1,1'-[(propane-1,3-diyl)dioxy]bis[(11S,11aS)-10-(allyloxycarbonyl)-11-hydroxy-7-methoxy-2-methylidene-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-5-one] | 232931-64-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯二氮卓类
• 英文名称: 1,1'-[(propane-1,3-diyl)dioxy]bis[(11S,11aS)-10-(allyloxycarbonyl)-11-hydroxy-7-methoxy-2-methylidene-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-5-one]
• 英文别名: prop-2-enyl (6S,6aS)-3-[3-[[(6S,6aS)-6-hydroxy-2-methoxy-8-methylidene-11-oxo-5-prop-2-enoxycarbonyl-6,6a,7,9-tetrahydropyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-3-yl]oxy]propoxy]-6-hydroxy-2-methoxy-8-methylidene-11-oxo-6,6a,7,9-tetrahydropyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-5-carboxylate
• CAS: 232931-64-5
• 化学式: C₃₉H₄₄N₄O₁₂
• 分子量: 760.798
• InChiKey: TYLQEKOKKBKYJI-MMADVNDSSA-N

物化性质

• 沸点：
  926.6±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.42±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  177
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,1'-[(propane-1,3-diyl)dioxy]bis[(11S,11aS)-10-(allyloxycarbonyl)-11-hydroxy-7-methoxy-2-methylidene-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-5-one] 在 四氢吡咯 、 四(三苯基膦)钯 、 三苯基膦 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.25h， 以77%的产率得到(11AS,11A'S)-8,8'-(丙烷-1,3-二基双(氧))双(7-甲氧基-2-亚甲基-2,3-二氢-1H-苯并[E]吡咯[1,2-A][1,4]二氮杂卓-5(11AH)-酮)
  参考文献：
  名称：

  具有高效交联能力和强细胞毒性的新型吡咯并苯并二氮杂卓DNA相互作用剂的设计，合成和评估。

  摘要：

  已经开发了新颖的序列选择性吡咯并苯并二氮杂（PBD）二聚体5（SJG-136），其包含两个C 2-外亚甲基取代的DC-81（3）亚基，它们通过惰性丙二氧基接头通过其C 8位进行束缚。此对称分子是高效的小沟链DNA交联剂（XL（50）= 0.045 microM），其效力比美法仑高440倍。热变性研究表明，与小胸腺DNA以5：1的DNA /配体比率孵育18小时后，T（m）值增加了33.6摄氏度，是该测定法中迄今为止记录的最高值。在相同条件下，类似的二聚体4（DSB-120）在C2位置上没有取代/不饱和键，其熔融仅提高了15.1摄氏度，举例说明了引入C2-exo-不饱和键的作用，该作用是使C环变平并在DNA小槽内实现出色的等螺旋配合。这种行为得到分子模型研究的支持，该研究表明：（i）PBD单元与相反链上的鸟嘌呤共价结合形成交联；（ii）5与4相比具有更大的结合能，而（iii）4 5和5具有跨越

  DOI：

  10.1021/jm001064n
• 作为产物：
  描述：

  1',3'-bis(4-carboxy-2-methoxy-5-nitrophenoxy)propane 在 吡啶 、 N-甲基吲哚酮 、 四丙基高钌酸铵 、 草酰氯 、 4 A molecular sieve 、 四丁基氟化铵 、 三乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 tin(ll) chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 26.25h， 生成 1,1'-[(propane-1,3-diyl)dioxy]bis[(11S,11aS)-10-(allyloxycarbonyl)-11-hydroxy-7-methoxy-2-methylidene-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-5-one]
  参考文献：
  名称：

  具有高效交联能力和强细胞毒性的新型吡咯并苯并二氮杂卓DNA相互作用剂的设计，合成和评估。

  摘要：

  已经开发了新颖的序列选择性吡咯并苯并二氮杂（PBD）二聚体5（SJG-136），其包含两个C 2-外亚甲基取代的DC-81（3）亚基，它们通过惰性丙二氧基接头通过其C 8位进行束缚。此对称分子是高效的小沟链DNA交联剂（XL（50）= 0.045 microM），其效力比美法仑高440倍。热变性研究表明，与小胸腺DNA以5：1的DNA /配体比率孵育18小时后，T（m）值增加了33.6摄氏度，是该测定法中迄今为止记录的最高值。在相同条件下，类似的二聚体4（DSB-120）在C2位置上没有取代/不饱和键，其熔融仅提高了15.1摄氏度，举例说明了引入C2-exo-不饱和键的作用，该作用是使C环变平并在DNA小槽内实现出色的等螺旋配合。这种行为得到分子模型研究的支持，该研究表明：（i）PBD单元与相反链上的鸟嘌呤共价结合形成交联；（ii）5与4相比具有更大的结合能，而（iii）4 5和5具有跨越

  DOI：

  10.1021/jm001064n

文献信息

• Pyrrolbenzodiazepines
  申请人：Spirogen Limited

  公开号：US07049311B1

  公开（公告）日：2006-05-23

  Compounds of formula (Ia) and (Ib) wherein A is CH2, or a single bond; R2 is selected from: R, OH, OR, CO2H, CO2R, COH, COR, SO2R, CN; R6, R7 and R9 are independently selected from H, R, OH, OR, halo, amino, NHR, nitro, Me3Sn; and R8 is selected from H, R, OH, OR, halo, amino, NHR, nitro, Me3Sn, where R is as defined above, or the compound is a dimer with each monomer being the same or different and being of formula (Ia) or (Ib), where the R8 groups of the monomers form together a bridge having the formula —X—R′—X— linking the monomers, where R′ is an alkylene chain containing from 3 to 12 carbon atoms, which chain may be interrupted by one or more hetero-atoms and/or aromatic rings and may contain one or more carbon—carbon double or triple bonds, and each X is independently selected from O, S, or N; except that in a compound of formula (Ia) when A is a single bond, then R2 is not CH═CH(CONH2) or CH═CH(CONMe2). Other related compounds are also disclosed

  化合物的公式(Ia)和(Ib)，其中A是CH2或单键；R2选自：R、OH、OR、CO2H、CO2R、COH、COR、SO2R、CN；R6、R7和R9独立地选自H、R、OH、OR、卤素、氨基、NHR、硝基、Me3Sn；而R8选自H、R、OH、OR、卤素、氨基、NHR、硝基、Me3Sn，其中R如上所定义，或者该化合物是二聚体，每个单体的公式都是(Ia)或(Ib)，其中单体的R8基团一起形成一个桥，其具有公式—X—R′—X—，连接单体，其中R′是含有3到12个碳原子的烷基链，该链可以被一个或多个杂原子和/或芳香环所中断，并且可以包含一个或多个碳-碳双键或三键，每个X独立地选自O、S或N；但是在化合物的公式(Ia)中，当A是单键时，R2不是CH═CH(CONH2)或CH═CH(CONMe2)。还公开了其他相关化合物。
• [EN] PYRROLOBENZODIAZEPINE DERIVATIVES, COMPOSITIONS COMPRISING THE SAME AND METHODS RELATED THERETO<br/>[FR] DERIVES DE PYRROLOBENZODIAZEPINE, COMPOSITIONS COMPRENANT CES DERIVES ET METHODES S'Y RAPPORTANT
  申请人：US GOV HEALTH & HUMAN SERV

  公开号：WO2005040170A3

  公开（公告）日：2005-06-30
• Pyrrolobenzodiazepines
  申请人：Spirogen Limited

  公开号：EP1193270B1

  公开（公告）日：2003-05-14
• Linker Length Modulates DNA Cross-Linking Reactivity and Cytotoxic Potency of C8/C8‘ Ether-Linked C2-<i>exo</i>-Unsaturated Pyrrolo[2,1-<i>c</i>][1,4]benzodiazepine (PBD) Dimers
  作者：Stephen J. Gregson、Philip W. Howard、Darren R. Gullick、Anzu Hamaguchi、Kathryn E. Corcoran、Natalie A. Brooks、John A. Hartley、Terence C. Jenkins、Sejal Patel、Matthew J. Guille、David E. Thurston

  DOI：10.1021/jm030897l

  日期：2004.2.1

  A C2/C2'-exo-unsaturated pyrrolo [2, 1-c] [1,4]benzodiazepine (PBD) dimer 4b (DRG-16) with a C8-O(CH2)(n)O-C8' diether linkage (n = 5) has been synthesized that shows markedly superior in vitro cytotoxic potency (e.g., > 3400-fold in IGROV1 ovarian cells) and interstrand DNA cross-linking reactivity (> 10-fold) compared to the shorter homologue 4a (SJG-136; n = 3). In contrast, for the C-ring unsubstituted series, the corresponding n = 5 dimer (3c) is generally less cytotoxic and has a lower interstrand cross-linking reactivity compared to its shorter n = 3 homologue (3a). Dimer 4b cross-links DNA with > 10-fold efficiency compared to 4a, and also inhibits the activity of the restriction endonuclease BamH1 more efficiently than either 3a or 4a. The C2-exo-unsaturated PBD dimers 4a,b are not only more effective than their C-ring saturated counterparts in terms of induced DeltaT(m) shift, but they also exert this effect more rapidly. Thus, while 3a and 3c exert 68 and 35% of their maximum effect immediately upon interaction with DNA, this level increases to 76 and 97% for 4a and 4b, respectively. Molecular modeling shows a rank order of 4b (n = 5) > 4a (n = 3) > 3a (n = 3) > 3c (n = 5) in terms of binding energy toward duplexes containing embedded target 5'-GAT(1-2)C cross-link sequences, reflecting the superior fit of the C2-exo-unsaturated rather than saturated C-rings of the PBD dimers. A novel synthesis of core synthetic building blocks for PBD dimers via stepwise Mitsunobu reaction and nitration with Cu(NO3)(2) is also reported.
• US7265105B2
  申请人：——

  公开号：US7265105B2

  公开（公告）日：2007-09-04