1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-(8-(trimethylsilyl)octa-1,7-diyn-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 1021300-92-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-(8-(trimethylsilyl)octa-1,7-diyn-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• CAS: 1021300-92-4
• 化学式: C₃₂H₅₆N₂O₅Si₃
• 分子量: 633.064
• InChiKey: ITILGYOZDVRBTA-UPRLRBBYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.04±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.03
• 重原子数：
  42.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  82.55
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-(8-(trimethylsilyl)octa-1,7-diyn-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 磷酸三甲酯 、 三正丁胺 、 四丁基氟化铵 、 1,8-双二甲氨基萘 、 三丁基焦磷酸铵 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 5-(octa-1,7-diynyl)-2'-deoxyuridine-5'-triphosphoric acid
  参考文献：
  名称：

  CLICK CHEMISTRY FOR THE PRODUCTION OF REPORTER MOLECULES

  摘要：

  公开号：

  EP2089343B1
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 在 四(三苯基膦)钯 吡啶 、 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 copper(l) iodide 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-(8-(trimethylsilyl)octa-1,7-diyn-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  CLICK CHEMISTRY FOR THE PRODUCTION OF REPORTER MOLECULES

  摘要：

  公开号：

  EP2089343B1

文献信息

• Click Chemistry as a Reliable Method for the High-Density Postsynthetic Functionalization of Alkyne-Modified DNA
  作者：Johannes Gierlich、Glenn A. Burley、Philipp M. E. Gramlich、David M. Hammond、Thomas Carell

  DOI：10.1021/ol0610946

  日期：2006.8.1

  cycloaddition (click) reaction for the multiple postsynthetic labeling of alkyne-modified DNA. A series of alkyne-modified oligodeoxyribonucleotides (ODNs) of increasing alkyne density were prepared, and the click reaction using various azide labels was investigated. Complete high-density conversion was observed for ODNs containing up to six consecutive alkyne functions. Compatibility of the click conditions

  [反应：见正文]我们报道了炔烃修饰的DNA的多个合成后标记的Cu（I）催化的惠斯根环加成（点击）反应的发展。制备了一系列增加炔烃密度的炔烃修饰的寡脱氧核糖核苷酸（ODN），并研究了使用各种叠氮化物标记的点击反应。对于包含多达六个连续炔烃功能的ODN，可以观察到完全的高密度转化。用炔修饰的引物获得的PCR产物显示了点击条件与长DNA链的相容性。