2’-fluoro-2’-deoxyguanosine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2’-fluoro-2’-deoxyguanosine
• 英文别名: 2'-fluoro-2'-deoxyguanosine；2-Amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-3-fluoro-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-YL]-1H-purin-6-one；2-amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-3-fluoro-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-purin-6-one
• 化学式: C₁₀H₁₂FN₅O₄
• 分子量: 285.235
• InChiKey: UXUZARPLRQRNNX-AOTGGKNNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  135
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  鸟嘌呤 、 9-((2R,3R,4R,5R)-3-fluoro-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-1,9-dihydro-6H-purin-6-one 在 purine nucleoside 2’-deoxyribosyltransferase from Trypanosoma brucei 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 2’-fluoro-2’-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  使用来自布鲁氏锥虫的高度通用的嘌呤核苷2'-脱氧核糖基转移酶酶促合成治疗性核苷

  摘要：

  与多步化学方法相比，使用酶来合成核苷类似物具有多个优势，包括化学，区域和立体选择性以及较温和的反应条件。本文报道了来自布鲁氏锥虫的嘌呤核苷2'-脱氧核糖基转移酶（PDT）的生产，表征和利用。Tb PDT是一种二聚体，不仅在很宽的温度范围（50–70°C），pH（4–7）和离子强度（0–500 mM NaCl）范围内都显示出出色的活性和稳定性，而且在高温下具有非凡的高稳定性碱性条件（pH 8-10）。bPDT被证明可以熟练地合成许多治疗性核苷，包括去羟肌苷，维达拉滨，克拉屈滨，氟达拉滨和奈拉拉滨。用Ala或Ser进行结构指导的Val11置换，导致变体的活性提高了2.8倍。Tb PDT也共价固定在戊二醛激活的磁性微球上。选择了M Tb PDT3作为最佳衍生物（4200 IU / g，活性回收率为22％），可以轻松地将其重新捕获和再循环用于> 25个反应，而活性损失可忽略不计。最后，男铽PDT3

  DOI：

  10.1002/cctc.201800775

文献信息

• CYCLIC DINUCLEOTIDES FOR CYTOKINE INDUCTION
  申请人：Invivogen

  公开号：EP3505527A1

  公开（公告）日：2019-07-03

  The present invention concerns compounds of Formula (I) or Formula (II). wherein X2 is H or F; Z1 and Z2 are independently O or S; R1 and R2 are independently H or an enzyme-labile group which, together with the oxygen atom or sulfur atom to which it is attached, provides OH or SH in vivo such as pivaloyloxymethyl or acyloxybenzyl group; A1 is O-R3 or NH-R3; A2 is O-R3' or NH-R3'; B1 is H, NH-R4 or an halogen such as F, Cl, Br, I; B2 is H, NH-R4' or an halogen such as F, Cl, Br, I; R3, R3', R4 and R4' are independently H or an enzyme-labile group which, together with the oxygen atom or sulfur atom to which it is attached, provides OH or NH2 in vivo such as pivaloyloxymethyl, or a pharmaceutically acceptable salt, stereoisomer, tautomer or solvate thereof, except a compound of Formula (I) wherein X2 = F, Z1 = Z2= O, R1 = R2= R3= H, A2 = OH and B2 = H. The invention also concerns pharmaceutical compositions comprising said cyclic dinucleotide, as well as their use in the treatment of a bacterial infection, a viral infection or a cancer.

  本发明涉及式（I）或式（II）化合物。 其中 X2 是 H 或 F；Z1 和 Z2 独立地是 O 或 S；R1 和 R2 独立地是 H 或与所连接的氧原子或硫原子一起在体内提供 OH 或 SH 的酶抑制基团，例如新戊酰氧基甲基或酰氧基苄基；A1 是 O-R3 或 NH-R3；A2 是 O-R3' 或 NH-R3'；B1是H、NH-R4或卤素，如F、Cl、Br、I； B2是H、NH-R4'或卤素，如F、Cl、Br、I； R3、R3'、R4和R4'独立地是H或与所连接的氧原子或硫原子一起在体内提供OH或NH2的酶抑制基，如新戊酰氧基甲基、 或其药学上可接受的盐、立体异构体、同分异构体或溶媒、 式（I）化合物除外，其中 X2 = F，Z1 = Z2= O，R1 = R2= R3= H，A2 = OH 和 B2 = H。 本发明还涉及包含上述环二核苷酸的药物组合物，以及它们在治疗细菌感染、病毒感染或癌症中的用途。
• Cyclic dinucleotides for cytokine induction
  申请人：INVIVOGEN

  公开号：US10562929B2

  公开（公告）日：2020-02-18

  A cyclic dinucleotide compound of Formula (I): wherein X1 is H or F; X2 is H or F; at least one among X1 and X2 is a fluorine atom; Z is OH, OR1, SH or SR1, wherein: R1 is Na or NH4, or R1 is an enzyme-labile group which provides OH or SH in vivo such as pivaloyloxymethyl; B1 and B2 are bases chosen from Adenine, Hypoxanthine or Guanine, and B1 is a different base than B2 and a pharmaceutically acceptable salt thereof. Pharmaceutical compositions including the cyclic dinucleotide, as well as their use in the treatment of a bacterial infection, a viral infection or a cancer are also described.

  式 (I) 的环状二核苷酸化合物： 其中 X1 是 H 或 F；X2 是 H 或 F；X1 和 X2 中至少有一个是氟原子；Z 是 OH、OR1、SH 或 SR1，其中：R1是Na或NH4，或R1是在体内提供OH或SH的酶抑制基团，如新戊酰氧基甲基；B1和B2是选自腺嘌呤、次黄嘌呤或鸟嘌呤的碱基，B1是与B2不同的碱基及其药学上可接受的盐。还描述了包括环二核苷酸的药物组合物，以及它们在治疗细菌感染、病毒感染或癌症中的用途。
• Enzymatic Synthesis of Therapeutic Nucleosides using a Highly Versatile Purine Nucleoside 2’‐DeoxyribosylTransferase from<i>Trypanosoma brucei</i>
  作者：Elena Pérez、Pedro A. Sánchez‐Murcia、Justin Jordaan、María Dolores Blanco、José Miguel Mancheño、Federico Gago、Jesús Fernández‐Lucas

  DOI：10.1002/cctc.201800775

  日期：2018.10.9

  selected as the best derivative (4200 IU/g, activity recovery of 22 %), and could be easily recaptured and recycled for >25 reactions with negligible loss of activity. Finally, MTbPDT3 was successfully employed in the expedient synthesis of several nucleoside analogues. Taken together, our results support the notion that TbPDT has good potential as an industrial biocatalyst for the synthesis of a wide range

  与多步化学方法相比，使用酶来合成核苷类似物具有多个优势，包括化学，区域和立体选择性以及较温和的反应条件。本文报道了来自布鲁氏锥虫的嘌呤核苷2'-脱氧核糖基转移酶（PDT）的生产，表征和利用。Tb PDT是一种二聚体，不仅在很宽的温度范围（50–70°C），pH（4–7）和离子强度（0–500 mM NaCl）范围内都显示出出色的活性和稳定性，而且在高温下具有非凡的高稳定性碱性条件（pH 8-10）。bPDT被证明可以熟练地合成许多治疗性核苷，包括去羟肌苷，维达拉滨，克拉屈滨，氟达拉滨和奈拉拉滨。用Ala或Ser进行结构指导的Val11置换，导致变体的活性提高了2.8倍。Tb PDT也共价固定在戊二醛激活的磁性微球上。选择了M Tb PDT3作为最佳衍生物（4200 IU / g，活性回收率为22％），可以轻松地将其重新捕获和再循环用于> 25个反应，而活性损失可忽略不计。最后，男铽PDT3