我们在此描述了一系列分子的设计、合成和
生物学评估,以开发新型
SARS-CoV 3CL pro的拟肽
抑制剂。一项涉及初始先导化合物1与
SARS-CoV 3CL pro之间结合的对接研究促使用
苯并噻唑单元取代
噻唑作为 P1' 位点的弹头部分。这种修饰导致鉴定出更有效的衍
生物,包括2i、2k、2m、2o和2p,其 IC 50或K i值在亚微摩尔至纳摩尔范围内。特别是,化合物2i和2p表现出最有效的抑制活性,K i值分别为 4.1 和 3.1 nM。通过这一过程鉴定出的拟肽化合物对于开发针对
SARS 的潜在治疗剂来说是有吸引力的线索。对
SARS-CoV 3CL pro具有强效抑制活性的拟肽的结构要求可概括如下:(i)S1'位存在
苯并噻唑弹头;(ii) S1位点环状内酰胺的氢键结合能力;(iii) S2 位点的适当立体
化学和疏
水部分大小,以及 (iv) S4 位点的苯氧基乙酰基部分呈现的独特折叠构象。