RP-thymidylyl-3',5'-thymidine phosphoromonothiolate | 83199-36-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （3'->5'）-二核苷酸和类似物
• 英文名称: RP-thymidylyl-3',5'-thymidine phosphoromonothiolate
• 英文别名: R_P-thymidylyl-3',5'-thymidine phosphoromonothiolate；thymidil-(3'-5')thymidyl O,O-phosphorothioate；(Rp)-TsT
• CAS: 83199-36-4
• 化学式: C₂₀H₂₇N₄O₁₁PS
• 分子量: 562.494
• InChiKey: BAYJGGZTPVYYDX-FVVIFKBQSA-N

物化性质

• 密度：
  1.62±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.93
• 重原子数：
  37.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  204.17
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  RP-thymidylyl-3',5'-thymidine phosphoromonothiolate 在 2,3,5-三甲基吡啶 、 水 、 氯化氰 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 胸苷酰(3'->5')胸苷铵盐
  参考文献：
  名称：

  The chemical synthesis of the RP and SP diastereomers of thymidyl(3′-5′)thymidyl 0,0-phosphorothioate

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)88727-4
• 作为产物：
  描述：

  在 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 作用下， 生成 RP-thymidylyl-3',5'-thymidine phosphoromonothiolate
  参考文献：
  名称：

  使用新型活化剂二烷基（氰甲基）四氟硼酸盐二核苷硫代磷酸酯的非对映控制合成

  摘要：

  一类新型的活化剂，二烷基（氰甲基）四氟硼酸铵 1a-c，已被开发并应用于非对映纯 5'-O-叔丁基二苯基甲硅烷基胸苷 3'-环状亚磷酰胺 3a-d 与 3'-O-叔-丁基二甲基甲硅烷基胸苷 (4a)。其中，3a 与 4a 在 1a 存在下的缩合在 5 分钟内完成，仅得到相应亚磷酸酯 5a 的一种非对映异构体。硫化和脱脂后，获得几乎非对映纯 (Rp)-TpsT 7 (dr = 99:1)。接下来合成了含有胸腺嘧啶、N6-苯甲酰腺嘌呤、N4-苯甲酰胞嘧啶和 N2-苯基乙酰鸟嘌呤的 5'-O-(DMTr) 核苷 3'-亚磷酰胺 8a-d，并允许与 3'-O-保护的胸苷和 2 '-脱氧腺苷。5'

  DOI：

  10.1021/ja017275e

文献信息

• Acylphosphonates
  作者：Mitsuo Fujii、Kouji Ozaki、Mitsuo Sekine、Tsujiaki Hata

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)81630-6

  日期：1987.1

  synthesized by a new method via dideoxyribonucleoside 2,2,2-trichloroethoxycarbonylphosphonates and aroylphosphonates. The conversion of dideoxyribonucleoside 2,2,2-trichloroethoxycarbonylphosphonates to dideoxyribonucleoside trimethylsilyl phosphites by treatment with Me3SiCl-Zn-acetylacetone proceeded with retention configuration at phosphorus. The silyl phosphite intermediates were converted to the phosphorothioates

  通过二脱氧核糖核苷2,2,2-三氯乙氧基羰基膦酸酯和芳酰基膦酸酯通过新方法合成了脱氧核糖核苷硫代磷酸酯。通过用Me 3 SiCl-Zn-乙酰丙酮处理，将双脱氧核糖核苷2,2,2-三氯乙氧基羰基膦酸酯转化为双脱氧核糖核苷三甲基甲硅烷基亚磷酸酯，在磷处具有保留构型。通过用硫原位处理将亚磷酸甲硅烷基酯中间体转化为硫代磷酸酯。通过n-BuNH 2的作用，很容易将芳酰基从8-11上除去，并通过单质硫处理原位转化为双脱氧核糖核苷硫代磷酸酯中的仅一种非对映异构体（Rp-构型）。
• Solid-Phase Synthesis of Stereoregular Oligodeoxyribonucleoside Phosphorothioates Using Bicyclic Oxazaphospholidine Derivatives as Monomer Units
  作者：Natsuhisa Oka、Mika Yamamoto、Terutoshi Sato、Takeshi Wada

  DOI：10.1021/ja805780u

  日期：2008.11.26

  Nucleoside 3'-O-bicylic oxazaphospholidine derivatives were designed as monomer units for a solid-phase synthesis of stereoregular oligodeoxyribonucleoside phosphorothioates (PS-ODNs). The trans-isomers of appropriately designed nucleoside 3'-O-bicyclic oxazaphospholidine derivatives were generated exclusively by the reaction between the 3'-OH of the corresponding protected nucleosides and 2-chloro-1

  核苷 3'-O-双环 oxazaphospholidine 衍生物被设计为单体单元，用于固相合成有规立构寡脱氧核糖核苷硫代磷酸酯 (PS-ODNs)。适当设计的核苷 3'-O-双环 oxazaphospholidine 衍生物的反式异构体仅通过相应受保护核苷的 3'-OH 与 2-氯-1,3,2-oxazaphospholidine 衍生物之间的反应生成。得到的反式-氧氮杂磷脂异构体在构型上是稳定的，在固体载体上缩合过程中，在酸性活化剂存在下差向异构化不会损害它们的非对映纯度。因此，通过使用氧氮杂磷脂单体和酸性活化剂形成 (Rp)- 和 (Sp)-硫代磷酸酯核苷酸间键的过程中，非对映纯度没有任何损失（非对映选择性 > 或 = 99:1）。此外，从头分子轨道计算表明，氧氮杂磷脂衍生物的差向异构化最有可能通过 N-质子化加速的边缘反转过程进行。计算不仅合理化了本研究中观察到的环结构与 oxazaphospholidines
• Studies on stereospecific formation of P-chiral internucleotide linkage. Synthesis of (RP,RP)- and (SP,SP)-thymidylyl(3′,5′)thymidylyl(3′,5′)thymidine di(O,O-phosphorothioate) using 2-nitrobenzyl group as a new s-protection
  作者：Z.J. Lesnikowski、M.M. Jaworska

  DOI：10.1016/s0040-4039(01)80667-5

  日期：1989.1

  (RP,RP)- and (SP,SP)-diastereomers of thymidylyl(3′,5′)thymidylyl(3′,5′)thymidine di (O,O-phosphorothioate () were prepared in the stereospecific reaction of (RP)- or (SP)-isomer of 5′-O-monomethoxytritylthymidine 3′-O-[O-(4-nitrophenyl)-S-(2-nitrobenzyl)phosphorothioate] () with 5′-OH activated 3′-O-acetylthymidine and subsequently with 5′-OH deprotected, 5′-OH activated derivative of resulted dinucleotide

  胸苷基（3'，5'）胸苷基（3'，5'）胸苷二（O，O-硫代磷酸酯（）的（R P，R P）-和（S P，S P）-非对映体5'-O-单甲氧基三苯甲基胸苷3'-O- [O- [O-（4-硝基苯基）-S-（2-硝基苄基）硫代磷酸酯]（）的（R P）-或（S P）-异构体与5'-的反应OH活化的3'-O-乙酰胸苷，随后与5'-OH脱保护的5'-OH活化的二核苷酸衍生物。
• Acylphosphonates. 5. 1A new method for stereospecific generation of phosphorothioate via aroylphosphonate intermediate
  作者：Mitsuo Fujii、Kouji Ozaki、Akiko Kume、Mitsuo Sekine、TsujiaKi Hata

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)84142-8

  日期：1986.1

  Dideoxynucleoside phosphorothioates were synthesized by a new method via dideoxynucleoside aroylphosphonates. The aroyl groups were easily removed from and 2 by the action of n-BuNH2 and in situ converted to only one diastereomer (Rp-configuration) of dideoxynucleoside phosphorothioates by treatment with elemental sulfur.

  脱氧核苷硫代磷酸酯是通过双脱氧核苷芳酰基膦酸酯通过新方法合成的。通过n-BuNH 2的作用，很容易从α2和α2中除去芳基，并通过用元素硫处理原位转化为双脱氧核苷硫代磷酸酯的仅一种非对映异构体（Rp-构型）。
• Use of 2,5-dichlorophenyl phosphorodichloridothioate in the synthesis of diastereoisomeric dinucleoside phosphorothioates
  作者：�znur Kemal、Colin B. Reese、Halina T. Serafinowska

  DOI：10.1039/c39830000591

  日期：——

  A convenient method for the synthesis, by the phosphotriester approach, of dinucleoside phosphorothioates is illustrated by the preparation and isolation of the pure Rp- and Sp-diastereoisomers of thymidine-3′ thymidine-5′ phosphorothioate (5).

  通过制备和分离胸苷-3'胸苷-5'硫代磷酸酯的纯R p-和S p-非对映异构体，说明了通过磷酸三酯方法合成二核苷硫代磷酸酯的简便方法（5）。