Towards a characterization of the structural determinants of specificity in the macrocyclizing thioesterase for deoxyerythronolide B biosynthesis
作者:Panos Argyropoulos、Fabien Bergeret、Christophe Pardin、Janice M. Reimer、Atahualpa Pinto、Christopher N. Boddy、T. Martin Schmeing
DOI:10.1016/j.bbagen.2015.11.007
日期:2016.3
Type I polyketide synthases (PKSs) are giant multidomain proteins that synthesize many therapeutics and other natural products. The synthesis proceeds by a thiotemplate mechanism whereby intermediates are covalently attached to the PKS. The release of the final polyketide is catalyzed by the terminal thioesterase (TE) domain through hydrolysis, transesterification, or macrocyclization. The PKS 6-deoxyerythronolide
I型聚酮化合物合酶(PKS)是巨大的多域蛋白,可合成许多治疗剂和其他天然产物。合成通过硫代模板机理进行,其中中间体共价附于PKS。最终的聚酮化合物的释放是通过末端硫酯酶(TE)域通过水解,酯交换或大环化来催化的。PKS 6-脱氧赤藓醇B合酶(DEBS)产生具有临床意义的抗生素红霉素的14元大环内酯核心。DEBS的TE结构域(DEBS TE)对天然和修饰底物的水解或大环化具有公认的,经验确定的特异性。我们目前正在努力了解使用一组新颖的二苯基烷基膦酸酯在DEBS TE中硫酯酶反应特异性的结构基础,模拟由DEBS TE专门环化或水解的底物。我们已经确定了仅在1.7Å处的DEBS TE的新构建体的结构,并且以2.1Å的分辨率与简单的烯丙基膦酸酯结合的DEBS TE。其他更复杂的二苯基烷基膦酸酯会抑制DEBS TE,但我们无法可视化这些与DEBS TE配合的忠实环化类似物。这项工作代表着使用与复杂底物类似物复合的DEBS