K289M is a variant of DNA polymerase β (pol β) that has previously been identified in colorectal cancer. The expression of this variant leads to a 16-fold increase in mutation frequency at a specific site in vivo and a reduction in fidelity in vitro in a sequence context-specific manner. Previous work shows that this reduction in fidelity results from a decreased level of discrimination against incorrect
K289M是
DNA聚合酶β(polβ)的一种变体,先前已在大肠癌中鉴定出这种变体。该变体的表达导致体内特定位点的突变频率增加16倍,并以序列背景特定的方式使体外保真度降低。先前的工作表明,保真度的降低是由于在聚合
水平上对不正确的核苷酸掺入的辨别
水平降低而导致的。为了探测polβ的K289M突变体变体的过渡状态,使用具有宽范围离去基单酸解离常数(pKa4)的β,γ-CXYdGTP类似物进行了单周转动力学实验,其中包括一组相应的新型β ,γ-CXYdCTP类似物。出奇,我们发现,与野生型polβ相比,K289M正确插入的催化速率常数(kpol)的log值不随pKa4值<11的类似物的离开基团pKa4的增加而降低。这表明与野生型(WT)相比,K289M反应的相对速率常数之一有所不同。但是,通过K289M与pKa4进行不正确插入的log(kpol)值图揭示了具有负斜率的线性相关性,在这方面类似于W