D-ribose-5'-triphosphate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: D-ribose-5'-triphosphate
• 英文别名: D-Ribose 5-triphosphate；[hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl] [(2R,3S,4R,5R)-3,4,5-trihydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
• 化学式: C₅H₁₃O₁₄P₃
• 分子量: 390.071
• InChiKey: ZJJBHGDNOZLBIL-TXICZTDVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.8
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  230
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5’-三磷酸腺苷 在 甲基膦酸 、 PhnI nucleosidase 、 Escherichia coli adenine deaminase 、 magnesium chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 D-ribose-5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  远洋古细菌和细菌中的甲基膦酸的生物合成和分解代谢。

  摘要：

  无机磷酸盐对于所有生命形式都是必不可少的，但是海洋环境中的微生物几乎一直都在剥夺这种重要的营养素。如果微生物具有允许裂解定义此类分子的稳定碳-磷键的适当生化途径，则有机膦酸可以用作无机磷酸盐的替代来源。无机磷酸盐的一个重要来源是甲基膦酸，它是海洋溶解有机物的一种成分。海洋微生物对甲基膦酸进行生物合成和分解代谢的循环可能是浅海水中甲烷过饱和水平的来源。这篇评论提供了丰富的生物化学概述，该化学已经演化为合成甲基膦酸并将该分子分解代谢为Pi和甲烷，重点介绍了由甲基膦酸合酶MpnS和碳-磷裂解酶系统催化的反应。为MpnS和碳磷裂解酶描述的方案和实验为研究这些酶和相关酶的结构和机理提供了基础。

  DOI：

  10.1016/bs.mie.2018.01.039

文献信息

• Methylphosphonic Acid Biosynthesis and Catabolism in Pelagic Archaea and Bacteria
  作者：Emily C. Ulrich、Siddhesh S. Kamat、Bjarne Hove-Jensen、David L. Zechel

  DOI：10.1016/bs.mie.2018.01.039

  日期：——

  constant deprivation of this important nutrient. Organophosphonic acids can serve as an alternative source of inorganic phosphate if microbes possess the appropriate biochemical pathways that allow cleavage of the stable carbon-phosphorus bond that defines this class of molecule. One prominent source of inorganic phosphate is methylphosphonic acid, which is found as a constituent of marine-dissolved organic

  无机磷酸盐对于所有生命形式都是必不可少的，但是海洋环境中的微生物几乎一直都在剥夺这种重要的营养素。如果微生物具有允许裂解定义此类分子的稳定碳-磷键的适当生化途径，则有机膦酸可以用作无机磷酸盐的替代来源。无机磷酸盐的一个重要来源是甲基膦酸，它是海洋溶解有机物的一种成分。海洋微生物对甲基膦酸进行生物合成和分解代谢的循环可能是浅海水中甲烷过饱和水平的来源。这篇评论提供了丰富的生物化学概述，该化学已经演化为合成甲基膦酸并将该分子分解代谢为Pi和甲烷，重点介绍了由甲基膦酸合酶MpnS和碳-磷裂解酶系统催化的反应。为MpnS和碳磷裂解酶描述的方案和实验为研究这些酶和相关酶的结构和机理提供了基础。