tert-butyl (tert-butoxycarbonyl)(2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)carbamate | 1108637-28-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: tert-butyl (tert-butoxycarbonyl)(2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)carbamate
• 英文别名: tert-butyl N-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]-N-(2-oxo-1H-pyrimidin-6-yl)carbamate
• CAS: 1108637-28-0
• 化学式: C₁₄H₂₁N₃O₅
• 分子量: 311.338
• InChiKey: SXIBOCUVJANGPH-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  320 °C (decomp)
• 密度：
  1.19±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  97.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (tert-butoxycarbonyl)(2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)carbamate 在 4-二甲氨基吡啶 、 抗氧剂168 、 对甲苯磺酸 、 叔丁醇 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 35.0h， 生成 1-benzyl-3-(2-oxo-1-(tetrahydro-2H-pyran-2-yl)-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)urea
  参考文献：
  名称：

  DMAP 和 TBPP 介导的尿素取代核碱基和核苷的合成

  摘要：

  尿素功能化的核碱基和核苷已成为多功能化合物，在广泛领域具有潜在应用。通常，尿素的合成涉及异氰酸酯与核碱基和核苷的反应。相比之下，本研究提出了一种新颖有效的一锅法，用于合成尿素取代的核碱基和核苷，而无需使用异氰酸酯。该反应在 DMAP 和 TBPP 存在的情况下进行，导致各种尿素取代的核碱基和核苷的收率适中至良好。值得注意的是，N6-(N -苏酰基-羰基)腺苷也使用该方法合成。此外，合成的化合物与腺嘌呤评估了支架对腺苷受体的结合亲和力，但它们都没有表现出结合，表明需要进一步修改。这些发现为尿素功能化的核碱基和核苷的简便合成带来了巨大希望，并具有在各个领域的潜在应用。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2023.133472
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl 4-[bis(tert-butoxycarbonyl)amino]-2-oxopyrimidine-1(2H)-carboxylate 在 水 、 sodium carbonate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以99%的产率得到tert-butyl (tert-butoxycarbonyl)(2-oxo-1,2-dihydropyrimidin-4-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  一种实用且有效的方法来处理与 Fmoc 介导的固相合成方案兼容的 PNA 单体

  摘要：

  描述了正交保护的 PNA 单体的直接合成。受保护的氨基乙基甘氨酸 (Aeg) 单体通过 N-Fmoc-甘氨酸醛与甘氨酸甲酯的还原胺化和随后的游离胺与 N-双-Boc 保护的核碱基乙酸酰化来有效制备。核碱基的环外胺基团，包括众所周知的难以保护的鸟嘌呤核碱基，被双 Boc 氨基甲酸酯基团保护；这增加了核碱基在最常见有机溶剂中的溶解度。目前的协议允许在微观和宏观尺度上制备所有 Aeg 单体, 这避免或最大限度地减少了有毒试剂或溶剂的使用, 此外, 还使用了廉价的起始材料。

  DOI：

  10.1002/ejoc.200800891

文献信息

• Pronounced Inhibition Shift from HIV Reverse Transcriptase to Herpetic DNA Polymerases by Increasing the Flexibility of α-Carboxy Nucleoside Phosphonates
  作者：Jubi John、Youngju Kim、Nicholas Bennett、Kalyan Das、Sandra Liekens、Lieve Naesens、Eddy Arnold、Anita R. Maguire、Matthias Götte、Wim Dehaen、Jan Balzarini

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.5b01180

  日期：2015.10.22

  nucleobase to the other end of the linker by a Mitsunobu reaction followed by final deprotection. Replacing the cyclopentyl moiety in the prototype α-CNPs by a more flexible entity results in a selectivity shift of ∼100-fold in favor of the herpetic DNA polymerases when compared to selectivity for HIV-1 RT. The nature of the kinetic interaction of the acyclic α-CNPs against the herpetic DNA polymerases differs

  α-羧基核苷膦酸酯（α-CNP）是新型的病毒DNA聚合酶抑制剂，不需要进行代谢转化即可抑制酶。该原型在核碱基和α-羧基膦酸酯之间包含一个环戊基连接子，与疱疹DNA聚合酶相比，它优先（50到100倍）抑制HIV-1 RT。已经开发出一种涉及三个步骤的合成方法，用于合成一系列新型的α-CNP，包括Rh（II）催化的OH插入，该插入将羧基膦酸酯基团连接至连接体部分，以及一个核碱基与该CNP的连接。通过Mitsunobu反应，然后最终脱保护，使连接基的另一端。与HIV-1 RT的选择性相比，通过更灵活的实体替换原型α-CNP中的环戊基部分会导致约100倍的选择性偏移，有利于疱疹DNA聚合酶。无环α-CNP对疱疹DNA聚合酶的动力学相互作用的性质不同于环戊基α-CNP对HIV RT的核碱基特异性动力学相互作用的性质。
• [EN] PHOSPHONATE NUCLEOSIDES USEFUL IN THE TREATMENT OF VIRAL DISEASES<br/>[FR] NUCLÉOSIDES PHOSPHONATES UTILES DANS LE TRAITEMENT DE MALADIES VIRALES
  申请人：UNIV CORK

  公开号：WO2015177351A1

  公开（公告）日：2015-11-26

  The present invention relates to a compound of formula (I), or a pharmaceutically acceptable salt or prodrug thereof, and their use in medicine particular as anti-viral agents; wherein: Base is a natural or non-natural nucleobase, and the other substituents are as defined in the claims.

  本发明涉及一种式(I)的化合物，或其在药学上可接受的盐或前药，以及它们在医学上特别作为抗病毒剂的用途；其中：基团是天然或非天然的核碱基，其他取代基如权利要求中所定义。
• Spontaneous Emergence of Self-Replicating Molecules Containing Nucleobases and Amino Acids
  作者：Bin Liu、Charalampos G. Pappas、Jim Ottelé、Gaël Schaeffer、Christoph Jurissek、Priscilla F. Pieters、Meniz Altay、Ivana Marić、Marc C. A. Stuart、Sijbren Otto

  DOI：10.1021/jacs.9b10796

  日期：2020.3.4

  suggests that the current close relationship between amino acids and nucleobases may well have extended to the origin of life. We now show how the interplay between these compound classes can give rise to new self-replicating molecules using a dynamic combinatorial approach. We report two strategies for the fabrication of chimeric amino acid/nucleobase self-replicating macrocycles capable of exponential

  导致第一批生物形成的条件以及生命起源于无生命的化学汤的方式知之甚少。最近的“RNA-肽协同进化”假说表明，目前氨基酸和核碱基之间的密切关系很可能已经延伸到生命起源。我们现在展示了这些化合物类别之间的相互作用如何使用动态组合方法产生新的自我复制分子。我们报告了两种制造能够呈指数增长的嵌合氨基酸/核碱基自我复制大环的策略。第一个依赖于混合基于核碱基和基于肽的构建块，这两者的连接产生高度特异性的嵌合环结构。第二个从肽核酸 (PNA) 构建块开始，其中核碱基从一开始就已经连接到氨基酸。虽然先前报道的基于核酸的自我复制系统依赖于（短）寡核苷酸序列的预合成，但本系统中的自我复制从仅包含单个核碱基的单元开始。自复制伴随着自组装，自发地产生一维有序排列的核碱基纳米结构。
• Synthesis of Chiral Acyclic Nucleosides by Sharpless Asymmetric Dihydroxylation: Access to Cidofovir and Buciclovir
  作者：Tao Qin、Jian-Ping Li、Ming-Sheng Xie、Gui-Rong Qu、Hai-Ming Guo

  DOI：10.1021/acs.joc.8b02442

  日期：2018.12.21

  nucleosides via Sharpless asymmetric dihydroxylation of N-allylpyrimidines or N-alkenylpurines is reported. A range of chiral acyclic nucleosides with two adjacent hydroxyl groups present on the side chains could be produced in good yields (up to 97% yield) and excellent enantioselectivities (90–99% ee). The synthetic utility of the reaction was demonstrated by the catalytic asymmetric synthesis of (S)-Cidofovir

  报道了一种通过N-烯丙基嘧啶或N-烯基嘌呤的Sharpless不对称二羟基化来构建手性无环核苷的有效方法。可以以高收率（最高97％的收率）和出色的对映选择性（90-99％ee）生产一系列在侧链上带有两个相邻羟基的手性无环核苷。通过（S）-西多福韦和（R）-比昔洛韦的催化不对称合成证明了该反应的合成效用。
• Peptide Nucleic Acid with Double Face: Homothymine–Homocytosine Bimodal Cα-PNA (<i>bm</i>-Cα-PNA) Forms a Double Duplex of the <i>bm</i>-PNA₂:DNA Triplex
  作者：Manoj Kumar Gupta、Bharath Raj Madhanagopal、Krishna N. Ganesh

  DOI：10.1021/acs.joc.0c02158

  日期：2021.1.1

  complementary DNAs dA8 and dG6 at neutral pH, bm-Cα-PNA 1 forms a higher order pentameric double duplex of a triplex composed of two bm-Cα-PNA-C5:dG5 duplexes built on a core (bm-Cα-PNA-T7)2:dA8 triplex. Circular dichroism studies showed that assembly can be achieved by either triplex first and duplex later or vice versa. Isothermal titration calorimetry data indicated that the assembly is driven by

  Cα-双峰肽核酸（bm - Cα- PNA）是具有两个面的PNA，被设计为PNA的同源物，其中标准PNA骨架中的每个氨基乙基甘氨酸（aeg）重复单元在Cα处通过带有一个三唑接头。这种具有混合序列的bm -Cα-PNA可通过同时与两个互补DNA结合而形成双链体，两个互补DNA分别与t-酰胺侧的碱基序列结合，而另一个与Cα侧链的碱基结合。bm -Cα-PNA的合成，在叔酰胺面上有高胸腺嘧啶（T 7）和高胞嘧啶（C 5通过三唑接头在Cα侧链上的固相合成是通过固相合成和整体点击反应实现的。在互补DNA DA的存在8和DG 6在中性pH下，BM -Cα-PNA 1所形成高阶一个五聚体组成的三链体的双双工2 BM -Cα-PNA-C 5：dG的5个构建在核心双链（BM -Cα-PNA-T 7）2：DA 8三层 圆二色性研究表明，组装可以通过首先进行三重结合，然后通过双面进行，反之亦然。等温滴定量热法数