi

  DOI：10.1016/j.bmcl.2008.10.117

  日期：2009.1

  The P4 region of a series of oxamyl dipeptide caspase inhibitors was optimized by the combination of anti-apoptotic activity in the Jurkat/Fas (JFas) cellular assay and membrane permeability in the PAMPA assay. Two highly potent anti-apoptotic agents with moderate membrane permeability, 29 and 36, showed strong in vivo efficacy in a murine model of alpha-Fas-induced liver injury. (C) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Counter Selection Substrate Library Strategy for Developing Specific Protease Substrates and Probes
  作者：Marcin Poreba、Rigmor Solberg、Wioletta Rut、Ngoc Nguyen Lunde、Paulina Kasperkiewicz、Scott J. Snipas、Marko Mihelic、Dusan Turk、Boris Turk、Guy S. Salvesen、Marcin Drag

  DOI：10.1016/j.chembiol.2016.05.020

  日期：2016.8

  Legumain (AEP) is a lysosomal cysteine protease that was first characterized in leguminous seeds and later discovered in higher eukaryotes. AEP upregulation is linked to a number of diseases including inflammation, arteriosclerosis, and tumorigenesis. Thus this protease is an excellent molecular target for the development of new chemical markers. We deployed a hybrid combinatorial substrate library (HyCoSuL) approach to obtain P1-Asp fluorogenic substrates and biotin-labeled inhibitors that targeted legumain. Since this approach led to probes that were also recognized by caspases, we introduced a Counter Selection Substrate Library (CoSeSuL) approach that biases the peptidic scaffold against caspases, thus delivering highly selective legumain probes. The selectivity of these tools was validated using M38L and HEK293 cells. We also propose that the Co-SeSuL methodology can be considered as a general principle in the design of selective probes for other protease families where selectivity is difficult to achieve by conventional sequence-based profiling.