2,3-dihydroxybenzoyl CoA | 1127897-83-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 2,3-dihydroxybenzoyl CoA
• 英文别名: S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] 2,3-dihydroxybenzenecarbothioate
• CAS: 1127897-83-9
• 化学式: C₂₈H₄₀N₇O₁₉P₃S
• 分子量: 903.648
• InChiKey: UQUXBMNUOFUYAJ-HDRQGHTBSA-N

物化性质

• 密度：
  1.91±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.1
• 重原子数：
  58
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  429
• 氢给体数：
  11
• 氢受体数：
  24

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (4R,4aS,5aS,6R,12aS)-9-((2R,4R,5S,6R)-4,5-dihydroxy-6-methyltetrahydro-2H-pyran-2-yl)-3,4,10,12-tetrahydroxy-6,12a-dimethoxy-6-methyl-1,11-dioxo-1,4,4a,5,5a,6,11,12a-octahydrotetracene-2-carboxamide 、 2,3-dihydroxybenzoyl CoA 在 salicylyl-acyltransferase SsfX₃ 、 magnesium chloride 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  四环素生物合成途径中水杨酰基转移酶 SsfX3 的结构和生化特征。

  摘要：

  SsfX3 是一种 GDSL 家族酰基转移酶，在抗癌天然产物 SF2575 生物合成过程中的倒数第二步中，将水杨酸转移至四环素中间体的 C-4 羟基。C-4 水杨酸酯取代了更常见的 C-4 二甲胺官能团，使 SsfX3 成为第一个被确定作用于四环素底物的酰基转移酶。SsfX3 的晶体结构在 2.5 A 下测定，揭示了两个不同的结构域，如下所示：类似于碳水化合物结合模块的 N 端 β 夹心结构域，以及包含非典型 α/β 水解酶的 C 端催化结构域GDSL 水解酶家族中发现的折叠。活性位点位于一个大的开放结合袋的一端，该结合袋在空间上由 N 端和 C 端结构域的结构元件定义。假定的底物结合口袋中的突变分析鉴定了来自两个结构域的残基，这些残基对于结合酰基供体和受体很重要。此外，去除 N 端碳水化合物结合模块样结构域使独立的 α/β-水解酶结构域失活。因此，建议需要额外的非催化模块来限定结合袋并提

  DOI：

  10.1074/jbc.m111.299859
• 作为产物：
  描述：

  苯甲酸,二羟基- 、 辅酶 A 在 salicylyl-coenzyme A ligase SsfL₁ 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 反应 2.0h， 生成 2,3-dihydroxybenzoyl CoA
  参考文献：
  名称：

  四环素生物合成途径中水杨酰基转移酶 SsfX3 的结构和生化特征。

  摘要：

  SsfX3 是一种 GDSL 家族酰基转移酶，在抗癌天然产物 SF2575 生物合成过程中的倒数第二步中，将水杨酸转移至四环素中间体的 C-4 羟基。C-4 水杨酸酯取代了更常见的 C-4 二甲胺官能团，使 SsfX3 成为第一个被确定作用于四环素底物的酰基转移酶。SsfX3 的晶体结构在 2.5 A 下测定，揭示了两个不同的结构域，如下所示：类似于碳水化合物结合模块的 N 端 β 夹心结构域，以及包含非典型 α/β 水解酶的 C 端催化结构域GDSL 水解酶家族中发现的折叠。活性位点位于一个大的开放结合袋的一端，该结合袋在空间上由 N 端和 C 端结构域的结构元件定义。假定的底物结合口袋中的突变分析鉴定了来自两个结构域的残基，这些残基对于结合酰基供体和受体很重要。此外，去除 N 端碳水化合物结合模块样结构域使独立的 α/β-水解酶结构域失活。因此，建议需要额外的非催化模块来限定结合袋并提

  DOI：

  10.1074/jbc.m111.299859

文献信息

• Establishing a Toolkit for Precursor-Directed Polyketide Biosynthesis: Exploring Substrate Promiscuities of Acid-CoA Ligases
  作者：Maybelle Kho Go、Jeng Yeong Chow、Vivian Wing Ngar Cheung、Yan Ping Lim、Wen Shan Yew

  DOI：10.1021/bi300425j

  日期：2012.6.5

  biosynthesized from acyl-CoA precursors by polyketide synthases. One of the limitations to combinatorial biosynthesis of polyketides has been the lack of a toolkit that describes the means of delivering novel acyl-CoA precursors necessary for polyketide biosynthesis. Using five acid-CoA ligases obtained from various plants and microorganisms, we biosynthesized an initial library of 79 acyl-CoA thioesters by screening

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建
• Thioester-mediated biocatalytic amide bond synthesis with in situ thiol recycling
  作者：Christian Schnepel、Laura Rodríguez Pérez、Yuqi Yu、Antonio Angelastro、Rachel S. Heath、Max Lubberink、Francesco Falcioni、Keith Mulholland、Martin A. Hayes、Nicholas J. Turner、Sabine L. Flitsch

  DOI：10.1038/s41929-022-00889-x

  日期：——

  catalyses the conversion of a wide range of carboxylic acids to acyl-S-Coenzyme A and other thioesters in good yields. CARsr-A was used in situ as part of a recycling system to regenerate thioesters for acyl-S-Coenzyme A-dependent enzymes in one-pot reactions. This concept of thioester recycling is demonstrated with a range of acyltransferases that allow the formation of diverse amides and the non-native

  羧酸活化为硫酯在生物学中起着重要作用。然而，生化研究和生物技术应用受到普遍缺乏硫酯的阻碍，尤其是那些基于辅酶 A (CoA-SH) 的硫酯。在这里，我们通过利用羧酸还原酶 (CAR sr ) 的混杂活性展示了一种通用的硫酯回收酶。CAR sr (CAR sr -A)的腺苷酸化结构域催化各种羧酸以良好的产率转化为酰基-S-辅酶 A 和其他硫酯。汽车_-A 原位用作回收系统的一部分，以在一锅反应中为酰基-S-辅酶 A 依赖性酶再生硫酯。这种硫酯循环的概念通过一系列酰基转移酶得到证明，这些酰基转移酶允许使用表观遗传作者赖氨酸乙酰转移酶 HATp300 形成不同的酰胺和组蛋白衍生肽中赖氨酸侧链的非天然酰化。总的来说，这些结果为硫酯形成向酰胺形成及以后的形成建立了一个通用平台。
• Structural and Biochemical Characterization of the Salicylyl-acyltranferase SsfX3 from a Tetracycline Biosynthetic Pathway
  作者：Lauren B. Pickens、Michael R. Sawaya、Huma Rasool、Inna Pashkov、Todd O. Yeates、Yi Tang

  DOI：10.1074/jbc.m111.299859

  日期：2011.12

  acyltransferase that transfers salicylate to the C-4 hydroxyl of a tetracycline intermediate in the penultimate step during biosynthesis of the anticancer natural product SF2575. The C-4 salicylate takes the place of the more common C-4 dimethylamine functionality, making SsfX3 the first acyltransferase identified to act on a tetracycline substrate. The crystal structure of SsfX3 was determined at 2.5

  SsfX3 是一种 GDSL 家族酰基转移酶，在抗癌天然产物 SF2575 生物合成过程中的倒数第二步中，将水杨酸转移至四环素中间体的 C-4 羟基。C-4 水杨酸酯取代了更常见的 C-4 二甲胺官能团，使 SsfX3 成为第一个被确定作用于四环素底物的酰基转移酶。SsfX3 的晶体结构在 2.5 A 下测定，揭示了两个不同的结构域，如下所示：类似于碳水化合物结合模块的 N 端 β 夹心结构域，以及包含非典型 α/β 水解酶的 C 端催化结构域GDSL 水解酶家族中发现的折叠。活性位点位于一个大的开放结合袋的一端，该结合袋在空间上由 N 端和 C 端结构域的结构元件定义。假定的底物结合口袋中的突变分析鉴定了来自两个结构域的残基，这些残基对于结合酰基供体和受体很重要。此外，去除 N 端碳水化合物结合模块样结构域使独立的 α/β-水解酶结构域失活。因此，建议需要额外的非催化模块来限定结合袋并提