and (4S)-methylproline, respectively, at the Xaa position. To determine the influence of the 4-methyl substituted prolines on the β-turn populations, the NAMFIS (NMR analysis of molecular flexibility in solution) deconvolution analysis for these three peptides were performed in DMSO-d6 solution. The NBO (natural bond orbital) method was employed to gain further insight into the results obtained from the
β-转角在肽和蛋白质
化学,
生物物理学和
生物信息学中起着重要作用。这项研究的目的是研究具有在溶液中形成β-转角结构的高倾向的短线性肽。特别是,我们研究了具有一般序列的β-turn形成肽的构象集成体CBz-L-Ala-L-Xaa-Gly-L-Ala-O t Bu。这些四肽亚太高尔夫协会, A(4 R)Me
PGA, 和 A(4 S)Me
PGA, 包含 脯
氨酸, (4 R)-甲基脯
氨酸, 和 (4 S)-甲基脯
氨酸分别位于Xaa位置。为了确定4-甲基取代的脯
氨酸对β-turn种群的影响,在2007年对这三种肽进行了N
AMFIS(溶液中分子柔性的NMR分析)反褶积分析。
DMSO- d 6解决方案。NBO(自然键轨道)方法用于进一步了解从N
AMFIS分析获得的结果。NBO分析中的重点是表征可能影响有助于β-转弯稳定性的主链-骨干相互作用的远程分子内相互作用。N
AMFIS结果表明,在C的甲基取代的对映体