(R)-N-FMOC-L-2-噻吩基丙氨酸 | 130309-35-2

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - 丙氨酸类衍生物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: (R)-N-FMOC-L-2-噻吩基丙氨酸
• 中文别名: N-[(9-芴甲氧基)羰基]-2-噻吩丙氨酸；FMOC-L-3-(2-噻吩基)-丙氨酸；氨基酸-3-(2-噻吩基)-L-丙氨酸；FMOC-L-2-噻吩基丙氨酸；(S)-N-Fmoc-2-噻吩丙氨酸；(S)-2-(芴甲氧羰基氨基)-3-(2-噻吩基)丙酸；(S)-N-FMOC-2-噻吩丙氨酸；Fmoc-β-(2-噻吩)-Ala-OH
• 英文名称: Fmoc-β-(2-thienyl)-L-alanine
• 英文别名: Fmoc-Thi-OH；Fmoc-L-2-Thienylalanine；(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-thiophen-2-ylpropanoic acid
• CAS: 130309-35-2
• 化学式: C₂₂H₁₉NO₄S
• mdl: MFCD00065676
• 分子量: 393.463
• InChiKey: PXBMQFMUHRNKTG-FQEVSTJZSA-N

物化性质

• 熔点：
  218.5 °C
• 沸点：
  623.4±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.2174 (rough estimate)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.4
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.181
• 拓扑面积：
  104
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 危险品标志：
  Xi
• 安全说明：
  S24/25
• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2934 99 90
• 危险类别：
  IRRITANT
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-N-FMOC-L-2-噻吩基丙氨酸 在 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 6-[2,6-bis[[2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-thiophen-2-ylpropanoyl]amino]hexanoylamino]hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  [EN] LUMINESCENT DYES WITH A WATER-SOLUBLE INTRAMOLECULAR BRIDGE AND THEIR BIOLOGICAL CONJUGATES
  [FR] COLORANTS LUMINESCENTS AVEC PONT INTRAMOLÉCULAIRE HYDROSOLUBLE ET LEURS CONJUGUÉS BIOLOGIQUES

  摘要：

  公开号：

  WO2012012595A3

文献信息

• Unnatural amino acids increase sensitivity and provide for the design of highly selective caspase substrates
  作者：M Poreba、P Kasperkiewicz、S J Snipas、D Fasci、G S Salvesen、M Drag

  DOI：10.1038/cdd.2014.64

  日期：2014.9

  proteases - the human caspases. The power of this library for caspase discrimination extends far beyond traditional PS-SCL approach, as in addition to 19 natural amino acids we also used 110 diverse unnatural amino acids that can more extensively explore the chemical space represented by caspase-active sites. Using this approach we identified and employed peptide-based substrates that provided excellent

  传统的组合肽基底物库方法通常利用天然氨基酸，限制了该工具在为具有相似底物特异性特征的蛋白酶生成选择性底物方面的用途。为了解决这个限制，我们合成了一个具有 Ac-P4-P3-P2-Asp-ACC 通式的混合组合底物库 (HyCoSuL)，在一个密切相关的蛋白酶家族 - 人类半胱天冬酶上测试了该方法。这个库用于 caspase 区分的能力远远超出了传统的 PS-SCL 方法，因为除了 19 种天然氨基酸之外，我们还使用了 110 种不同的非天然氨基酸，可以更广泛地探索由 caspase 活性位点表示的化学空间。
• Evaluation of transition-state mimics in a superior BACE1 cleavage sequence as peptide-mimetic BACE1 inhibitors
  作者：Yasunao Hattori、Kazuya Kobayashi、Ayaka Deguchi、Yukie Nohara、Tomomi Akiyama、Kenta Teruya、Akira Sanjoh、Atsushi Nakagawa、Eiki Yamashita、Kenichi Akaji

  DOI：10.1016/j.bmc.2015.07.023

  日期：2015.9

  A superior substrate sequence for BACE1 containing transition-state mimics at the scissile site was evaluated as a protease inhibitor. Hydroxymethylcarbonyl (HMC) and hydroxyethylamine (HEA) isosteres were selected as the transition state mimics, and incorporated into the scissile site of the superior sequence covering the P4 to P1’ sites (Glu-Ile-Thi-Thi*Nva; *denotes the cleavage site). Isosteres

  易位处含有过渡态模拟物的BACE1的优良底物序列被评估为蛋白酶抑制剂。选择羟甲基羰基（HMC）和羟乙胺（HEA）等位基因作为过渡态模拟物，并将其并入覆盖P 4至P 1 '位的上位序列的易剪位点（Glu-Ile-Thi-Thi * Nva；*表示卵裂位点）。分别合成具有不同的羟基绝对构型的等排体，并评价构型的效果。每个等排异构体的羟基构型均显示出对抑制活性的显着影响。反对-易位部位取代基的构型在HMC型抑制剂中具有有效的抑制活性，而HEA型抑制剂的抗构型则没有抑制活性。基于重组BACE1与每种抑制剂的复合物的X射线晶体学分析进行结构评估，可深入了解蛋白质-配体之间的相互作用，尤其是在主要位点。
• Solid- and Solution-Phase Synthesis of Vancomycin and Vancomycin Analogues with Activity against Vancomycin-Resistant Bacteria
  作者：K. C. Nicolaou、Suk Young Cho、Robert Hughes、Nicolas Winssinger、Christian Smethurst、Harald Labischinski、Rainer Endermann

  DOI：10.1002/1521-3765(20010903)7:17<3798::aid-chem3798>3.0.co;2-6

  日期：2001.9.3

  the vancomycin structure. Herein, we describe the development of synthetic technology based on the design of a novel selenium safety catch linker, application of this technology to a solid-phase semisynthesis of vancomycin, and the solid- and solution-phase synthesis of vancomycin libraries. Biological evaluation of these compound libraries led to the identification of a number of in vitro highly potent

  万古霉素是抗生素糖肽家族的原型成员，是一种临床上使用的抗生素，可抗多种耐药菌菌株，包括耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）。最近出现的对公共卫生构成日益严重威胁的万古霉素耐药性促使我们启动了一项旨在通过化学处理万古霉素结构来恢复这种重要抗生素效力的计划。在此，我们基于新型硒安全捕获连接器的设计，该技术在万古霉素固相半合成中的应用以及万古霉素文库的固相和溶液相合成，描述了合成技术的发展。这些化合物文库的生物学评估导致鉴定出许多对万古霉素耐药细菌有效的体外高效抗菌剂。除了帮助这些研究之外，预期本文所述的固相化学将增强组合化学的能力并促进化学生物学和药物化学研究。
• Novel glycine transporter type-2 reuptake inhibitors. Part 1: α-amino acid derivatives
  作者：Ronald L Wolin、Hariharan Venkatesan、Liu Tang、Alejandro Santillán、Tristin Barclay、Sandy Wilson、Doo Hyun Lee、Timothy W Lovenberg

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.05.042

  日期：2004.8

  alpha-amino acid derivatives were prepared as glycine transport inhibitors and their ability to block the uptake of [(14)C]-glycine in COS7 cells transfected with human glycine transporter-2 (hGlyT-2) was evaluated. An array of substituents at the chiral center was studied and overall, L-phenylalanine was identified as the preferred amino acid residue. Compounds prepared from l-amino acids were more

  制备了多种α-氨基酸衍生物作为甘氨酸转运抑制剂，并评估了它们在人甘氨酸转运蛋白2（hGlyT-2）转染的COS7细胞中阻断[（14）C]-甘氨酸摄取的能力。研究了手性中心的一系列取代基，总的来说，L-苯丙氨酸被确定为优选的氨基酸残基。与衍生自相应的d-氨基酸的类似物相比，由l-氨基酸制备的化合物是更有效的GlyT-2抑制剂。引入非手性氨基酸（例如甘氨酸）或在α位置引入双链取代，会导致GlyT-2抑制特性显着降低。
• Selective Substrates and Activity-Based Probes for Imaging of the Human Constitutive 20S Proteasome in Cells and Blood Samples
  作者：Wioletta Rut、Marcin Poręba、Paulina Kasperkiewicz、Scott J. Snipas、Marcin Drąg

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b00026

  日期：2018.6.28

  the HyCoSuL approach, we designed and synthesized novel and selective fluorogenic substrates for each of these three constitutive 20S proteasome activities and applied them to assess inhibition of proteasome subunits by MG-132 and a clinically used inhibitor bortezomib. Our results confirm the utility of designed substrates in biochemical assays. Furthermore, selective peptide sequences obtained in this

  蛋白酶体是维持蛋白质稳态的关键酶复合物。蛋白酶体功能紊乱导致包括癌症，自身免疫和神经退行性疾病在内的病理。因此，蛋白酶体构成药物开发的极好的分子靶标。在这里，我们使用HyCoSuL方法为这三个20S组成型蛋白酶体活性中的每一个设计和合成了新颖的选择性荧光底物，并将它们应用于评估MG-132和临床使用的硼替佐米对蛋白酶体亚基的抑制作用。我们的结果证实了设计的底物在生化分析中的实用性。此外，以此方式获得的选择性肽序列用于构建荧光团标记的基于活性的探针，然后用于同时检测HEK-293F细胞和红细胞裂解液中的每个20S组成型蛋白酶体亚基。总体而言，我们描述了一种简单而快速的方法，可用于测量全血样本中20S组成型蛋白酶体的活性，该方法可以早期诊断与异常上调的蛋白酶体活性有关的病理状态。