thymidine | 137121-87-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: thymidine
• 英文别名: α,β-thymidine；Deoxyribosyl thymine；1-[(4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 137121-87-0
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₅
• 分子量: 242.232
• InChiKey: IQFYYKKMVGJFEH-KJFJCRTCSA-N

物化性质

• 密度：
  1.452±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  99.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  thymidine 在 四丁基硫酸氢铵 氢氧化钾 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 3',5'-bis(O-pentafluorobenzyl)-O4-ethylthymidine
  参考文献：
  名称：

  O4-乙基胸苷和类似物的五氟苄基化通过相转移催化进行气相色谱-电子捕获检测测定。

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ac00293a018
• 作为产物：
  描述：

  O,O-二(三甲基甲硅烷基)胸苷 在 palladium on activated charcoal ammonium heptamolybdate 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 氢气 、 双氧水 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 thymidine
  参考文献：
  名称：

  Difference in Catalytic Combustion of Propane and Propene on Pt/Al₂O₃Catalyst

  摘要：

  当进料中氧气分压增加时，丙烯在 Pt/Al2O3 催化剂上的燃烧会增强，而当氧气分压高于化学计量压力时，丙烷的燃烧会减弱。

  DOI：

  10.1246/cl.1999.801

文献信息

• Facile Synthesis of Thymidine Derivatives by Cross-Coupling of 5-Halogenouridine Derivatives with Trimethylaluminum
  作者：Kosaku Hirota、Yukio Kitade、Yoshitake Kanbe、Yoshiaki Isobe、Yoshifumi Maki

  DOI：10.1055/s-1993-25833

  日期：——

  An efficient method for the introduction of a methyl group in the 5-position of uridine derivatives is described. This method involves three steps: protection of 5-halogenouridines 4 and 5 with hexamethyldisilazane, a palladium-catalyzed cross-coupling of the pertrimethylsilylated nucleosides with trimethylaluminum, and subsequent deprotection to afford the corresponding thymidine derivatives 6 in high overall yields.

  描述了一种在尿苷衍生物的5-位引入甲基的有效方法。该方法包括三个步骤：用六甲基二硅氮烷保护5-卤代尿苷4和5，接着通过钯催化的交叉偶联反应与全三甲基硅基化的核苷酸与三甲基铝反应，最后进行去保护，以高总收率得到相应的胸苷衍生物6。
• New Concept for the Separation of an Anomeric Mixture of α/β-<scp>d</scp>-Nucleosides through Regioselective Enzymatic Acylation or Hydrolysis Processes
  作者：Javier García、Alba Díaz-Rodríguez、Susana Fernández、Yogesh S. Sanghvi、Miguel Ferrero、Vicente Gotor

  DOI：10.1021/jo062033o

  日期：2006.12.1

  An efficient and high yield protocol for the synthesis and separation of 3‘- and/or 5‘-protected α-2‘-deoxynucleosides has been developed through regioselective acylation/deacylation processes catalyzed by enzymes. Pseudomonas cepacia lipase (PSL-C) was found to be highly chemo- and regioselective toward the 3‘-position of the β-2‘-deoxynucleoside derivatives, whereas PSL-C displayed opposite selectivity

  通过酶催化的区域选择性酰化/脱酰过程，已经开发出一种高效和高产率的合成和分离3'-和/或5'-保护的α-2'-脱氧核苷的方案。发现假单胞菌脂肪酶（PSL-C）对β-2'-脱氧核苷衍生物的3'-位具有高度的化学和区域选择性，而PSL-C对相应α对5'-位具有相反的选择性-异头物。通过从工业废水中方便地分离胸苷衍生物的α/β混合物，证明了该方案的成功应用。此外，该技术还用于分离2'-脱氧-2'-氟-α/β-阿拉伯糖核苷的异头混合物，这是反义构建体的有用组成部分。
• Improved procedure for the regiospecific synthesis of 2′-deoxyribonucleosides
  作者：M.V. Baud、C. Chavis、M. Lucas、J.-L. Imbach

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)97641-x

  日期：1990.1

  2′-Deoxyribonucleosides are regiospecifically synthesized in high yields by catalyzing with KI-dibenzo-18-crown-6 PTC the condensation between unprotected silylated purines and pyrimidines and the appropriate easily available 2-deoxyribofuranosyl or pyranosyl sugar derivatives.

  通过用KI-二苯并-18-冠-6 PTC催化未保护的甲硅烷基化的嘌呤和嘧啶与适当的易得的2-脱氧核糖呋喃糖基或吡喃糖基糖衍生物之间的缩合，可以高特异性合成2'-脱氧核糖核苷。
• Substituent and Solvent Effects of TMS Triflate Mediated C1′ Epimerization of β-Thymidine to α-Thymidine
  作者：Yuichi Sato、Gohsuke Tateno、Kohji Seio、Mitsuo Sekine

  DOI：10.1002/1099-0690(20021)2002:1<87::aid-ejoc87>3.0.co;2-b

  日期：2002.1

  This paper deals with kinetic studies of TMSOTf-mediated C1′ epimerization of β-thymidine to α-thymidine. The effect of neighboring group participation by various 5′-hydroxy protecting groups, such as toluoyl, Et2CHC(O), Et2NC(O), and Et2NC(S), on the β→α conversion is described in detail. The time dependence of the ratio of the α and β anomers in the C1′ epimerization was estimated by 1H NMR. The

  本文涉及 TMSOTf 介导的 β-胸苷 C1' 差向异构化为 α-胸苷的动力学研究。详细描述了相邻基团参与各种 5'-羟基保护基团，如甲苯甲酰基、Et2CHC(O)、Et2NC(O)和 Et2NC(S)对 β→α 转化的影响。C1'差向异构化中α和β端基异构体的比率的时间依赖性通过1H NMR估计。α/β 平衡常数 K 和速率常数 kα 和 kβ 是根据实验数据计算的。结果得出的结论是，在乙腈中，α/β 平衡常数 K 在热力学上受 5'-羟基保护基团的位阻影响。另一方面，速率常数 kα 和 kβ 主要受氧鎓离子中间体稳定性的影响。特别是，由于二乙基硫代氨基甲酰基的相邻基团参与，从氧鎓离子中间体形成分子内环化亚胺鎓离子中间体倾向于降低总反应速率。最后，通过使用 Et2CHC(O) 基团，可以以 89% 的高 α 异构体选择性进行 α/β C1'差向异构化。因此，可以从 β-胸苷作为合成 α-DNA
• Novel P1,P2-substituted phosphonate analogues of 2′-deoxyadenosine and 2′-deoxythymidine 5′-triphosphates
  作者：B.Michael Blackburn、Steven P. Langston

  DOI：10.1016/0040-4039(91)80186-a

  日期：1991.10

  fluoromethylene, and difluoromethylene analogues of the deoxynucleotides 2′-deoxyadenosine 5′-triphosphate and thymidine 5′-triphosphate have been prepared. by reaction between the bisphosphonic acid and the appropriate 5′-O-tosyl deoxynucleoside giving analogues of the 2′-deoxynucleoside 5′-diphosphate. The γ-phosphate is added subsequently either via activation of P-2 of the dNDP as its morpholidate followed by

  制备了脱氧核苷酸2'-脱氧腺苷5'-三磷酸和胸苷5'-三磷酸的P 1，P 2取代的亚甲基，氟亚甲基和二氟亚甲基类似物。通过双膦酸与适当的5'- O-甲苯磺酰基脱氧核苷之间的反应得到2'-脱氧核苷5'-二磷酸酯的类似物。随后通过激活dNDP的P-2作为其吗啡酸酯添加γ-磷酸酯，然后与无机磷酸酯反应，或使用一种新颖的常规反应，使用对硝基苄基磷酸吗啡酸酯对5'-二磷酸核苷进行磷酸化。