tert-butyl ((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate | 1448189-47-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: tert-butyl ((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate
• 英文别名: tert-butyl N-[(2S)-1-[(2S,4R)-4-hydroxy-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-1-oxopropan-2-yl]carbamate
• CAS: 1448189-47-6
• 化学式: C₂₄H₃₂N₄O₅S
• 分子量: 488.608
• InChiKey: ITASKWJVGGCSES-IPELMVKDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  149
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl ((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate 在 盐酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 3.0h， 以98%的产率得到(2S,4R)-1-[(2S)-2-aminopropanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}pyrrolidine-2-carboxamide hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  TANK结合激酶1的靶向靶向嵌合体（Von Hippel-Lindau-Recruiting蛋白水解）的鉴定和表征。

  摘要：

  靶向嵌合体的蛋白水解（PROTAC）是双功能分子，可将E3连接酶募集至目标蛋白质，以促进该蛋白质的泛素化和随后的降解。虽然靶向降解剂的领域还比较年轻，但这种方法成为分化和治疗现实的潜力很强，因此学术机构和制药机构现在都在进入这一有趣的研究领域。在本文中，我们描述了一种基于丝氨酸/苏氨酸激酶TANK结合激酶1（TBK1）识别降解子命中点的广泛适用的过程，并概括了与降解活动相关的关键结构要素。化合物3i命中率很高（TBK1 DC 50 = 12 nM，D max （= 96％）对相关激酶IKKε具有优异的选择性，该激酶还被用作化学工具，以评估TBK1作为突变K-Ras癌细胞中的靶标。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.7b00635
• 作为产物：
  描述：

  对溴苄胺 在 盐酸 、 potassium acetate 、 palladium diacetate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N-甲基吡咯烷酮 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 tert-butyl ((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  Compounds & Methods for the Enhanced Degradation of Targeted Proteins & Other Polypeptides by an E3 Ubiquitin Ligase

  摘要：

  本发明涉及双功能化合物，其作为靶向泛素化的调节剂具有实用性，特别是作为本发明的双功能化合物对各种被降解和/或受到抑制的多肽和其他蛋白质的抑制剂。具体而言，本发明涉及含有一端结合泛素连接酶的VHL配体，另一端结合靶蛋白的基团的化合物，使得靶蛋白靠近泛素连接酶以促使该蛋白的降解（和抑制）。本发明展示了与本发明化合物相关的广泛的药理活性范围，与靶向多肽的降解/抑制一致。

  公开号：

  US20140356322A1

文献信息

• Group-Based Optimization of Potent and Cell-Active Inhibitors of the von Hippel–Lindau (VHL) E3 Ubiquitin Ligase: Structure–Activity Relationships Leading to the Chemical Probe (2<i>S</i>,4<i>R</i>)-1-((<i>S</i>)-2-(1-Cyanocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-<i>N</i>-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (VH298)
  作者：Pedro Soares、Morgan S. Gadd、Julianty Frost、Carles Galdeano、Lucy Ellis、Ola Epemolu、Sonia Rocha、Kevin D. Read、Alessio Ciulli

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b00675

  日期：2018.1.25

  containing a VHL ligand can hijack the E3 ligase activity to induce degradation of target proteins. We report the structure-guided design and group-based optimization of a series of VHL inhibitors with low nanomolar potencies and improved cellular permeability. Structure-activity relationships led to the discovery of potent inhibitors 10 and chemical probe VH298, with dissociation constants <100 nM, which induced

  von Hippel-Lindau 肿瘤抑制蛋白是 VHL E3 泛素连接酶的底物结合亚基，它靶向低氧诱导因子 (HIF) 的羟基化 α 亚基进行泛素化和随后的蛋白酶体降解。VHL 是治疗贫血和缺血性疾病的潜在靶点，促进了 VHL:HIF-α 蛋白-蛋白相互作用抑制剂的开发。此外，含有 VHL 配体的双功能蛋白水解靶向嵌合体 (PROTACs) 可以劫持 E3 连接酶活性以诱导靶蛋白降解。我们报告了一系列具有低纳摩尔效力和改善细胞通透性的 VHL 抑制剂的结构引导设计和基于组的优化。构效关系导致了强效抑制剂 10 和化学探针 VH298 的发现，解离常数 <100 nM，诱导显着的 HIF-1α 细胞内稳定。我们的研究为探索下一代 PROTAC 的 VHL-HIF 途径和新的 VHL 配体提供了新的化学工具。
• Compounds and methods for the enhanced degradation of targeted proteins and other polypeptides by an E3 ubiquitin ligase
  申请人：YALE UNIVERSITY

  公开号：US10730862B2

  公开（公告）日：2020-08-04

  The present invention relates to bifunctional compounds, which find utility as modulators of targeted ubiquitination, especially inhibitors of a variety of polypeptides and other proteins that are degraded and/or otherwise inhibited by bifunctional compounds of the present invention. In particular, the present invention is directed to compounds, which contain on one end a VHL ligand that binds to the ubiquitin ligase and on the other end a moiety that binds a target protein, such that the target protein is placed in proximity to the ubiquitin ligase to effect degradation (and inhibition) of that protein. The present invention exhibits a broad range of pharmacological activities associated with compounds of the present invention, consistent with the degradation/inhibition of targeted polypeptides.

  本发明涉及双功能化合物，它们可作为靶向泛素化的调节剂，特别是本发明双功能化合物降解和/或以其他方式抑制的各种多肽和其他蛋白质的抑制剂。特别是，本发明涉及的化合物一端含有与泛素连接酶结合的 VHL 配体，另一端含有与靶蛋白结合的分子，从而使靶蛋白靠近泛素连接酶，以达到降解（和抑制）该蛋白的效果。本发明显示了与本发明化合物相关的广泛药理活性，与降解/抑制靶向多肽的作用相一致。
• [EN] COMPOUNDS AND METHODS FOR THE INHIBITION OF VCB E3 UBIQUITIN LIGASE<br/>[FR] COMPOSÉS ET PROCÉDÉS POUR L'INHIBITION DE L'UBIQUITINE LIGASE VCB E3
  申请人：UNIV YALE

  公开号：WO2013106646A3

  公开（公告）日：2013-09-06
• US9988376B2
  申请人：——

  公开号：US9988376B2

  公开（公告）日：2018-06-05
• [EN] COMPOUNDS & METHODS FOR THE ENHANCED DEGRADATION OF TARGETED PROTEINS & OTHER POLYPEPTIDES BY AN E3 UBIQUITIN LIGASE<br/>[FR] COMPOSÉS ET PROCÉDÉS POUR LA DÉGRADATION AMÉLIORÉE DE PROTÉINES CIBLES ET D'AUTRES POLYPEPTIDES PAR UNE E3 UBIQUITINE LIGASE
  申请人：UNIV YALE

  公开号：WO2013106643A2

  公开（公告）日：2013-07-18

  The present invention relates to bifunctional compounds, which find utility as modulators of targeted ubiquitination, especially inhibitors of a variety of polypeptides and other proteins which are degraded and/or otherwise inhibited by bifunctional compounds according to the present invention. In particular, the present invention is directed to compounds, which contain on one end a VHL ligand which binds to the ubiquitin ligase and on the other end a moiety which binds a target protein such that the target protein is placed in proximity to the ubiquitin ligase to effect degradation (and inhibition) of that protein. The present invention exhibits a broad range of pharmacological activities associated with compounds according to the present invention, consistent with the degradation/inhibition of targeted polypeptides.