(2S)-N-[4-benzyloxy-5-methoxy-2-nitrobenzoyl]-2-hydroxymethylpyrrolidine | 260391-49-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (2S)-N-[4-benzyloxy-5-methoxy-2-nitrobenzoyl]-2-hydroxymethylpyrrolidine
• 英文别名: {(2S)-1-[4-(benzyloxy)-5-methoxy-2-nitrobenzoyl]pyrrolidinyl}methanol；(S)-(4-(benzyloxy)-5-methoxy-2-nitrophenyl)(2-(hydroxymethyl)pyrrolidin-1-yl)methanone；(4-(benzyloxy)-5-methoxy-2-nitrophenyl)(2-(hydroxymethyl)pyrrolidin-1-yl)methanone；(S)-(4-(benzyloxy)-5-methoxy-2-nitrophenyl)(2-(hydroxylethyl)pyrrolidin-1-yl)methanone；[(2S)-2-(hydroxymethyl)pyrrolidin-1-yl]-(5-methoxy-2-nitro-4-phenylmethoxyphenyl)methanone
• CAS: 260391-49-9
• 化学式: C₂₀H₂₂N₂O₆
• 分子量: 386.404
• InChiKey: UBHKNXOJMYAXTO-HNNXBMFYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S)-N-[4-benzyloxy-5-methoxy-2-nitrobenzoyl]-2-hydroxymethylpyrrolidine 在 吡啶 、 hydrazine hydrate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.67h， 生成 trans-2-hydroxy-2,3-dihydrocitral
  参考文献：
  名称：

  新型 C8-吡咯并苯二氮卓 (PBD) 腺苷缀合物的合成和生物学评价。PBD 环在 PBD 偶联物生物活性中的作用研究

  摘要：

  在这里，我们试图评估 PBD 单元对 PBD 偶联物的生物活性的贡献，为此，将腺苷核苷连接到 PBD A 环 C8 位置。聚合方法被成功用于合成新型 C8 连接的吡咯 (2,1-c)(1,4) 苯并二氮杂 (PBD)-腺苷 (ADN) 杂化物。PBD 和腺苷 (ADN) 部分分别合成，然后通过戊炔基接头连接。据我们所知，这是与核苷相关的 PBD 的第一份报告。令人惊讶的是，该化合物对鼠细胞没有细胞毒性，对金分枝杆菌和牛分枝杆菌菌株无活性，并且不与含鸟嘌呤的 DNA 序列结合，如 DNase I 足迹实验所示。分子动力学模拟表明，PBD-ADN 偶联物在包含 AGA-PBD 结合基序的两个 DNA 序列的 DNA 小沟中的容纳性较差，配体的腺苷部分阻止了 PBD 单元与鸟嘌呤氨基的共价结合DNA双链体。这些有趣的发现进一步阐明了连接在 PBD 的 C8 位置上的取代基影响和调节 PBD 杂交体的生物学和生物物理特性的能力。

  DOI：

  10.3390/molecules25051243
• 作为产物：
  描述：

  4-苄氧基-3-甲氧基苯甲醛 在 sodium chlorite 、 sodium dihydrogenphosphate 、 草酰氯 、 双氧水 、 硝酸 、 乙酸酐 、 三乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 氯仿 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 9.5h， 生成 (2S)-N-[4-benzyloxy-5-methoxy-2-nitrobenzoyl]-2-hydroxymethylpyrrolidine
  参考文献：
  名称：

  新型 C8-吡咯并苯二氮卓 (PBD) 腺苷缀合物的合成和生物学评价。PBD 环在 PBD 偶联物生物活性中的作用研究

  摘要：

  在这里，我们试图评估 PBD 单元对 PBD 偶联物的生物活性的贡献，为此，将腺苷核苷连接到 PBD A 环 C8 位置。聚合方法被成功用于合成新型 C8 连接的吡咯 (2,1-c)(1,4) 苯并二氮杂 (PBD)-腺苷 (ADN) 杂化物。PBD 和腺苷 (ADN) 部分分别合成，然后通过戊炔基接头连接。据我们所知，这是与核苷相关的 PBD 的第一份报告。令人惊讶的是，该化合物对鼠细胞没有细胞毒性，对金分枝杆菌和牛分枝杆菌菌株无活性，并且不与含鸟嘌呤的 DNA 序列结合，如 DNase I 足迹实验所示。分子动力学模拟表明，PBD-ADN 偶联物在包含 AGA-PBD 结合基序的两个 DNA 序列的 DNA 小沟中的容纳性较差，配体的腺苷部分阻止了 PBD 单元与鸟嘌呤氨基的共价结合DNA双链体。这些有趣的发现进一步阐明了连接在 PBD 的 C8 位置上的取代基影响和调节 PBD 杂交体的生物学和生物物理特性的能力。

  DOI：

  10.3390/molecules25051243

文献信息

• [EN] CROSS-LINKED PYRROLOBENZODIAZEPINE DIMER (PBD) DERIVATIVE AND ITS CONJUGATES<br/>[FR] DÉRIVÉ DE DIMÈRE DE PYRROLOBENZODIAZÉPINE RÉTICULÉ (PBD) ET SES CONJUGUÉS
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2020006722A1

  公开（公告）日：2020-01-09

  A novel cross-linked cytotoxic agents, pyrrolobenzo-diazepine dimer (PBD) derivatives, and their conjugates to a cell-binding molecule, a method for preparation of the conjugates and the therapeutic use of the conjugates.

  一种新型的交联细胞毒剂，吡咯苯并二氮杂环二聚体（PBD）衍生物，以及它们与细胞结合分子的结合物，一种制备这些结合物的方法以及这些结合物的治疗用途。
• [EN] CONJUGATION LINKERS CONTAINING 2,3-DIAMINOSUCCINYL GROUP<br/>[FR] LIEURS DE CONJUGAISON CONTENANT UN GROUPE 2,3-DIAMINOSUCCINYLE
  申请人：HANGZHOU DAC BIOTECH CO LTD

  公开号：WO2020073345A1

  公开（公告）日：2020-04-16

  Provided is a conjugate of a cytotoxic drug/molecule to a cell-binding molecule with a bis-linker (adual-linker) containing a 2, 3-diaminosuccinyl group. It also relates to preparation of the conjugate of a cytotoxic drug/molecule to a cell-binding molecule with the bis-linker, particularly when the drug having functional groups of amino, hydroxyl, diamino, amino-hydroxyl, dihydroxyl, carboxyl, hydrazine, aldehyde and thiol for conjugation with the bis-linker in a specific manner, as well as the therapeutic use of the conjugates.

  提供的是将细胞毒性药物/分子与含有双联接剂（双联接剂）的细胞结合分子结合的共轭物。它还涉及将细胞毒性药物/分子与双联接剂的细胞结合分子结合的制备，特别是当药物具有氨基，羟基，二氨基，氨基-羟基，二羟基，羧基，双肼，醛基和硫醇等功能基团以特定方式与双联接剂结合时，以及这些共轭物的治疗用途。
• In water alkylation of amines with alcohols through a borrowing hydrogen process catalysed by ruthenium nanoparticles
  作者：Caterina Risi、Massimo Calamante、Elena Cini、Valentina Faltoni、Elena Petricci、Filippo Rosati、Maurizio Taddei

  DOI：10.1039/c9gc03351c

  日期：——

  procedure for the synthesis of secondary amines in water has been developed. Combining Ru3(CO)12, tetraphenylcyclopentadienone and a small quantity of TGPS-750-M surfactant, primary and secondary alcohols were alkylated at N employing equimolar amounts of aromatic amines in water. The reaction occurs under microwave (MW) dielectric heating with high conversion and high yield. When required, the use

  已经开发了在水中合成仲胺的简单且对环境无害的方法。结合Ru 3（CO）12，四苯基环戊二烯酮和少量TGPS-750-M表面活性剂，在水中使用等摩尔量的芳香胺在N烷基化伯醇和仲醇。该反应在微波（MW）介电加热下以高转化率和高收率进行。如果需要，可以使用生物质衍生的2-MeTHF或GVL作为助溶剂。在兆瓦的影响下，形成了Ru纳米粒子与萘甲醚的结合体，可作为一种有效且可回收的催化剂。该方案还用于“水中”环化反应，以合成生物学上相关的吡咯并苯并二氮杂（（PBD）。
• Design, synthesis, and evaluation of mixed imine–amine pyrrolobenzodiazepine dimers with efficient DNA binding affinity and potent cytotoxicity
  作者：Ahmed Kamal、G. Ramesh、O. Srinivas、P. Ramulu、N. Laxman、Tasneem Rehana、M. Deepak、M.S. Achary、H.A. Nagarajaram

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.07.045

  日期：2004.10

  Synthesis of mixed imine-amine pyrrolobenzodiazepine (PBD) dimers that are comprised of DC-81 and secondary amine (N10) of DC-81 subunits tethered to their C8 positions through alkanedioxy linkers (comprised of three and five carbons) is described. These noncross-linking unsymmetrical molecules exhibit significant DNA minor groove binding ability and one of them 5b linked through the pentanedioxy chain

  描述了混合的亚胺-胺吡咯并苯并二氮杂（PBD）二聚体的合成，该二聚体由DC-81和通过烷二氧基接头（包含三个和五个碳原子）束缚在其C8位的DC-81亚基的仲胺（N10）组成。这些非交联的不对称分子表现出显着的DNA小沟结合能力，并且与天然存在的DC-81，1（DeltaTm = 0.7度）相比，通过戊二氧基链连接的5b之一具有有效的DNA结合能力（DeltaTm = 11.0摄氏度）。 C）。亚胺-胺PBD二聚体在许多人类癌细胞系中显示出有希望的体外抗肿瘤活性。
• Design and synthesis of novel pyrrolobenzodiazepine (PBD) prodrugs for ADEPT and GDEPT
  作者：Marina J Sagnou、Philip W Howard、Stephen J Gregson、Ebun Eno-Amooquaye、Philip J Burke、David E Thurston

  DOI：10.1016/s0960-894x(00)00404-2

  日期：2000.9

  Three N10-(4-nitrobenzyl)carbamate-protected PBD prodrugs (9a, 9b and 15) have been synthesized and evaluated for potential use in nitroreductase-based ADEPT and GDEPT therapies. An approximately 100-fold activation was observed for the DC-81 prodrug 9a. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.