N⁴-benzoyl-5'-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxycytidine | 51549-36-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N⁴-benzoyl-5'-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxycytidine
• 英文别名: N4-Benzoyl-5'-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxycytidine；N-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 51549-36-1
• 化学式: C₂₂H₃₁N₃O₅Si
• 分子量: 445.591
• InChiKey: CCPOWNJNXQQIFV-YQVWRLOYSA-N

物化性质

• 溶解度：
  DMSO：250 mg/mL（561.07 mM；需要超声波）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.17
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  101
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 储存条件：
  2-8℃

制备方法与用途

5-O-TBDMS-N4-苯甲酰-2-脱氧胞苷是一种修饰核苷，可用作脱氧核糖核酸或核酸合成的原料。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-benzoyl-5'-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxycytidine 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 N-苯甲酰基-3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧胞啶
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 3′-Azido-3′-Deoxythymidine-Terminated Oligonucleotide

  摘要：

  A method of completely chemical synthesis of 3'-azido-3'-deoxythymidine-terminated oligonucleotides via 5'-H-phosphonate of AZT is described.

  DOI：

  10.1080/07328319808004703
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧胞嘧啶核苷 在 咪唑 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 N⁴-benzoyl-5'-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  Rapid syntheses of protected 2'-deoxycytidine derivatives

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo01311a061

文献信息

• [EN] NOVEL MODULATORS OF CELL CYCLE CHECKPOINTS AND THEIR USE IN COMBINATION WITH CHECKPOINT KINASE INHIBITORS<br/>[FR] NOUVEAUX MODULATEURS DE POINTS DE CONTRÔLE DU CYCLE CELLULAIRE ET LEUR UTILISATION EN COMBINAISON AVEC DES INHIBITEURS DE KINASE DE POINT DE CONTRÔLE
  申请人：SCHERING CORP

  公开号：WO2009061781A1

  公开（公告）日：2009-05-14

  In its many embodiments, the present invention provides a novel class of pyrimidine analogs of formula (V) as targeted mechanism-based modulators of cell cycle checkpoints. Cancers and/or malignancies can be treated by administration of a cell cycle checkpoint modulator of the invention. Also discussed are suitable combinations of the cell cycle checkpoint modulator with a checkpoint kinase inhibitor to produce synergistic apoptosis in cancer cells. The invention includes methods of treating cancers by administering the combination of the cell cycle checkpoint modulator and the checkpoint kinase inhibitor, pharmaceutical compositions comprising the activator as well as the combination and pharmaceutical kits.

  在其多种实施方式中，本发明提供了一类新型的嘧啶类似物，其化学式为（V），作为细胞周期检查点的靶向机制调节剂。可以通过给予本发明的细胞周期检查点调节剂来治疗癌症和/或恶性肿瘤。还讨论了适当的细胞周期检查点调节剂与检查点激酶抑制剂的组合，以在癌细胞中产生协同凋亡。该发明包括通过给予细胞周期检查点调节剂和检查点激酶抑制剂的组合来治疗癌症的方法，以及包含激活剂以及该组合的药物组合和药物配套工具。
• [EN] NOVEL PHOSPHOROUS (V)-BASED REAGENTS, PROCESSES FOR THE PREPARATION THEREOF, AND THEIR USE IN MAKING STEREO-DEFINED ORGANOPHOSHOROUS (V) COMPOUNDS<br/>[FR] NOUVEAUX RÉACTIFS À BASE DE PHOSPHORE (V), LEURS PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ET LEUR UTILISATION DANS LA FABRICATION DE COMPOSÉS ORGANOPHOSHOREUX (V) STÉRÉODÉFINIS
  申请人：BRISTOL MYERS SQUIBB CO

  公开号：WO2019200273A1

  公开（公告）日：2019-10-17

  The present invention relates to novel phosphorous (V) (P(V)) reagents, methods for preparing thereof, and methods for preparing organophosphorous (V) compounds by using the novel reagents.

  本发明涉及新型磷（V）（P(V)）试剂，其制备方法以及利用这种新型试剂制备有机磷（V）化合物的方法。
• [EN] DESIGN AND SYNTHESIS OF NOVEL DISULFIDE LINKER BASED NUCLEOTIDES AS REVERSIBLE TERMINATORS FOR DNA SEQUENCING BY SYNTHESIS<br/>[FR] DÉRIVÉS NUCLÉOTIDIQUES ET LEURS MÉTHODES D'UTILISATION
  申请人：UNIV COLUMBIA

  公开号：WO2017058953A1

  公开（公告）日：2017-04-06

  Disclosed herein, inter alia, are compounds, compositions, and methods of use thereof in the sequencing a nucleic acid.

  在此披露的内容包括化合物、组合物以及它们在核酸测序中的使用方法。
• NUCLEOTIDE ANALOGUES
  申请人：Intelligent Biosystems, Inc.

  公开号：US20170130051A1

  公开（公告）日：2017-05-11

  The present invention provides methods, compositions, mixtures and kits utilizing deoxynucleoside triphosphates comprising a 3′-O position capped by a group comprising methylenedisulfide as a cleavable protecting group and a detectable label reversibly connected to the nucleobase of said deoxynucleoside. Such compounds provide new possibilities for future sequencing technologies, including but not limited to Sequencing by Synthesis.

  本发明提供了利用包含由甲亚砜二硫醚作为可裂解保护基团的3'-O位置封端的脱氧核苷三磷酸的方法、组合物、混合物和试剂盒，以及可逆地连接到所述脱氧核苷的核碱基的可检测标签。这些化合物为未来的测序技术提供了新的可能性，包括但不限于合成测序。
• DNA sequencing reaction additive
  申请人：Qiagen Sciences, LLC

  公开号：US10844430B2

  公开（公告）日：2020-11-24

  The present invention provides methods, compositions, mixtures and kits utilizing 5-Chloro-2-methyl-4-isothiazolin-3-one in sequencing reactions, and in particular, sequencing reactions where deoxynucleoside triphosphates comprising a 3′-O position capped by a disulfide-based 3′-terminator group are used. In one embodiment, the deoxynucleoside triphosphates comprise a 3′-O position capped by a group comprising methylenedisulfide as a cleavable protecting group and a detectable label reversibly connected to the nucleobase of said deoxynucleoside. In addition, thiol-containing compounds and scavengers of thio-containing compounds are described. Such compounds provide new possibilities for future sequencing technologies, including but not limited to Sequencing by Synthesis.

  本发明提供了利用5-氯-2-甲基-4-异噻唑啉-3-酮在测序反应中的方法、组合物、混合物和试剂盒，特别是在使用由二硫化物基团封端的3′-O位置的脱氧核苷三磷酸的测序反应中。在一种实施例中，脱氧核苷三磷酸包括由亚甲基二硫醚作为可切割保护基团的3′-O位置，并且可检测标签可逆地连接到所述脱氧核苷的核碱基。此外，描述了含硫醇化合物和硫醇化合物的清除剂。这些化合物为未来的测序技术提供了新的可能性，包括但不限于合成测序。