5-chloro-3-(4-(difluoromethoxy)phenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: 5-chloro-3-(4-(difluoromethoxy)phenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine
• 英文别名: 5-Chloro-3-[4-(difluoromethoxy)phenyl]-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine；5-chloro-3-[4-(difluoromethoxy)phenyl]-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine
• 化学式: C₁₂H₇ClF₂N₄O
• 分子量: 296.664
• InChiKey: DNBISPSZPAUUNV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.08
• 拓扑面积：
  52.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-chloro-3-(4-(difluoromethoxy)phenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine 在 18-冠醚-6 、 三氟乙酸 、 potassium hydroxide 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 二甲基亚砜 、 乙腈 为溶剂， 反应 27.5h， 生成 3-(4-(difluoromethoxy)phenyl)-8-(difluoromethyl)-5-phenethoxy-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine
  参考文献：
  名称：

  新型抗疟氟代三唑并吡嗪类化合物的合成与表征

  摘要：

  在开源疟疾 (OSM) 三唑并吡嗪支架（系列 4）上使用 Diversinate™ 化学通过后期功能化合成了九种新的氟化类似物。所有类似物的结构都通过 NMR、UV 和 MS 数据分析进行了全面表征；X射线晶体结构分析证实了三种三唑并吡嗪类化合物。测试了所有化合物对疟疾寄生虫恶性疟原虫（3D7 和 Dd2 株）生长的抑制活性和对人胚肾 (HEK293) 细胞系的细胞毒性。一些化合物表现出中等抗疟活性，IC 50值范围从 0.2 到 >80 µM；在 80 µM 浓度下，没有一种化合物对 HEK293 细胞表现出任何细胞毒性。当三唑并吡嗪支架的 C-8 被 CF 3和 CF 2 H 部分取代时，抗疟活性显着降低，而在同一位置加入 CF 2 Me 基团则完全消除了抗疟原虫作用。

  DOI：

  10.3762/bjoc.19.11
• 作为产物：
  描述：

  (E)-2-chloro-6-(2-(4-(difluoromethoxy)benzylidene)hydrazinyl)pyrazine 在 碘苯二乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以73%的产率得到5-chloro-3-(4-(difluoromethoxy)phenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazine
  参考文献：
  名称：

  非经典苯基生物甾体作为一系列新型开源抗疟药的有效替代品。

  摘要：

  一种化学基序被另一种广泛相似的基序替代是药物化学中调节分子的物理和生物学特性（即生物等排体）的常用方法。近年来，诸如古巴烯和双环[1.1.1]戊烷（BCP）等生物等排体已被用作高效的苯基模拟物。在本文中，我们显示了在抗疟疾系列的开源优化过程中成功结合了一系列苯基生物甾体。立方烷（19）和闭合碳-carborane（23）的类似物具有改进的体外针对效力恶性疟原虫与母体苯基化合物相比；然而，这些变化导致代谢稳定性降低；不寻常的是，发现酶介导的氧化作用发生在古巴核心。发现BCP类似物（22）与它的母体苯基化合物等价，并显示出明显改善的代谢特性。虽然这些结果证明了这些非典型生物等排体在药物化学程序中的用途，但寻找合适的生物等排体的搜索可能很可能需要制备许多候选化合物，在我们的情况下为32种化合物。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c00746

文献信息

• Nonclassical Phenyl Bioisosteres as Effective Replacements in a Series of Novel Open-Source Antimalarials
  作者：Edwin G. Tse、Sevan D. Houston、Craig M. Williams、G. Paul Savage、Louis M. Rendina、Irene Hallyburton、Mark Anderson、Raman Sharma、Gregory S. Walker、R. Scott Obach、Matthew H. Todd

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c00746

  日期：2020.10.22

  The replacement of one chemical motif with another that is broadly similar is a common method in medicinal chemistry to modulate the physical and biological properties of a molecule (i.e., bioisosterism). In recent years, bioisosteres such as cubane and bicyclo[1.1.1]pentane (BCP) have been used as highly effective phenyl mimics. Herein, we show the successful incorporation of a range of phenyl bioisosteres

  一种化学基序被另一种广泛相似的基序替代是药物化学中调节分子的物理和生物学特性（即生物等排体）的常用方法。近年来，诸如古巴烯和双环[1.1.1]戊烷（BCP）等生物等排体已被用作高效的苯基模拟物。在本文中，我们显示了在抗疟疾系列的开源优化过程中成功结合了一系列苯基生物甾体。立方烷（19）和闭合碳-carborane（23）的类似物具有改进的体外针对效力恶性疟原虫与母体苯基化合物相比；然而，这些变化导致代谢稳定性降低；不寻常的是，发现酶介导的氧化作用发生在古巴核心。发现BCP类似物（22）与它的母体苯基化合物等价，并显示出明显改善的代谢特性。虽然这些结果证明了这些非典型生物等排体在药物化学程序中的用途，但寻找合适的生物等排体的搜索可能很可能需要制备许多候选化合物，在我们的情况下为32种化合物。
• <i>tele</i>-Substitution Reactions in the Synthesis of a Promising Class of 1,2,4-Triazolo[4,3-<i>a</i>]pyrazine-Based Antimalarials
  作者：Marat Korsik、Edwin G. Tse、David G. Smith、William Lewis、Peter J. Rutledge、Matthew H. Todd

  DOI：10.1021/acs.joc.0c01045

  日期：2020.11.6

  We have discovered and studied a tele-substitution reaction in a biologically important heterocyclic ring system. Conditions that favor the tele-substitution pathway were identified: the use of increased equivalents of the nucleophile or decreased equivalents of base or the use of softer nucleophiles, less polar solvents, and larger halogens on the electrophile. Using results from X-ray crystallographic

  我们已经发现并研究了生物学上重要的杂环系统中的远程取代反应。确定了有利于远程取代途径的条件：亲核试剂的当量增加或碱的当量减少或亲电子试剂上使用更柔软的亲核试剂，极性较小的溶剂和较大的卤素。利用X射线晶体学和同位素标记实验的结果，提出了这种异常转变的机制。我们专注于这种三唑并吡嗪，因为它是开源疟疾协会系列4的体内活性抗疟原虫化合物的核心结构。
• Synthesis of New Triazolopyrazine Antimalarial Compounds
  作者：Daniel Johnson、Ian Jenkins、Cohan Huxley、Mark Coster、Kah Lum、Jonathan White、Vicky Avery、Rohan Davis

  DOI：10.3390/molecules26092421

  日期：——

  (Series 4) resulted in the synthesis of 12 new analogues, which were characterized by NMR, UV, and MS data analysis. The structures of four triazolopyrazines were confirmed by X-ray crystal structure analysis. Several minor and unexpected side products were generated during these studies, including two resulting from a possible disproportionation reaction. All compounds were tested for their ability

  在开放源代码疟疾（OSM）三唑并吡嗪支架（系列4）上使用光氧化还原和Diversinate ™化学方法进行后期功能化的根本方法导致了12种新类似物的合成，这些新类似物的特征在于NMR，UV和MS数据分析。通过X射线晶体结构分析确认了四种三唑并吡嗪的结构。在这些研究过程中，产生了一些次要的和意外的副产物，其中包括两种可能由歧化反应引起的副产物。测试所有化合物抑制疟原虫恶性疟原虫生长的能力（3D7和Dd2株）以及对人胚胎肾脏（HEK293）细胞系的细胞毒性。对于某些化合物，观察到中等的抗疟活性，IC 50值范围从0.3到> 20 µM。在80 µM下，没有一种化合物对HEK293表现出任何毒性。
• An Open Drug Discovery Competition: Experimental Validation of Predictive Models in a Series of Novel Antimalarials
  作者：Edwin G. Tse、Laksh Aithani、Mark Anderson、Jonathan Cardoso-Silva、Giovanni Cincilla、Gareth J. Conduit、Mykola Galushka、Davy Guan、Irene Hallyburton、Benedict W. J. Irwin、Kiaran Kirk、Adele M. Lehane、Julia C. R. Lindblom、Raymond Lui、Slade Matthews、James McCulloch、Alice Motion、Ho Leung Ng、Mario Öeren、Murray N. Robertson、Vito Spadavecchio、Vasileios A. Tatsis、Willem P. van Hoorn、Alexander D. Wade、Thomas M. Whitehead、Paul Willis、Matthew H. Todd

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c00313

  日期：2021.11.25

  The Open Source Malaria (OSM) consortium is developing compounds that kill the human malaria parasite, Plasmodium falciparum, by targeting PfATP4, an essential ion pump on the parasite surface. The structure of PfATP4 has not been determined. Here, we describe a public competition created to develop a predictive model for the identification of PfATP4 inhibitors, thereby reducing project costs associated

  开源疟疾 (OSM) 联盟正在开发可杀死人类疟疾寄生虫恶性疟原虫的化合物，其目标是Pf ATP4，这是寄生虫表面的一种重要离子泵。Pf ATP4的结构尚未确定。在这里，我们描述了为开发用于识别Pf的预测模型而创建的公开竞赛ATP4 抑制剂，从而降低与非活性化合物合成相关的项目成本。参赛者可以看到提交的所有参赛作品。在最后一轮中，以专注于机器学习方法的私营部门进入者为特色，性能最佳的模型被用于预测新型抑制剂，其中一些模型被合成并针对寄生虫进行了评估。其中一半具有生物活性，其中一个具有熟悉该系列的人类化学家会认为是“不明智”的主题。由于所有数据和参与者交互都保留在公共领域，因此该研究项目“存在”并且可能会被其他人改进。
• Synthesis and characterisation of new antimalarial fluorinated triazolopyrazine compounds
  作者：Kah Yean Lum、Jonathan M White、Daniel J G Johnson、Vicky M Avery、Rohan A Davis

  DOI：10.3762/bjoc.19.11

  日期：——

  Plasmodium falciparum (3D7 and Dd2 strains) and the cytotoxicity against a human embryonic kidney (HEK293) cell line were tested. Some of the compounds demonstrated moderate antimalarial activity with IC50 values ranging from 0.2 to >80 µM; none of the compounds displayed any cytotoxicity against HEK293 cells at 80 µM. Antimalarial activity was significantly reduced when C-8 of the triazolopyrazine scaffold

  在开源疟疾 (OSM) 三唑并吡嗪支架（系列 4）上使用 Diversinate™ 化学通过后期功能化合成了九种新的氟化类似物。所有类似物的结构都通过 NMR、UV 和 MS 数据分析进行了全面表征；X射线晶体结构分析证实了三种三唑并吡嗪类化合物。测试了所有化合物对疟疾寄生虫恶性疟原虫（3D7 和 Dd2 株）生长的抑制活性和对人胚肾 (HEK293) 细胞系的细胞毒性。一些化合物表现出中等抗疟活性，IC 50值范围从 0.2 到 >80 µM；在 80 µM 浓度下，没有一种化合物对 HEK293 细胞表现出任何细胞毒性。当三唑并吡嗪支架的 C-8 被 CF 3和 CF 2 H 部分取代时，抗疟活性显着降低，而在同一位置加入 CF 2 Me 基团则完全消除了抗疟原虫作用。