| 904291-44-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物
• CAS: 904291-44-7
• 化学式: C₄₄H₆₄N₃O₁₁PSi₃
• 分子量: 926.236
• InChiKey: CKCYQPJIQAFDIL-KHYNPFBXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.64
• 重原子数：
  62.0
• 可旋转键数：
  20.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  138.15
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  、 在 四氮唑 、 borane tetrahydrofuran 作用下， 以 乙腈 、 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.03h， 生成 d(T_b)₉T boranephosphonate oligo-2'-deoxyribonucleotide
  参考文献：
  名称：

  新型寡核苷酸类似物的合成及生化活性

  摘要：

  硼烷膦酸酯脱氧寡核苷酸由 5'-O-benzhydroxybis(trimethylsilyloxy)silyl-2'-deoxynucleoside-3'-phosphoramidites 合成。腺嘌呤和胞嘧啶的环外胺分别用二甲氧基三苯甲基和三甲氧基三苯甲基保护，而鸟嘌呤用 N2-（9-芴基甲氧基羰基）或 N2-三甲氧基三苯甲基保护。胸腺嘧啶用 N3-苯甲酰基保护。使用这些合成子并在标准条件下通过四唑活化，观察到超过 99% 的缩合。用 THF·BH3 或过氧阴离子溶液氧化，然后用氟化物裂解甲硅烷基醚完成一个循环。在合成合适的低聚物后，依次使用乙酸、二硫醇盐和氢氧化铵去除保护基团。

  DOI：

  10.1080/10426500701734745
• 作为产物：
  描述：

  benzhydroxy-bis(trimethylsilyloxy)silyl chloride 在 咪唑 、 四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  混合序列硼烷膦酸酯 DNA 的合成

  摘要：

  一种新的基于固相亚磷酰胺的方法已被开发用于合成硼烷膦酸酯 DNA。这种新方法的关键是用 5'-甲硅烷基醚替换常见的 5'-二甲氧基三苯甲基封闭基团，并在碱基上使用新的保护基团（腺嘌呤，N6-二甲氧基三苯甲基；胞嘧啶，N4-三甲氧基三苯甲基；鸟嘌呤，N2- [9-芴基甲氧基羰基]；胸腺嘧啶，N3-苯甲酰基）。由于这些发展，现在第一次有可能合成具有四个 2'-脱氧核苷和磷酸和硼烷膦酸酯核苷酸间键的任意组合的寡脱氧核苷酸（包括仅具有硼烷膦酸酯键的寡聚体）。

  DOI：

  10.1021/ja061757e

文献信息

• Extended Length Borane Phosphonate Nucleic Acid Compounds
  申请人：McCuen Heather Brummel

  公开号：US20100010069A1

  公开（公告）日：2010-01-14

  The present invention provides a novel method for solid-phase phosphoramidite based synthesis of borane phosphonate DNA. Also provided are novel phosphoramidite molecules, novel extended length borane phosphonate nucleic acid compounds, and methods of use thereof.

  本发明提供了一种新颖的固相磷酰胺酯基合成硼磷酸酯DNA的方法。还提供了新颖的磷酰胺酯分子、新颖的扩展长度的硼磷酸酯核酸化合物以及其使用方法。