9-fluorenylmethyl tetraisopropylphosphorodiamidite | 603136-74-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: 9-fluorenylmethyl tetraisopropylphosphorodiamidite
• 英文别名: 9H-fluorene-9-ylmethyl N,N,N’,N’-tetraisopropylphosphoramidite；9H-fluoren-9-ylmethyl-N,N,N’,N’-tetraisopropyl phosphoramidite；1-((9H-fluoren-9-yl)methoxy)-N,N,N',N'-tetraisopropylphosphanediamine；N-[[di(propan-2-yl)amino]-(9H-fluoren-9-ylmethoxy)phosphanyl]-N-propan-2-ylpropan-2-amine
• CAS: 603136-74-9
• 化学式: C₂₆H₃₉N₂OP
• 分子量: 426.582
• InChiKey: REUOFRPJWRQMCA-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  502.3±43.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.8
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  15.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-fluorenylmethyl tetraisopropylphosphorodiamidite 在 四氮唑 、 叔丁基过氧化氢 、 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 32.0h， 生成 Phosphoric acid (3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-purin-9-yl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl ester 4,5-dimethoxy-2-nitro-benzyl ester 9H-fluoren-9-ylmethyl ester
  参考文献：
  名称：

  引入笼状磷酸盐的多功能试剂

  摘要：

  已经制备了三种新颖的试剂来引入可光活化的邻硝基苄基磷酸酯。芴基甲基和叔丁基保护基的使用允许磷酸化后的宽范围的化学转化。另外，使用S-乙酰硫基乙基和酰氧基甲基基团产生了可光活化和可生物活化的磷脂酸磷酸三酯。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(02)02832-0
• 作为产物：
  描述：

  双二异丙基氨基氯化磷 、 9-芴甲醇 在 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 为溶剂， 生成 9-fluorenylmethyl tetraisopropylphosphorodiamidite
  参考文献：
  名称：

  ATP燃料非平衡DNA系统中的多种光控制机制。

  摘要：

  燃料驱动的自组装为创建自主系统和材料赢得了发展，这些系统和材料的时间行为已通过反应网络进行了预编程。但是，到目前为止，尚缺乏简单的外部控制机制来控制瞬态行为，最多只能使用远程和良性光控制。更具挑战性的是使用不同的波长来调制系统的不同组件的反应性，例如作为燃料或构件。成功的使这种系统能够以波长依赖的方式沿着不同的轨迹导航。在这里，我们介绍了在以ATP为动力的连接和限制同时进行的酶促反应网络中组织的，以ATP为燃料的动态共价DNA聚合系统中的光控制的第一个例子。

  DOI：

  10.1002/anie.202003102
• 作为试剂：
  描述：

  (9H-fluoren-9-yl)methyl ((7-(diethylamino)-2-oxo-2H-chromen-4-yl)methyl) diisopropylphosphoramidite 、 鸟苷 在 5-(乙硫基)-1H-四唑 、 9-fluorenylmethyl tetraisopropylphosphorodiamidite 作用下， 以 二甲基亚砜 、 乙腈 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.75h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Magic spot nucleotides: tunable target-specific chemoenzymatic synthesis

  摘要：

  一种可调节的化学酶策略可在克级规模上获得魔法点核苷酸和类似物。

  DOI：

  10.1039/c9cc01688k

文献信息

• Synthesis and Cellular Labeling of Caged Phosphatidylinositol Derivatives
  作者：Rainer Müller、Mevlut Citir、Sebastian Hauke、Carsten Schultz

  DOI：10.1002/chem.201903704

  日期：2020.1.7

  Phosphatidylinositol (PI) is the biosynthetic precursor for seven phosphoinositides, important signaling lipids in cells. A membrane-permeant caged PI derivative featuring a photo-removable coumarinyl group masking the negative charge of the phosphate, as well as two enzymatically removable butyrate esters for increased lipophilicity and for preventing phosphate migration, were synthesized. Rapid cell

  磷脂酰肌醇（PI）是7种磷酸肌醇的生物合成前体，这是细胞中重要的信号脂质。合成了具有光可去除香豆素基团的膜渗透性笼状PI衍生物，该衍生物可掩蔽磷酸的负电荷，以及两种可酶去除的丁酸酯，可增加亲脂性并防止磷酸盐迁移。通过可光交联的二嗪胺，然后通过点击化学使荧光团附着，证明了固定细胞中的快速细胞进入和细胞标记。使用该技术，我们发现多功能笼状PI衍生物主要位于内膜，但在解开后迅速变为质膜。因此，
• Synthesis and Cellular Labeling of Multifunctional Phosphatidylinositol Bis‐ and Trisphosphate Derivatives
  作者：Rainer Müller、Ana Kojic、Mevlut Citir、Carsten Schultz

  DOI：10.1002/anie.202103599

  日期：2021.9

  We synthesized the first multifunctionalized phosphoinositide polyphosphate derivatives featuring a photo-removable protecting group (“cage”), a photo-crosslinkable diazirine group, and a terminal alkyne group useful for click chemistry. We demonstrate that the lipid derivatives readily enter cells. After photo-crosslinking, cell fixation and fluorescent tagging via click chemistry, we determined the

  我们合成了第一个多功能化的磷酸肌醇多磷酸衍生物，具有可光去除的保护基团（“笼”）、可光交联的二氮丙啶基团和可用于点击化学的末端炔基。我们证明脂质衍生物很容易进入细胞。经过光交联、细胞固定和通过点击化学进行荧光标记后，我们确定了脂质释放前后脂质衍生物的细胞内位置。我们发现 PI(3,4)P 2和 PI(3,4,5)P 3衍生物快速转运至质膜，开启了这些脂质参与主动转运的有趣可能性。我们利用光交联和点击化学功能来分析PI(3,4,5)P 3结合蛋白的蛋白质组。从后者，我们通过 RNAi 验证了假定的脂质结合蛋白 ATP11A 和 MPP6 参与 PI(3,4,5)P 3向质膜的转运。
• Light-Controlled Membrane Mechanics and Shape Transitions of Photoswitchable Lipid Vesicles
  作者：Carla Pernpeintner、James A. Frank、Patrick Urban、Christian R. Roeske、Stefanie D. Pritzl、Dirk Trauner、Theobald Lohmüller

  DOI：10.1021/acs.langmuir.7b01020

  日期：2017.4.25

  Giant unilamellar vesicles (GUVs) represent a versatile model system to emulate the fundamental properties and functions associated with the plasma membrane of living cells. Deformability and shape transitions of lipid vesicles are closely linked to the mechanical properties of the bilayer membrane itself and are typically difficult to control under physiological conditions. Here, we developed a protocol

  巨型单层囊泡（GUV）代表了一种通用的模型系统，可模拟与活细胞质膜相关的基本特性和功能。脂质囊泡的可变形性和形状转变与双层膜本身的机械性能密切相关，通常在生理条件下难以控制。在这里，我们开发了一种协议，可以从含偶氮苯的磷脂酰胆碱（azo - PC），在用UV-A和可见光照射后会发生光异构化。光脂囊泡内的光开关使得能够快速而精确地控制膜的机械性能。通过改变光刺激的强度和动力学，实现了受控的囊泡形状变化，例如出芽转变，内陷，起珠或形成膜管。有了这个系统，我们可以模仿在细胞骨架中没有任何分子机器的情况下通常在细胞中看到的形态变化。此外，我们设计了一种机制，利用光可切换脂质膜来存储机械能，然后根据需要将其释放为局部可用的工作。
• A Modular Synthesis of Modified Phosphoanhydrides
  作者：Alexandre Hofer、Gregor S. Cremosnik、André C. Müller、Roberto Giambruno、Claudia Trefzer、Giulio Superti-Furga、Keiryn L. Bennett、Henning J. Jessen

  DOI：10.1002/chem.201500838

  日期：2015.7.6

  Phosphoanhydrides (P‐anhydrides) are ubiquitously occurring modifications in nature. Nucleotides and their conjugates, for example, are among the most important building blocks and signaling molecules in cell biology. To study and manipulate their biological functions, a diverse range of analogues have been developed. Phosphate‐modified analogues have been successfully applied to study proteins that

  磷酸酐（P-酸酐）是自然界普遍发生的修饰。例如，核苷酸及其结合物是细胞生物学中最重要的组成部分和信号分子。为了研究和操纵它们的生物学功能，已经开发了多种类似物。磷酸修饰的类似物已成功应用于研究依赖于这些丰富的细胞结构单元的蛋白质，但这些分子的制备和纯化通常都具有挑战性。这项研究公开了对P-酸酐的普遍使用权，包括不同的核苷酸探针，极大地促进了它们的制备和分离。方便且可扩展的综合，例如18O标记的三磷酸核苷为磷蛋白组学的未来应用提供了希望。
• γ-Ketobenzyl-Modified Nucleoside Triphosphate Prodrugs as Potential Antivirals
  作者：Tobias Nack、Thiago Dinis de Oliveira、Stefan Weber、Dominique Schols、Jan Balzarini、Chris Meier

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c01293

  日期：2020.11.25

  The antiviral activity of nucleoside reverse transcriptase inhibitors is often hampered by insufficient phosphorylation. Nucleoside triphosphate analogues are presented, in which the γ-phosphate was covalently modified by a non-bioreversible, lipophilic 4-alkylketobenzyl moiety. Interestingly, primer extension assays using human immunodeficiency virus reverse transcriptase (HIV-RT) and three DNA-polymerases

  核苷逆转录酶抑制剂的抗病毒活性通常受到磷酸化不足的阻碍。提出了核苷三磷酸酯类似物，其中γ-磷酸酯被非生物可逆的亲脂性4-烷基酮苄基部分共价修饰。有趣的是，使用人类免疫缺陷病毒逆转录酶（HIV-RT）和三种DNA聚合酶进行引物延伸分析显示，这些γ-修饰的核苷三磷酸作为HIV-RT的底物具有很高的选择性，而事实证明它们不是DNA-的非底物。聚合酶α，β和γ。与d4TTP相比，γ-修饰的d4TTP在细胞提取物中表现出对去磷酸化的高抗性。制备了这些γ-酮苄基核苷三磷酸的一系列酰氧基苄基前药。目的是在细胞内递送稳定的γ-修饰的三磷酸核苷，以增加此类化合物在感染细胞与未感染细胞中起作用的选择性。γ-酮苄基-d4TTP的传递已在T淋巴细胞细胞提取物中得到证实。在感染的CEM / 0细胞培养物中，前药是有效的HIV-1 / 2抑制剂，更重要的是在胸苷激酶缺陷型CD4中+ T细胞。