4-氯苯甲酰基辅酶A | 117380-98-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 中文名称: 4-氯苯甲酰基辅酶A
• 英文名称: S-4-chlorobenzoyl coenzyme A
• 英文别名: 4-chlorobenzoyl coenzyme A；4-Chlorobenzoyl-CoA；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] 4-chlorobenzenecarbothioate
• CAS: 117380-98-0
• 化学式: C₂₈H₃₉ClN₇O₁₇P₃S
• 分子量: 906.095
• InChiKey: DEPSOKCZMQPCBI-TYHXJLICSA-N

物化性质

• 密度：
  1.86±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.4
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-氯苯甲酰基辅酶A 在 Pseudomonas sp. CBS₃ 4-chlorobenzoyl-CoA dehalogenase 作用下， 以 phosphate buffer 为溶剂， 生成 4-羟基苯甲酰基-辅酶 A
  参考文献：
  名称：

  4-氯苯甲酸酯的脱卤作用。假单胞菌属的4-氯苯甲酰基辅酶A脱卤素酶的表征。CBS 3。

  摘要：

  假单胞菌 CBS3能够与4-氯苯甲酸酯一起生长，作为唯一的碳和能量来源。在第一个降解步骤中，通过由三种蛋白质组成的酶系统去除4-氯苯甲酸酯的氯。4-卤代苯甲酸酯-辅酶A连接酶激活辅酶A，ATP和Mg2 +依赖性反应中的4-氯苯甲酸酯成4-氯苯甲酰基-辅酶A。该硫酯中间体通过4-氯苯甲酰基-辅酶A脱卤酶脱卤。最终，辅酶A被4-羟基苯甲酰基-CoA硫酯酶分解形成4-羟基苯甲酸酯。通过五步纯化程序将涉及的4-氯苯甲酰基辅酶A脱卤酶纯化至表观均质。天然酶的表观分子量为120,000，由四个相同的31 kDa的多肽亚基组成。该酶的等电点为6.7。最大的初始催化速率在60℃，pH 10下达到。4-氯苯甲酰基辅酶A的表观Km值为2.4-2.7 microM。Vmax为1.1×10（-7）M sec-1（2.2μmol·min-1mg-1的蛋白质）。确定了NH 2-末端氨基酸序列。除4-氟苯甲酰基辅酶A外

  DOI：

  10.1007/bf00700458
• 作为产物：
  描述：

  辅酶 A 、 对氯苯甲酸 在 CoA ligase from Alcaligenes sp. ALP₈₃ 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 4-氯苯甲酰基辅酶A
  参考文献：
  名称：

  通用的生物合成方法来形成酰胺键

  摘要：

  通用和可持续的酰胺键形成催化策略的开发是制药行业和更广泛的化学工业的主要目标。在这里，我们报告了一种酰胺合成的生物催化方法，该方法利用了自然界中形成酰胺键的酶，N-酰基转移酶（NAT）和CoA连接酶（CL）的多样性。通过选择具有所需底物特征的NAT和CL的组合，可以以可预测的方式构建非天然的生物催化途径，以允许使用化学计量比的羧酸和胺偶联伙伴以高收率获得结构多样的仲和叔酰胺。可以使用分离的酶在体外或体内进行转化反应仅依赖于细胞产生的辅因子。这些全细胞系统的实用性通过Losmapimod的关键中间体（GW856553X）的制备规模合成得到展示，Losmapimod是一种选择性的p38促分裂原活化蛋白激酶抑制剂。

  DOI：

  10.1039/c8gc01697f

文献信息

• [EN] METHOD FOR SYNTHESISING AMIDES<br/>[FR] PROCÉDÉ DE SYNTHÈSE D'AMIDES
  申请人：GLAXOSMITHKLINE IP DEV LTD

  公开号：WO2018029097A1

  公开（公告）日：2018-02-15

  The present invention relates to a method for synthesising amides that is of general applicability. The method may be performed in vitro or in vivo. Cell lines for use in the in vivo methods also form aspects of the invention. The method for synthesising a non-natural amide comprises: a. reaction of a carboxylic acid with a naturally occurring CoA ligase or a variant thereof; and b. reaction of the product of step a with an amine in the presence of a naturally occurring acyltransferase or a variant thereof; with the proviso that where the CoA ligase and acyltransferase are both naturally occurring, they are not derived from the same source species and do not act sequentially in a metabolic pathway; and with the proviso that the non-natural product is not N-(E)-p-coumaroyl-3-hydroxyanthranilic acid or N-(E)-p-caffeoyl-3-hydroxyanthranilic acid. Further, a method for producing an active pharmaceutical ingredient by the aforementioned method and host cells for carrying out said methods are envisaged.

  本发明涉及一种合成酰胺的方法，具有普遍适用性。该方法可以在体外或体内进行。用于体内方法的细胞系也构成本发明的方面之一。合成非天然酰胺的方法包括：a. 将羧酸与天然存在的辅酶A连接酶或其变体反应；b. 在天然存在的酰基转移酶或其变体存在下，将步骤a的产物与胺反应；但辅酶A连接酶和酰基转移酶若均为天然存在，则不能来自相同源物种且不能在代谢途径中依次作用；并且非天然产物不是N-(E)-对香豆酰-3-羟基蒽醌酸或N-(E)-对咖啡酰-3-羟基蒽醌酸。此外，还可以通过上述方法生产活性药物成分的方法和用于执行该方法的宿主细胞。
• Establishing a Toolkit for Precursor-Directed Polyketide Biosynthesis: Exploring Substrate Promiscuities of Acid-CoA Ligases
  作者：Maybelle Kho Go、Jeng Yeong Chow、Vivian Wing Ngar Cheung、Yan Ping Lim、Wen Shan Yew

  DOI：10.1021/bi300425j

  日期：2012.6.5

  biosynthesized from acyl-CoA precursors by polyketide synthases. One of the limitations to combinatorial biosynthesis of polyketides has been the lack of a toolkit that describes the means of delivering novel acyl-CoA precursors necessary for polyketide biosynthesis. Using five acid-CoA ligases obtained from various plants and microorganisms, we biosynthesized an initial library of 79 acyl-CoA thioesters by screening

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建
• A catalytically versatile benzoyl-CoA reductase, key enzyme in the degradation of methyl- and halobenzoates in denitrifying bacteria
  作者：Oliver Tiedt、Jonathan Fuchs、Wolfgang Eisenreich、Matthias Boll

  DOI：10.1074/jbc.ra118.003329

  日期：2018.6

  Class I benzoyl-CoA (BzCoA) reductases (BCRs) are key enzymes in the anaerobic degradation of aromatic compounds. They catalyze the ATP-dependent reduction of the central BzCoA intermediate and analogues of it to conjugated cyclic 1,5-dienoyl-CoAs probably by a radical-based, Birch-like reduction mechanism. Discovered in 1995, the enzyme from the denitrifying bacterium Thauera aromatica (BCRTar) has

  I类苯甲酰辅酶A（BzCoA）还原酶（BCR）是芳香族化合物厌氧降解的关键酶。他们可能通过基于自由基的，类似桦木的还原机制催化中央BzCoA中间体及其类似物向ATP依赖性还原成共轭环状1,5-二烯酰基-CoA。于1995年发现的反硝化细菌芳香龙虾（BCRTar）的酶至今仍是唯一分离出的且可从生物化学途径获得的BCR，主要是因为BCR极不稳定，并且迄今为止其异源生产已大大失败。这里，我们描述了一个平台，用于从大肠杆菌中的相关反硝化物种Thauera chlorobenzoica（MBRTcl）编码指定的3-甲基苯甲酰辅酶A还原酶的四个结构基因的异源表达。有人建议参与降解甲基取代的BzCoA类似物。重组的MBRTcl具有一个αβγδ亚基结构，包含三个低电势[4Fe-4S]簇，并且高度不稳定。它催化了BzCoA的ATP依赖性还原脱芳香化反应，每转移两个电子就水解2.3-2.8个ATP，并优先在间
• Structure–activity analysis of base and enzyme-catalyzed 4-hydroxybenzoyl coenzyme A hydrolysis
  作者：Feng Song、Zhihao Zhuang、Debra Dunaway-Mariano

  DOI：10.1016/j.bioorg.2006.07.002

  日期：2007.2

  a slope (rho) of 1.5. In the case of the enzyme-catalyzed hydrolysis, the kcat/Km values measured for the para-substituted analogs defined substrate specificity. Asp32 was shown to play a key role in substrate recognition, and in particular, in the discrimination between the targeted substrate and other cellular benzoyl-CoA thioesters.

  在这项研究中，碱催化水解的二级速率常数k2和野生型假单胞菌sp的kcat，Km和kcat / Km值。测量了CBS3 4-羟基苯甲酰基辅酶A（4-HBA-CoA）硫酯酶催化的4-HBA-CoA及其对位取代类似物的水解。对于碱催化的水解，logk2对对位取代基的sigma值的图是线性的，斜率（rho）为1.5。在酶催化水解的情况下，对位取代的类似物测得的kcat / Km值定义了底物特异性。Asp32已显示在底物识别中，特别是在目标底物与其他细胞性苯甲酰基-CoA硫酯的区分中起关键作用。
• Probe compound for detecting and isolating enzymes and means and methods using the same
  申请人：Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH

  公开号：EP2230312A1

  公开（公告）日：2010-09-22

  The present invention relates to a probe compound that can comprise any substrate or metabolite of an enzymatic reaction in addition to an indicator component, such as, for example, a fluorescence dye, or the like. Moreover, the present invention relates to means for detecting enzymes in form of an array, which comprises any number of probe compounds of the invention which each comprise a different metabolite of interconnected metabolites representing the central pathways in all forms of life. Moreover, the present invention relates to a method for detecting enzymes involving the application of cell extracts or the like to the array of the invention which leads to reproducible enzymatic reactions with the substrates. These specific enzymatic reactions trigger the indicator (e.g. a fluorescence signal) and bind the enzymes to the respective cognate substrates. Moreover, the invention relates to means for isolating enzymes in form of nanoparticles coated with the probe compound of the invention. The immobilisation of the cognate substrates or metabolites on the surface of nanoparticles by means of the probe compounds allows capturing and isolating the respective enzyme, e.g. for subsequent sequencing.

  本发明涉及一种探针化合物，它可以包括酶反应的任何底物或代谢物，此外还包括指示成分，例如荧光染料或类似物。此外，本发明还涉及以阵列形式检测酶的方法，该阵列由任意数量的本发明探针化合物组成，每种探针化合物由代表所有生命形式中中心途径的相互关联的代谢物中的不同代谢物组成。此外，本发明还涉及一种检测酶的方法，该方法涉及将细胞提取物或类似物应用于本发明的阵列，从而导致与底物发生可重复的酶反应。这些特定的酶反应会触发指示剂（如荧光信号），并将酶与各自的同源底物结合。此外，本发明还涉及以涂覆有本发明探针化合物的纳米颗粒形式分离酶的方法。通过探针化合物将同源底物或代谢物固定在纳米颗粒表面，可以捕获和分离相应的酶，例如用于后续测序。